87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3548 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_3548  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  100 
 
 		 349 aa  707    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  87.24 
 
 		 322 aa  531  1e-150  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  87.54 
 
 		 326 aa  526  1e-148  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  78.57 
 
 		 329 aa  515  1.0000000000000001e-145  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  77.43 
 
 		 323 aa  509  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1187  Transcription factor TFIIB cyclin-related  83.73 
 
 		 323 aa  500  1e-140  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0221286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  80.06 
 
 		 323 aa  497  1e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  81.23 
 
 		 326 aa  488  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3030  Transcription factor TFIIB cyclin-related  84.01 
 
 		 327 aa  487  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.628736  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  79.3 
 
 		 324 aa  485  1e-136  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  83.05 
 
 		 329 aa  481  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  75.39 
 
 		 330 aa  478  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  80.07 
 
 		 324 aa  468  9.999999999999999e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1513  Zinc finger TFIIB-type domain protein  80.34 
 
 		 333 aa  431  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1896  Transcription factor TFIIB cyclin-related  65.68 
 
 		 334 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  60.9 
 
 		 320 aa  382  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  61.94 
 
 		 317 aa  384  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  60.9 
 
 		 320 aa  384  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  62.93 
 
 		 321 aa  379  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  60.32 
 
 		 317 aa  373  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  59.42 
 
 		 321 aa  374  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  58.28 
 
 		 319 aa  369  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  57.23 
 
 		 333 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  54.17 
 
 		 337 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  54.31 
 
 		 334 aa  336  2.9999999999999997e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  54.82 
 
 		 337 aa  335  7e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  54.31 
 
 		 334 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.554084 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  52.04 
 
 		 340 aa  328  7e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  53.8 
 
 		 317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  53.38 
 
 		 318 aa  319  3.9999999999999996e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  52.3 
 
 		 337 aa  315  8e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  52.6 
 
 		 334 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  53.62 
 
 		 337 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  54.48 
 
 		 337 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  52.03 
 
 		 339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  52.03 
 
 		 339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  51.88 
 
 		 312 aa  312  4.999999999999999e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  51.69 
 
 		 339 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  51.69 
 
 		 339 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  51.69 
 
 		 339 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  51.69 
 
 		 339 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  51.69 
 
 		 339 aa  310  2e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  46.58 
 
 		 313 aa  289  5.0000000000000004e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  45.45 
 
 		 306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  43.15 
 
 		 302 aa  259  3e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.91 
 
 		 315 aa  252  6e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2209  transcription initiation factor IIB  45.67 
 
 		 305 aa  251  2e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000356449 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  40.2 
 
 		 301 aa  250  3e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  44.37 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  44.22 
 
 		 333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  43.1 
 
 		 331 aa  245  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  42.91 
 
 		 333 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  43.75 
 
 		 308 aa  241  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  45.97 
 
 		 331 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  43.65 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.01 
 
 		 306 aa  229  7e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  41.26 
 
 		 307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  38.31 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1047  Transcription factor TFIIB cyclin-related  41.78 
 
 		 286 aa  223  4e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0317  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  43.15 
 
 		 299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2168  Transcription factor TFIIB cyclin-related  41.81 
 
 		 290 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  42.41 
 
 		 330 aa  212  7e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  38.79 
 
 		 309 aa  209  5e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2197  Zinc finger TFIIB-type domain protein  41.31 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0013  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  37.23 
 
 		 306 aa  196  6e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0979  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  35.66 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0517  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  34.23 
 
 		 318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1341  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  34.56 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00144116 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1921  Zinc finger TFIIB-type domain protein  32.65 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235505  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1733  transcription initiation factor IIB  31.99 
 
 		 294 aa  152  7e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278852  normal  0.98163 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04928  transcription initiation protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10620)  27.67 
 
 		 351 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.381689 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43151  predicted protein  27.22 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85155  predicted protein  26.37 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1632  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  24.58 
 
 		 286 aa  95.5  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.178944 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01950  transcription initiation factor iib, putative  25.17 
 
 		 447 aa  91.7  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  29.22 
 
 		 298 aa  90.5  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36784  predicted protein  25 
 
 		 576 aa  79  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00059248  normal  0.0129799 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41529  predicted protein  25 
 
 		 576 aa  79  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.137974 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30925  predicted protein  24.83 
 
 		 601 aa  78.2  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338329  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1734  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  30.23 
 
 		 298 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.610707 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1743  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  27.69 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.744593  hitchhiker  0.000774381 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0374  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  26.19 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1563  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  30.26 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03116  transcription factor TFIIIB complex subunit Brf1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12730)  27.33 
 
 		 713 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0572721  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00660  transcription factor iiib 70 kd subunit, putative  19.93 
 
 		 691 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0502  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  39.62 
 
 		 102 aa  43.9  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.69095  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2469  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  40.82 
 
 		 102 aa  43.1  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>