More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3096 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  100 
 
 
207 aa  410  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  62.68 
 
 
208 aa  240  9e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  49.66 
 
 
152 aa  128  6e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  46.04 
 
 
144 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  48.18 
 
 
287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  43.38 
 
 
288 aa  112  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  44.93 
 
 
138 aa  111  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  43.71 
 
 
169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  45.99 
 
 
290 aa  109  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  44.06 
 
 
307 aa  107  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  44.68 
 
 
147 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  37.93 
 
 
150 aa  105  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  42.14 
 
 
142 aa  104  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  41.13 
 
 
180 aa  102  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  40.29 
 
 
281 aa  102  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  39.47 
 
 
153 aa  101  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  40 
 
 
145 aa  101  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  35.37 
 
 
155 aa  100  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  38.19 
 
 
150 aa  99.8  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  38.04 
 
 
301 aa  99.8  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  39.04 
 
 
149 aa  99  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  41.73 
 
 
280 aa  98.6  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  38.41 
 
 
156 aa  98.2  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  43.36 
 
 
283 aa  97.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  38.57 
 
 
144 aa  97.4  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  42.57 
 
 
301 aa  97.1  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  42.65 
 
 
286 aa  95.9  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.48 
 
 
150 aa  95.9  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  38.19 
 
 
151 aa  95.9  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  42.42 
 
 
136 aa  95.9  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  36.18 
 
 
156 aa  94.7  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  37.06 
 
 
148 aa  94.4  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  40.29 
 
 
156 aa  94  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  35.77 
 
 
152 aa  93.2  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  41.13 
 
 
300 aa  92  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  35.37 
 
 
149 aa  90.9  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
148 aa  90.5  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.99 
 
 
150 aa  90.1  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  39.55 
 
 
133 aa  89.4  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  40.88 
 
 
153 aa  89.4  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 
144 aa  89.4  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  43.26 
 
 
141 aa  89  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  35 
 
 
152 aa  89  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 
140 aa  89  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  36.81 
 
 
150 aa  87.8  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  42.96 
 
 
297 aa  87.8  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
145 aa  87.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
145 aa  87.8  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  29.86 
 
 
151 aa  87  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  38.06 
 
 
415 aa  86.7  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 
153 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  35.71 
 
 
159 aa  86.7  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  36.81 
 
 
158 aa  86.7  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  31.54 
 
 
156 aa  86.3  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  36.73 
 
 
152 aa  85.9  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  39.73 
 
 
305 aa  85.9  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
145 aa  85.5  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  33.57 
 
 
149 aa  84.7  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  32.14 
 
 
164 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  38.85 
 
 
144 aa  84.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  37.41 
 
 
159 aa  84  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  37.68 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
145 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  36.3 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  34.97 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  30.07 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  34.97 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  34.27 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  41.78 
 
 
151 aa  81.3  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  38.41 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4249  UspA domain protein  35.07 
 
 
133 aa  80.1  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  33.08 
 
 
128 aa  80.5  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  34.27 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  32.14 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  31.69 
 
 
141 aa  79  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  36.17 
 
 
146 aa  79  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  32.37 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1409  UspA domain protein  40.52 
 
 
118 aa  78.6  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.379594  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  32.37 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  37.59 
 
 
152 aa  77  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  28.57 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
145 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  33.33 
 
 
144 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  37.06 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  31.03 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  35.92 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  31.03 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  35.25 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  29.25 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
151 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 
147 aa  74.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  29.1 
 
 
128 aa  73.9  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>