More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3732 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3732  UspA domain protein  100 
 
 
152 aa  298  1e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.212348  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  40.94 
 
 
283 aa  99  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  40.97 
 
 
307 aa  94.4  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  43.51 
 
 
290 aa  94.4  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  39.29 
 
 
207 aa  91.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
145 aa  90.9  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
145 aa  90.5  8e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 
148 aa  88.2  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  36.43 
 
 
208 aa  87  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  38.78 
 
 
155 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  39.29 
 
 
180 aa  85.9  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  38.46 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  36.36 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  38.85 
 
 
300 aa  84.3  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  40 
 
 
159 aa  84  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  40.26 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  35.66 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  37.14 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.87 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  40.85 
 
 
415 aa  82  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  40.14 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  38.03 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  37.41 
 
 
280 aa  81.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  28.87 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  37.24 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  39.46 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  36.73 
 
 
156 aa  80.1  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.25 
 
 
149 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  38.3 
 
 
128 aa  80.1  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  39.44 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  39.74 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  34.51 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  39.39 
 
 
169 aa  79  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  36.43 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  38.51 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  35.86 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  34.25 
 
 
145 aa  77  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  34.97 
 
 
142 aa  77  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  42.14 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  35.66 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  36.96 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.43 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  39.57 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  38.46 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  35.42 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  34.72 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  27.86 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  29.86 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  36.81 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  40.97 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  36.18 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  34.29 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  39.31 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  31.54 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  36.17 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  35.57 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  38.03 
 
 
288 aa  72  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  37.76 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.03 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  33.33 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  32.21 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  28.67 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  39.58 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  29.58 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  30.41 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  35.37 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.16 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  34.25 
 
 
304 aa  70.5  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30.41 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  33.33 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  37.41 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  35.71 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  30.88 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  29.29 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  34.29 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  32.39 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  33.1 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  32.14 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  30.71 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  32.47 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  27.86 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>