More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3109 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2003  uracil-xanthine permease  75.32 
 
 
466 aa  673    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3109  uracil-xanthine permease  100 
 
 
470 aa  908    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.74503  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  57.96 
 
 
461 aa  476  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3473  uracil-xanthine permease  40.34 
 
 
479 aa  296  4e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179383  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1667  xanthine permease  39.73 
 
 
450 aa  291  2e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2606  uracil-xanthine permease  41.5 
 
 
478 aa  291  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.03048  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  36.52 
 
 
452 aa  275  9e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  36.3 
 
 
452 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3202  uracil permease  38.78 
 
 
474 aa  272  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324856  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  36.67 
 
 
451 aa  270  5e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1592  xanthine permease  37.21 
 
 
438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2522  xanthine permease  36.24 
 
 
449 aa  264  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140814  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0426  uracil-xanthine permease  34.97 
 
 
458 aa  257  3e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001868  xanthine/uracil permease family protein  36.19 
 
 
462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1222  xanthine permease  37.14 
 
 
462 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.622756  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1892  xanthine/uracil permease family protein  37.14 
 
 
462 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1231  xanthine permease  37.14 
 
 
462 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1376  xanthine/uracil permease family protein  36.81 
 
 
509 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.108395  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0349  xanthine/uracil permease family protein  37.14 
 
 
462 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0801  xanthine/uracil permease family protein  37.14 
 
 
462 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1066  xanthine/uracil permease family protein  37.14 
 
 
462 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1007  xanthine/uracil permease family protein subfamily  36.48 
 
 
462 aa  249  9e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3725  uracil-xanthine permease  35.67 
 
 
445 aa  247  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0234  uracil-xanthine permease  36.4 
 
 
487 aa  246  6.999999999999999e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.72868  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3915  xanthine permease  36.26 
 
 
462 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.53056 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3408  uracil-xanthine permease  36.26 
 
 
462 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  0.0616677 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2645  uracil-xanthine permease  34.48 
 
 
460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.84 
 
 
459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000668836  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1668  uracil-xanthine permease  35.41 
 
 
465 aa  243  7e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2284  xanthine/uracil permease family protein  34.34 
 
 
466 aa  242  7.999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0538  purine/xanthine transport protein  33.77 
 
 
453 aa  242  1e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3015  xanthine/uracil permease family protein  35.96 
 
 
466 aa  240  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2088  xanthine/uracil transporter  36.04 
 
 
462 aa  240  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.365471  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2762  uracil-xanthine permease  34.23 
 
 
500 aa  239  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.648328  normal  0.727682 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00623  hypothetical protein  35.6 
 
 
463 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0810  uracil-xanthine permease  35.96 
 
 
466 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4172  xanthine/uracil permease family protein  35.96 
 
 
466 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3042  xanthine/uracil permease family protein  35.96 
 
 
466 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3208  xanthine/uracil permease family protein  35.96 
 
 
466 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0826  uracil-xanthine permease  35.96 
 
 
466 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3521  xanthine permease  35.82 
 
 
462 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.964115  normal  0.563042 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4182  uracil-xanthine permease  34.51 
 
 
472 aa  239  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0034  xanthine permease  34.51 
 
 
461 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.830973  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4364  uracil-xanthine permease  35.82 
 
 
462 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4002  uracil-xanthine permease  35.82 
 
 
462 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02715  predicted transporter  35.74 
 
 
466 aa  237  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02677  hypothetical protein  35.74 
 
 
466 aa  237  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92624  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0039  xanthine permease  34.51 
 
 
461 aa  237  4e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  35.65 
 
 
452 aa  236  5.0000000000000005e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3597  xanthine permease  37.28 
 
 
459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.243938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3396  xanthine permease  37.36 
 
 
459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.559771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3698  uracil-xanthine permease  34.82 
 
 
458 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0073  uracil-xanthine permease  34.29 
 
 
464 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.134664  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3992  xanthine/uracil permease family protein  37.31 
 
 
459 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3953  uracil-xanthine permease  34.37 
 
 
462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1841  uracil-xanthine permease  37.61 
 
 
459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000895635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  36.38 
 
 
487 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0445  putative transporter  36.58 
 
 
461 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  36.61 
 
 
460 aa  232  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04610  putative transporter  36.74 
 
 
461 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3964  uracil-xanthine permease  33.78 
 
 
463 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3954  uracil-xanthine permease  33.78 
 
 
463 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4027  uracil-xanthine permease  33.78 
 
 
463 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4133  uracil-xanthine permease  33.78 
 
 
463 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.297531  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4873  uracil-xanthine permease  34.15 
 
 
466 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4073  uracil-xanthine permease  33.78 
 
 
463 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.853642 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0629  Xanthine/uracil permease  34.9 
 
 
454 aa  229  6e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0040794  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4854  xanthine permease  36.85 
 
 
497 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2573  xanthine/uracil permease  34.32 
 
 
488 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4497  uracil-xanthine permease  34.81 
 
 
462 aa  228  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4581  xanthine permease  34.58 
 
 
462 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4214  uracil-xanthine permease  34.22 
 
 
462 aa  226  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4150  uracil-xanthine permease  34.37 
 
 
462 aa  225  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3989  xanthine permease  34.15 
 
 
463 aa  224  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  37.5 
 
 
505 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4643  xanthine/uracil permease family protein  38.16 
 
 
505 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.422723 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4505  uracil-xanthine permease  38.16 
 
 
505 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552965  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  35.63 
 
 
431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1913  uracil-xanthine permease  32.84 
 
 
468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00677424  normal  0.0587093 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03512  predicted transporter  33.92 
 
 
463 aa  221  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.508451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0051  uracil-xanthine permease  33.92 
 
 
463 aa  221  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03464  hypothetical protein  33.92 
 
 
463 aa  221  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.514946  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4637  xanthine permease  37.47 
 
 
505 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  37.12 
 
 
503 aa  220  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4105  xanthine permease  33.92 
 
 
463 aa  221  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5027  xanthine permease  33.92 
 
 
463 aa  221  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3865  xanthine permease  33.92 
 
 
463 aa  221  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0057  uracil-xanthine permease  33.92 
 
 
463 aa  221  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0676705 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4158  xanthine permease  33.92 
 
 
463 aa  221  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1785  uracil-xanthine permease  35.56 
 
 
484 aa  219  6e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  34.14 
 
 
468 aa  219  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1300  uracil-xanthine permease  37.82 
 
 
493 aa  219  8.999999999999998e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2118  uracil-xanthine permease  37.16 
 
 
438 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.398858  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  37.85 
 
 
501 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1425  xanthine permease  33.55 
 
 
449 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000466476  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  33.02 
 
 
442 aa  217  4e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0068  xanthine permease  35.25 
 
 
422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1701  xanthine/uracil permease  35.1 
 
 
452 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226413  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  33.19 
 
 
455 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  33.19 
 
 
455 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>