More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2970 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  100 
 
 
393 aa  766    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  69.25 
 
 
395 aa  488  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  58.99 
 
 
395 aa  421  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  56.59 
 
 
399 aa  418  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  57.55 
 
 
388 aa  397  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1058  TrkA-N domain protein  40.22 
 
 
396 aa  211  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  35.1 
 
 
416 aa  137  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3564  voltage-gated potassium channel  30.03 
 
 
391 aa  134  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  30.61 
 
 
417 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1141  voltage-gated potassium channel  30.89 
 
 
391 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.378703  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1087  voltage-gated potassium channel  30.89 
 
 
391 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  30.61 
 
 
417 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  30.61 
 
 
417 aa  133  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  30.61 
 
 
417 aa  133  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  30.61 
 
 
417 aa  133  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  30.61 
 
 
417 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  30.61 
 
 
402 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  30.61 
 
 
402 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  30.3 
 
 
417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  32.25 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  32.25 
 
 
391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  32.25 
 
 
391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  32.25 
 
 
391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  32.53 
 
 
420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  32.53 
 
 
420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  31.92 
 
 
391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  28.29 
 
 
352 aa  116  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  30.77 
 
 
325 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  31.31 
 
 
335 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  31.31 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  29.91 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  30.42 
 
 
408 aa  110  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  30 
 
 
350 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  30.42 
 
 
438 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  33.84 
 
 
330 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  31.48 
 
 
337 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  32.68 
 
 
355 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  33.84 
 
 
330 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  28.64 
 
 
351 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  33.84 
 
 
334 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  33.84 
 
 
334 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  31.48 
 
 
333 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  31.06 
 
 
350 aa  106  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  33.33 
 
 
337 aa  106  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  33.33 
 
 
330 aa  106  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  30.64 
 
 
350 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  32.32 
 
 
330 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 
330 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 
336 aa  103  6e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  31.44 
 
 
356 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  30.62 
 
 
346 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  30.8 
 
 
341 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  31.44 
 
 
356 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  32.48 
 
 
366 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  30.24 
 
 
347 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  30.45 
 
 
350 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  28.93 
 
 
335 aa  101  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  31.6 
 
 
350 aa  99.8  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  29 
 
 
335 aa  99.4  9e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  32.43 
 
 
347 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  34.4 
 
 
350 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  28.02 
 
 
371 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  30.39 
 
 
338 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  29.74 
 
 
347 aa  97.1  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  28 
 
 
335 aa  96.7  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  32.24 
 
 
345 aa  96.3  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  30.94 
 
 
341 aa  96.3  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  29 
 
 
335 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  32.88 
 
 
384 aa  95.9  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  29.57 
 
 
331 aa  94.4  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  27.62 
 
 
509 aa  94.4  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  25.94 
 
 
346 aa  94  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  27.45 
 
 
354 aa  94  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  29.88 
 
 
332 aa  92.4  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  29.49 
 
 
332 aa  91.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  27.51 
 
 
351 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  31.73 
 
 
359 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  31.73 
 
 
359 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  31.73 
 
 
359 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  26.16 
 
 
324 aa  90.1  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  29.27 
 
 
366 aa  89.7  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  27.23 
 
 
332 aa  89.7  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 
341 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  28.04 
 
 
351 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  30.91 
 
 
368 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  30.05 
 
 
352 aa  89.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  28.04 
 
 
351 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  28.28 
 
 
531 aa  88.6  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  33.68 
 
 
457 aa  88.2  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  25.52 
 
 
355 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  28.04 
 
 
351 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  30.1 
 
 
359 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  28.02 
 
 
357 aa  87  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  29.39 
 
 
356 aa  86.7  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  29.76 
 
 
351 aa  86.3  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  26.11 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06820  K+ transport system, NAD-binding component  32.11 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.074637  normal  0.0591627 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  31.37 
 
 
366 aa  85.5  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  27.57 
 
 
339 aa  85.1  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  26.11 
 
 
346 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>