More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3419 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_3419  MATE efflux family protein  100 
 
 		 504 aa  978    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3886  MATE efflux family protein  64.26 
 
 		 481 aa  617  1e-175  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0998  MATE efflux family protein  62.65 
 
 		 500 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4468  MATE efflux family protein  62.28 
 
 		 481 aa  571  1e-161  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0713709  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1672  MATE efflux family protein  59.2 
 
 		 498 aa  532  1e-150  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3236  MATE efflux family protein  54.2 
 
 		 502 aa  516  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3461  MATE efflux family protein  41.5 
 
 		 475 aa  312  6.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1498  MATE efflux family protein  43.04 
 
 		 478 aa  299  9e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  35.91 
 
 		 486 aa  250  5e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  35.71 
 
 		 498 aa  243  7.999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  29.15 
 
 		 475 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  27.16 
 
 		 469 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  29.91 
 
 		 475 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  26.92 
 
 		 438 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  26.57 
 
 		 485 aa  128  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  30.71 
 
 		 525 aa  127  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  29.06 
 
 		 467 aa  124  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  26.88 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  26.45 
 
 		 445 aa  120  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.86 
 
 		 485 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3674  MATE efflux family protein  29.1 
 
 		 473 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  29.9 
 
 		 445 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  28.61 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 554 aa  114  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  28.29 
 
 		 538 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  27.36 
 
 		 498 aa  110  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 459 aa  110  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  27.86 
 
 		 481 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 453 aa  109  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 445 aa  108  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  23.02 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.92 
 
 		 458 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1362  MATE efflux family protein  27.54 
 
 		 437 aa  104  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  24.31 
 
 		 484 aa  103  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  26.23 
 
 		 462 aa  103  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  24.31 
 
 		 484 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  24.31 
 
 		 547 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  24.31 
 
 		 495 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  24.12 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  24.31 
 
 		 547 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  24.31 
 
 		 546 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  24.31 
 
 		 495 aa  101  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  28.47 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  24.41 
 
 		 518 aa  100  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  24.07 
 
 		 546 aa  100  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 486 aa  100  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  23.93 
 
 		 446 aa  99.8  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 464 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  24.4 
 
 		 453 aa  99  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 434 aa  98.2  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  26.05 
 
 		 461 aa  97.8  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  22.09 
 
 		 448 aa  97.4  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 469 aa  97.4  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  24.84 
 
 		 460 aa  97.1  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 490 aa  96.7  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  27.49 
 
 		 459 aa  96.7  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  24.17 
 
 		 479 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  24.81 
 
 		 449 aa  95.5  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 468 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 461 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  24.21 
 
 		 455 aa  94  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 470 aa  94  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  22.93 
 
 		 446 aa  93.2  9e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  28.22 
 
 		 444 aa  92.8  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  28.21 
 
 		 483 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 468 aa  93.2  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 467 aa  92.8  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  29.46 
 
 		 442 aa  92.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 445 aa  92.4  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  25 
 
 		 454 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  22.54 
 
 		 450 aa  91.3  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  23.68 
 
 		 461 aa  90.9  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  25.16 
 
 		 474 aa  90.5  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  25.26 
 
 		 450 aa  90.5  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 454 aa  90.1  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3712  MATE efflux family protein  23.29 
 
 		 454 aa  89.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139203  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  26.16 
 
 		 463 aa  89.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  26.98 
 
 		 457 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  27.29 
 
 		 457 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  24.95 
 
 		 446 aa  88.6  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  25.88 
 
 		 500 aa  89  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  24.02 
 
 		 499 aa  88.2  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  22.06 
 
 		 454 aa  88.2  3e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  21.94 
 
 		 446 aa  88.6  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  25.72 
 
 		 460 aa  87.8  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  23.92 
 
 		 453 aa  87.4  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  23.09 
 
 		 451 aa  87.4  5e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  24.95 
 
 		 476 aa  87.8  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  24.95 
 
 		 474 aa  87.4  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  22.05 
 
 		 442 aa  87  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.75 
 
 		 460 aa  87  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  23.15 
 
 		 458 aa  87  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  22.91 
 
 		 458 aa  86.7  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  23.94 
 
 		 461 aa  86.7  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 469 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  24.03 
 
 		 477 aa  86.7  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  26.12 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  26.12 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>