143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0005 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0005  precorrin-6y C5,15-methyltransferase subunit CbiE  100 
 
 
238 aa  488  1e-137  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2361  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  31.36 
 
 
228 aa  115  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03743  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  30.49 
 
 
235 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.929331  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1857  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  28.51 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3459  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  30.26 
 
 
262 aa  92  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1003  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  29.1 
 
 
269 aa  87  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  29.41 
 
 
517 aa  78.6  9e-14  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0112  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  27.23 
 
 
227 aa  77  3e-13  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1528  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  25.46 
 
 
211 aa  74.7  1e-12  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00214205 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1010  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  28.92 
 
 
207 aa  72.4  6e-12  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0364  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  31.17 
 
 
208 aa  71.2  1e-11  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0392216  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0540  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  30.4 
 
 
228 aa  68.6  8e-11  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1855  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  25.78 
 
 
216 aa  68.2  1e-10  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1428  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.02 
 
 
240 aa  67.8  1e-10  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0114869  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1234  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.02 
 
 
240 aa  68.2  1e-10  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0777573  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1446  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  30.43 
 
 
208 aa  67  2e-10  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0473  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  28.32 
 
 
208 aa  65.5  7e-10  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.871662  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  30.41 
 
 
772 aa  63.2  3e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  30.41 
 
 
776 aa  62  7e-09  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2293  precorrin-3B C17-methyltransferase/conserved domain-containing protein  26.38 
 
 
458 aa  61.2  1e-08  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.671445  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0144  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  24.11 
 
 
464 aa  61.2  1e-08  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.856588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0310  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  26.24 
 
 
203 aa  60.8  2e-08  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  26.45 
 
 
663 aa  59.7  4e-08  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1226  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.65 
 
 
260 aa  59.7  4e-08  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.627427  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0623  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.89 
 
 
240 aa  59.7  4e-08  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0224111  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3502  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.14 
 
 
234 aa  58.9  6e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.38049e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.46 
 
 
612 aa  58.9  7e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0991  precorrin-3B C17-methyltransferase  25.99 
 
 
345 aa  58.5  1e-07  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0874  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  27.41 
 
 
206 aa  58.5  1e-07  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1714  precorrin-3 methyltransferase  23.45 
 
 
241 aa  57.4  2e-07  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0931  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  26.27 
 
 
423 aa  57.4  2e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421235 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0803  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  26.91 
 
 
403 aa  56.6  3e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1869  precorrin-3B C17-methyltransferase  24.29 
 
 
320 aa  56.2  4e-07  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.186861  normal  0.466196 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2153  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.23 
 
 
331 aa  56.2  4e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0918885 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2616  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.01 
 
 
596 aa  55.8  5e-07  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  28 
 
 
468 aa  55.8  6e-07  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0447  precorrin-3 C-17 methylase  28.68 
 
 
329 aa  55.8  6e-07  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0482  precorrin-3 C-17 methylase  28.68 
 
 
329 aa  55.8  6e-07  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2767  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  29.46 
 
 
331 aa  55.5  8e-07  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545278  normal  0.0717753 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1296  precorrin-3B C17-methyltransferase  26.55 
 
 
240 aa  54.7  1e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1549  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.68 
 
 
520 aa  54.3  1e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.21512e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1752  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.91 
 
 
264 aa  55.1  1e-06  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.57 
 
 
469 aa  54.3  2e-06  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  30 
 
 
623 aa  54.3  2e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0124  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.69 
 
 
481 aa  53.9  2e-06  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0704  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  27.78 
 
 
235 aa  53.9  2e-06  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.81 
 
 
451 aa  54.3  2e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  30 
 
 
623 aa  54.3  2e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0512  precorrin-3B C17-methyltransferase  26.64 
 
 
265 aa  53.5  3e-06  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.215708  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1525  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.81 
 
 
245 aa  52.8  5e-06  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00108788 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  27.17 
 
 
604 aa  52.8  5e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2995  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.39 
 
 
236 aa  52.8  5e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3128  precorrin-3 methyltransferase  27.82 
 
 
423 aa  52.4  6e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3473  precorrin-3B C17-methyltransferase  23.89 
 
 
331 aa  52.4  7e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1433  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  27.19 
 
 
203 aa  52  8e-06  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0756043  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.91 
 
 
629 aa  52  9e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0315  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.78 
 
 
243 aa  51.2  1e-05  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1239  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  27.19 
 
 
203 aa  51.6  1e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0474  precorrin-6B methylase 1  24.09 
 
 
214 aa  51.6  1e-05  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2863  precorrin-3 methyltransferase  27.69 
 
 
574 aa  50.4  2e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  24.71 
 
 
777 aa  50.4  2e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1344  precorrin-3B C17-methyltransferase  26.72 
 
 
435 aa  50.1  3e-05  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1296  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  28.77 
 
 
455 aa  50.1  3e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1014  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.32 
 
 
327 aa  49.7  4e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1300  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.56 
 
 
253 aa  49.7  4e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3744  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.38 
 
 
328 aa  48.5  8e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0629  precorrin-3B C17-methyltransferase  26.83 
 
 
266 aa  48.5  8e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0077  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.98 
 
 
329 aa  48.9  8e-05  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3474  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  27.72 
 
 
284 aa  48.5  9e-05  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0699  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  29.84 
 
 
195 aa  48.1  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0935  precorrin-3 methyltransferase  32.48 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0243766 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2709  precorrin-3B C17-methyltransferase  26.01 
 
 
236 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.424335  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2092  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  25.68 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.29 
 
 
631 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2813  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  24.62 
 
 
413 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.738025 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1089  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  23.77 
 
 
216 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.340083  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_78  tetrapyrrole methylase, precorrin-6Y C5,15-methyltransferase  22.13 
 
 
240 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3513  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  22.77 
 
 
408 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.462686 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2086  precorrin-3B C(17)-methyltransferase  24.14 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3213  precorrin-3B C17-methyltransferase  24.39 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1379  precorrin-6x reductase  27.94 
 
 
655 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  22.69 
 
 
600 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2657  precorrin-2 C20-methyltransferase, putative  25.13 
 
 
222 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  26.61 
 
 
472 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2356  precorrin-3 methyltransferase  25 
 
 
267 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0433914  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1685  precorrin-3 methyltransferase  28.57 
 
 
326 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.632291 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1282  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  26.05 
 
 
395 aa  47  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1080  precorrin-3 methyltransferase  25.58 
 
 
253 aa  46.6  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1077  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.28 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0618  bifunctional: precorrin-3 methyltransferase/precorrin-6X reductase oxidoreductase protein  23.63 
 
 
519 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157389  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1275  precorrin-3B C17-methyltransferase  23.96 
 
 
244 aa  46.2  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.158636  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1374  precorrin-3B C17-methyltransferase  25.15 
 
 
258 aa  45.8  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0554  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.65 
 
 
240 aa  45.4  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0240  tetrapyrrole methylase family protein  22.22 
 
 
240 aa  45.4  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2713  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  23.29 
 
 
208 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00369831  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0471  precorrin-3B methylase  30.25 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0049  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  25.62 
 
 
824 aa  45.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.749856  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  23.42 
 
 
576 aa  44.7  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1781  precorrin-3B C17-methyltransferase  26.11 
 
 
516 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629094  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1059  precorrin-4 methylase  26.56 
 
 
250 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0126824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>