More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3677 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  100 
 
 		 500 aa  979    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  61.52 
 
 		 498 aa  611  9.999999999999999e-175  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  59.12 
 
 		 499 aa  587  1e-166  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  54.65 
 
 		 485 aa  536  1e-151  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  49.71 
 
 		 518 aa  492  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  54.35 
 
 		 486 aa  488  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  52.59 
 
 		 490 aa  444  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  48.96 
 
 		 470 aa  403  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  41.99 
 
 		 554 aa  342  1e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  38.8 
 
 		 485 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  40.97 
 
 		 538 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  37.35 
 
 		 481 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  36.5 
 
 		 525 aa  273  4.0000000000000004e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  35.07 
 
 		 505 aa  270  5e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  34.34 
 
 		 454 aa  260  4e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  32.61 
 
 		 468 aa  249  8e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  33.4 
 
 		 500 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  32.75 
 
 		 500 aa  236  9e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  31.76 
 
 		 462 aa  227  3e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  30.4 
 
 		 460 aa  215  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  28.96 
 
 		 455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  31.91 
 
 		 477 aa  205  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  28.99 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  29.48 
 
 		 454 aa  194  4e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  30.49 
 
 		 460 aa  192  9e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  32.26 
 
 		 466 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  30.59 
 
 		 453 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 462 aa  183  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  28.76 
 
 		 469 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  28.14 
 
 		 469 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  27.95 
 
 		 496 aa  176  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  28.31 
 
 		 469 aa  176  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  28.11 
 
 		 469 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  28.11 
 
 		 469 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  27.29 
 
 		 492 aa  176  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  28.11 
 
 		 469 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 453 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  28.11 
 
 		 469 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  28.11 
 
 		 469 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  26.81 
 
 		 464 aa  173  7.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  28.29 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  29.19 
 
 		 452 aa  170  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  28.69 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  28.27 
 
 		 455 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 455 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  28.27 
 
 		 455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  27.57 
 
 		 469 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  27.57 
 
 		 469 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 445 aa  164  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 453 aa  163  8.000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 469 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  27.8 
 
 		 454 aa  162  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  28.76 
 
 		 452 aa  160  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  28.76 
 
 		 452 aa  159  8e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  28.42 
 
 		 455 aa  159  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 452 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  27.94 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  26.08 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 456 aa  157  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  27.44 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  27.94 
 
 		 469 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.13 
 
 		 475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  27.45 
 
 		 461 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  27.53 
 
 		 467 aa  154  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  27.58 
 
 		 453 aa  153  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  28 
 
 		 484 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  27.71 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  25.48 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 454 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  28.42 
 
 		 455 aa  152  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  24.22 
 
 		 475 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 458 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  25.37 
 
 		 455 aa  150  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 456 aa  150  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  28.04 
 
 		 480 aa  150  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.12 
 
 		 475 aa  149  8e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  24.26 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 448 aa  148  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 451 aa  147  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  24.79 
 
 		 461 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  23.98 
 
 		 475 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1708  MATE efflux family protein  29.58 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.52 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 459 aa  144  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 464 aa  143  8e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  24.09 
 
 		 453 aa  143  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 458 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2343  MATE efflux family protein  28.28 
 
 		 483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  24.84 
 
 		 448 aa  140  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  25.62 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  27.55 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 463 aa  136  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  26.41 
 
 		 477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  27.83 
 
 		 478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  24.84 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  25.05 
 
 		 467 aa  134  5e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>