225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4034 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_4034  LamB/YcsF family protein  100 
 
 
253 aa  513  1e-144  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1572  LamB/YcsF family protein  45.82 
 
 
270 aa  228  6e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  44.62 
 
 
257 aa  223  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  42.58 
 
 
255 aa  222  4e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  40.8 
 
 
253 aa  222  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  41.2 
 
 
253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  43.08 
 
 
256 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  40.4 
 
 
253 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  40 
 
 
253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  40 
 
 
253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5865  hypothetical protein  43.14 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  40 
 
 
253 aa  215  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  40.8 
 
 
253 aa  214  9e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  40.08 
 
 
253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  42.86 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  40.4 
 
 
254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  39.6 
 
 
253 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  42.11 
 
 
252 aa  209  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  39.36 
 
 
252 aa  207  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2435  hypothetical protein  41.02 
 
 
272 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.834577  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0005  hypothetical protein  42.68 
 
 
270 aa  206  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76896  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  39.92 
 
 
256 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  44.18 
 
 
252 aa  203  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0130  hypothetical protein  41.11 
 
 
275 aa  203  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1723  hypothetical protein  41.94 
 
 
266 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3259  hypothetical protein  40.71 
 
 
259 aa  202  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.990579  normal  0.190994 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0366  hypothetical protein  41.94 
 
 
266 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0274  hypothetical protein  41.94 
 
 
266 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06420  hypothetical protein  42.57 
 
 
252 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  37.5 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  37.5 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  38.82 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1880  hypothetical protein  41.53 
 
 
266 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0893  hypothetical protein  41.53 
 
 
266 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1179  hypothetical protein  41.53 
 
 
266 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2156  hypothetical protein  41.53 
 
 
266 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  41.2 
 
 
254 aa  198  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0595  hypothetical protein  42.17 
 
 
252 aa  197  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2936  LamB/YcsF family protein  42.8 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  46.49 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2920  hypothetical protein  40.89 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.9923  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  40.96 
 
 
254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  39.29 
 
 
258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2722  hypothetical protein  41.7 
 
 
251 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2862  hypothetical protein  41.3 
 
 
252 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191254  normal  0.477951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2118  hypothetical protein  41.27 
 
 
252 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624243  normal  0.300984 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  39.61 
 
 
251 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  40.65 
 
 
250 aa  195  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  36.33 
 
 
255 aa  195  7e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1029  LamB/YcsF family protein  42.08 
 
 
250 aa  194  8.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2481  hypothetical protein  40.39 
 
 
260 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  39.37 
 
 
254 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2026  LamB/YcsF family protein  42.51 
 
 
256 aa  193  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0388826 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0369  hypothetical protein  42.28 
 
 
260 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.244738  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  39.92 
 
 
253 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4577  hypothetical protein  40.55 
 
 
277 aa  191  8e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00594696  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2772  hypothetical protein  40.08 
 
 
252 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  37.45 
 
 
250 aa  190  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  37.45 
 
 
250 aa  190  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3547  LamB/YcsF family protein  38.43 
 
 
243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2385  hypothetical protein  41.04 
 
 
264 aa  189  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  39.29 
 
 
255 aa  188  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4098  LamB/YcsF family protein  41.67 
 
 
259 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6280  hypothetical protein  41.46 
 
 
260 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  42.52 
 
 
254 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  42.52 
 
 
254 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  42.52 
 
 
254 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2951  hypothetical protein  41.06 
 
 
260 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5650  LamB/YcsF family protein  38.49 
 
 
255 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  40.39 
 
 
304 aa  186  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  42.17 
 
 
257 aa  186  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4577  LamB/YcsF family protein  41.06 
 
 
258 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.701806  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0716  LamB/YcsF family protein  39.51 
 
 
246 aa  186  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0495612  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1341  LamB/YcsF family protein  39.29 
 
 
255 aa  185  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1312  LamB/YcsF family protein  40.83 
 
 
258 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174066  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1405  LamB/YcsF family protein  38.46 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  38.1 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  39.53 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  38.65 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0096  LamB/YcsF family protein  41.77 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000523388 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  41.22 
 
 
250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  38.8 
 
 
260 aa  183  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  39.13 
 
 
257 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  40 
 
 
255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  38.04 
 
 
256 aa  181  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  40.4 
 
 
254 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  40 
 
 
255 aa  180  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3877  LamB/YcsF family protein  40.57 
 
 
259 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.441072  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  39.13 
 
 
252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  39.68 
 
 
264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2788  LamB/YcsF family protein  38.4 
 
 
251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58540  hypothetical protein  40.16 
 
 
251 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27032  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  39.04 
 
 
255 aa  178  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  38.15 
 
 
253 aa  178  9e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05795  LamB/YcsF family protein  37.76 
 
 
251 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1829  LamB/YcsF family protein  38.02 
 
 
242 aa  177  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5125  hypothetical protein  39.92 
 
 
251 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  40.16 
 
 
301 aa  176  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  40.39 
 
 
299 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  0.0000126458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0099  LamB/YcsF family protein  40.56 
 
 
255 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>