13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0022 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0022  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  369  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1353  hypothetical protein  64.25 
 
 
180 aa  251  4e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.086878 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  27.78 
 
 
183 aa  58.9  4e-08  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1610  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.5 
 
 
185 aa  53.1  2e-06  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3669  hypothetical protein  27.78 
 
 
185 aa  48.1  7e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0292536 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1164  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.84 
 
 
184 aa  48.1  7e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.23 
 
 
184 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2650  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.53 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.567158  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2495  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.97 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  24.03 
 
 
184 aa  45.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.26228e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1509  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  22.22 
 
 
187 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0220946  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  24.53 
 
 
207 aa  41.2  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.2 
 
 
183 aa  40.8  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>