101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3678 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013923  Nmag_3678  ribonuclease H  100 
 
 		 217 aa  427  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1544  ribonuclease H  82.03 
 
 		 217 aa  335  2.9999999999999997e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2875  ribonuclease H  60.73 
 
 		 220 aa  198  3.9999999999999996e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.542501 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  34.38 
 
 		 168 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  38.57 
 
 		 452 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  37.67 
 
 		 440 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  34.38 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  34.38 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  37.9 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.35 
 
 		 382 aa  65.1  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  35.61 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.66 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  35.16 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.88 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  34.69 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 370 aa  59.3  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  35.83 
 
 		 412 aa  58.5  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  35.46 
 
 		 383 aa  58.5  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  29.92 
 
 		 126 aa  57.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  35.45 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  41.76 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.58 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.11 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  28.97 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 		 401 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.09 
 
 		 369 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  34.35 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 366 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1321  ribonuclease H  41.03 
 
 		 132 aa  52.8  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00120412  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  37.38 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  30.25 
 
 		 134 aa  52  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 411 aa  52.4  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  29.01 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  36.09 
 
 		 132 aa  51.6  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  32.33 
 
 		 133 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  36.11 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  32.82 
 
 		 197 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  32.81 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  36.67 
 
 		 161 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  35.35 
 
 		 154 aa  49.7  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1024  ribonuclease H  32.61 
 
 		 154 aa  48.9  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226266  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0841  ribonuclease H  35 
 
 		 154 aa  48.5  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3655  ribonuclease H  29.17 
 
 		 151 aa  48.5  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499502  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1659  ribonuclease H  38.46 
 
 		 128 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3686  ribonuclease H  38.46 
 
 		 128 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1714  ribonuclease H  37.18 
 
 		 128 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461816  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1507  ribonuclease H  37.18 
 
 		 128 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1479  ribonuclease H  37.18 
 
 		 128 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.221091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1469  ribonuclease H  37.18 
 
 		 128 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.718462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1623  ribonuclease H  37.18 
 
 		 128 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.13 
 
 		 365 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.13 
 
 		 365 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.13 
 
 		 365 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.84 
 
 		 364 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 402 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1511  ribonuclease H  37.18 
 
 		 128 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1764  ribonuclease H  37.18 
 
 		 128 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1691  ribonuclease H  37.18 
 
 		 128 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  35.71 
 
 		 313 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 412 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  36.9 
 
 		 148 aa  46.2  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  35.71 
 
 		 147 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  35.71 
 
 		 147 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  35.71 
 
 		 147 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6404  ribonuclease H  43.1 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  38.1 
 
 		 147 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  38.1 
 
 		 147 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1682  ribonuclease H  36.08 
 
 		 254 aa  45.1  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240069  unclonable  0.00000212508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  30.14 
 
 		 160 aa  45.1  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  42.11 
 
 		 157 aa  45.1  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  35.71 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  35.71 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  35.71 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  35.71 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  35.71 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  35.71 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1985  ribonuclease H  36.92 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000102134  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  35 
 
 		 154 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1837  ribonuclease H  30.82 
 
 		 153 aa  44.3  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000470607  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  29.38 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  28.37 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  35.37 
 
 		 146 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0852  ribonuclease H  34.74 
 
 		 164 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  39.08 
 
 		 322 aa  43.5  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  35.71 
 
 		 148 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  34.52 
 
 		 147 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1479  RNase HI  31.33 
 
 		 151 aa  42.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00461786  normal  0.20485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2281  ribonuclease H  36.71 
 
 		 159 aa  42.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0246  ribonuclease H  32.91 
 
 		 149 aa  42.7  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1987  ribonuclease H  35.06 
 
 		 159 aa  42.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  35.9 
 
 		 151 aa  42.4  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  35 
 
 		 150 aa  42.7  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  37.18 
 
 		 145 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1351  ribonuclease H  44.44 
 
 		 152 aa  42.4  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  34.52 
 
 		 163 aa  42  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  35.8 
 
 		 154 aa  42  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  34.52 
 
 		 147 aa  42  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1188  ribonuclease H  29.05 
 
 		 157 aa  42  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364672  normal  0.693585 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0667  ribonuclease HI  35 
 
 		 151 aa  41.6  0.01  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.652902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>