More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4233 on replicon NC_013925
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
283 aa  584  1e-166  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  41.5 
 
 
313 aa  139  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  42.54 
 
 
406 aa  137  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  37.78 
 
 
313 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  39.04 
 
 
434 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  41.53 
 
 
446 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  37.26 
 
 
431 aa  129  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  40.31 
 
 
443 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  38.14 
 
 
415 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  38.14 
 
 
468 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  38.46 
 
 
334 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  37.91 
 
 
418 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  37.91 
 
 
418 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  35.47 
 
 
421 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  38.67 
 
 
308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  39.67 
 
 
361 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.87 
 
 
357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  38.12 
 
 
335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  36.46 
 
 
328 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  36.36 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  37.57 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  34.81 
 
 
335 aa  113  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.08 
 
 
431 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  35.57 
 
 
489 aa  113  4.0000000000000004e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.41 
 
 
387 aa  112  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  34.21 
 
 
508 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  34.93 
 
 
379 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  38.59 
 
 
323 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  32.21 
 
 
340 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.08 
 
 
415 aa  109  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  35.57 
 
 
385 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  35.56 
 
 
395 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  38.39 
 
 
313 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  39.46 
 
 
381 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  37.97 
 
 
440 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  37.97 
 
 
440 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  36.63 
 
 
446 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  35.23 
 
 
424 aa  106  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  34.92 
 
 
412 aa  105  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  36.14 
 
 
368 aa  104  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  35.75 
 
 
365 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  35.29 
 
 
500 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  35.47 
 
 
414 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  36.16 
 
 
389 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  35.2 
 
 
416 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  34.52 
 
 
313 aa  103  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  34.92 
 
 
406 aa  102  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  33.99 
 
 
370 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  33.98 
 
 
450 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  36.67 
 
 
319 aa  102  9e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  33.51 
 
 
325 aa  101  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  39.89 
 
 
345 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  34.81 
 
 
373 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  34.64 
 
 
374 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  31.36 
 
 
460 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.45 
 
 
405 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.29 
 
 
375 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  31.36 
 
 
460 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  34.78 
 
 
440 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  32.57 
 
 
364 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  35.23 
 
 
437 aa  100  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  36.36 
 
 
398 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  36.96 
 
 
438 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  33.5 
 
 
362 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  31.84 
 
 
454 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  35.33 
 
 
377 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  34.31 
 
 
362 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  32.04 
 
 
464 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  31.03 
 
 
465 aa  99.4  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.52 
 
 
451 aa  98.6  9e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.53 
 
 
362 aa  99  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  36.05 
 
 
349 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  32.04 
 
 
452 aa  98.2  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  31.16 
 
 
492 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  34.41 
 
 
438 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  34.55 
 
 
365 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  33.5 
 
 
657 aa  95.9  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  30.43 
 
 
727 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  33 
 
 
388 aa  95.1  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  36.11 
 
 
361 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  31.53 
 
 
423 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  36.02 
 
 
632 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  33.86 
 
 
320 aa  94.7  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  32.96 
 
 
348 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.06 
 
 
405 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  34.18 
 
 
488 aa  94  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  29.82 
 
 
402 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  35.8 
 
 
319 aa  93.2  4e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  35.23 
 
 
358 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  32.42 
 
 
390 aa  92.8  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  34.62 
 
 
312 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36050  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.11 
 
 
501 aa  92.4  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2652  DNA-cytosine methyltransferase  39.15 
 
 
435 aa  91.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0989832  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0938  DNA-cytosine methyltransferase  31.16 
 
 
355 aa  91.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  33.16 
 
 
400 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  28.14 
 
 
420 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  31.69 
 
 
423 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  30.65 
 
 
342 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  33.51 
 
 
399 aa  90.9  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1673  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 
366 aa  90.5  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>