79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0002 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0002  DNA polymerase II small subunit  100 
 
 
481 aa  987  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1005  DNA polymerase II small subunit  36.41 
 
 
674 aa  293  6e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2412  DNA polymerase II small subunit  34.47 
 
 
474 aa  281  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0659  DNA polymerase II small subunit  35.76 
 
 
487 aa  276  8e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.629258  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0409  DNA polymerase II small subunit  33.62 
 
 
467 aa  273  6e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.894742  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0004  DNA polymerase II small subunit  37.3 
 
 
471 aa  264  2e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0035  DNA polymerase II small subunit  33.05 
 
 
465 aa  262  8e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1166  DNA polymerase II small subunit  35.2 
 
 
640 aa  259  5e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0003  DNA polymerase II small subunit  35.47 
 
 
588 aa  259  9e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.626198 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1212  DNA polymerase II small subunit  34.61 
 
 
594 aa  257  4e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0004  DNA-directed DNA polymerase  35.44 
 
 
517 aa  254  3e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1005  DNA polymerase II small subunit  34.44 
 
 
578 aa  253  4e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0045  DNA polymerase II small subunit  33.74 
 
 
467 aa  253  6e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0941  DNA polymerase II small subunit  34.44 
 
 
584 aa  252  9e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1676  DNA polymerase II small subunit  34.18 
 
 
583 aa  252  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1933  DNA-directed DNA polymerase  34.62 
 
 
514 aa  250  5e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1610  DNA polymerase II small subunit  33.83 
 
 
537 aa  249  9e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0612  DNA-directed DNA polymerase  34.92 
 
 
466 aa  247  3e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0817  DNA-directed DNA polymerase  34.02 
 
 
527 aa  243  4e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0685678  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1882  metallophosphoesterase  23.05 
 
 
255 aa  58.2  3e-07  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0624812  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2308  metallophosphoesterase  24.33 
 
 
330 aa  58.5  3e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2186  metallophosphoesterase  25 
 
 
312 aa  58.5  3e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08316  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5597  metallophosphoesterase  23.68 
 
 
355 aa  57.4  6e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.524554 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2293  metallophosphoesterase  24.67 
 
 
312 aa  56.2  1e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1008  metallophosphoesterase  23.67 
 
 
312 aa  56.2  1e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0140335  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2270  metallophosphoesterase  24.67 
 
 
312 aa  56.2  1e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.599712  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1659  metallophosphoesterase  24.67 
 
 
312 aa  56.2  1e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2027  metallophosphoesterase  22.26 
 
 
315 aa  55.1  3e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0129825  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2244  metallophosphoesterase  22.26 
 
 
286 aa  54.7  4e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976084  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1338  metallophosphoesterase  22.79 
 
 
275 aa  53.9  7e-06  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.535328  normal  0.257841 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1040  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.38 
 
 
312 aa  53.5  8e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.269036  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40682  DNA polymerase delta small subunit (Hydroxyurea sensitive protein HYS2)  22.63 
 
 
487 aa  53.5  9e-06  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.642558  normal  0.422149 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00780  DNA polymerase Delta, small subunit, putative  29.37 
 
 
510 aa  53.1  1e-05  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.177257  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1993  metallophosphoesterase  23.24 
 
 
322 aa  52  2e-05  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.511822  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0632  metallophosphoesterase  23.14 
 
 
266 aa  52.4  2e-05  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0975218 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3619  metallophosphoesterase  23.08 
 
 
310 aa  52  3e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000151041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1323  metallophosphoesterase  22.05 
 
 
313 aa  52  3e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.219072 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2029  metallophosphoesterase  23.17 
 
 
286 aa  51.2  4e-05  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  9.78439e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1987  metallophosphoesterase  24.58 
 
 
280 aa  51.2  4e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.247789  normal  0.642917 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1600  metallophosphoesterase  20.23 
 
 
279 aa  51.2  4e-05  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1268  Ser/Thr protein phosphatase family protein  21.94 
 
 
312 aa  50.8  5e-05  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1854  Ser/Thr protein phosphatase family protein  21.94 
 
 
312 aa  50.8  5e-05  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1275  Ser/Thr protein phosphatase family protein  21.94 
 
 
312 aa  50.8  5e-05  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0391  Ser/Thr protein phosphatase family protein  21.94 
 
 
312 aa  50.8  5e-05  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1414  calcineurin-like phosphoesterase  21.94 
 
 
312 aa  50.8  5e-05  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0884568  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2198  metallophosphoesterase  22.46 
 
 
280 aa  50.8  5e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0687874 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0758  Ser/Thr protein phosphatase family protein  21.94 
 
 
312 aa  50.8  5e-05  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1108  Ser/Thr protein phosphatase family protein  21.94 
 
 
312 aa  50.8  5e-05  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129549  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3236  putative metallo-phosphoesterase  22.13 
 
 
313 aa  50.4  6e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.866208  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4942  metallophosphoesterase  22.48 
 
 
301 aa  50.1  8e-05  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2104  metallophosphoesterase  23.17 
 
 
288 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0267  metallophosphoesterase  22.8 
 
 
276 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.868219  normal  0.812156 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1203  metallophosphoesterase  21.22 
 
 
296 aa  49.3  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.652482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0941  metallophosphoesterase  22.89 
 
 
332 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460665  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1892  hypothetical protein  23.65 
 
 
286 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1122  metallophosphoesterase  21.22 
 
 
296 aa  48.9  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146328  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3012  hypothetical protein  20 
 
 
315 aa  49.3  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.905594  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1081  hypothetical protein  20.91 
 
 
309 aa  47.4  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.31705 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1557  metallophosphoesterase  22.65 
 
 
277 aa  47.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.118402  normal  0.0847897 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26670  predicted protein  21.18 
 
 
429 aa  47  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.506097  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0578  metallophosphoesterase  19.92 
 
 
325 aa  46.6  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.811544  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1794  metallophosphoesterase  22.76 
 
 
270 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2130  metallophosphoesterase  22.76 
 
 
270 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4655  metallophosphoesterase  19.92 
 
 
289 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1445  metallophosphoesterase  19.59 
 
 
266 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0245268  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1585  metallophosphoesterase  19.35 
 
 
268 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.910907  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4971  metallophosphoesterase  22.66 
 
 
290 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0704  metallophosphoesterase  21.58 
 
 
267 aa  45.8  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3671  metallophosphoesterase  23.24 
 
 
265 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.491584  normal  0.72335 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4491  metallophosphoesterase  23.27 
 
 
265 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1799  Ser/Thr protein phosphatase family protein  20.39 
 
 
273 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173881  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3595  metallophosphoesterase  20.39 
 
 
273 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2562  metallophosphoesterase  19.5 
 
 
280 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.628499  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1746  metallophosphoesterase  22.86 
 
 
270 aa  44.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22590  hypothetical protein  21.65 
 
 
270 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0224054  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2083  hypothetical protein  22.76 
 
 
314 aa  44.3  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1821  metallophosphoesterase  20.9 
 
 
273 aa  44.3  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177356  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0115  metallophosphoesterase  20.32 
 
 
270 aa  43.5  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1538  metallophosphoesterase  23.67 
 
 
273 aa  43.1  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>