More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2707 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2707  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 549 aa  1113    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0744  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  59.35 
 
 		 537 aa  625  1e-178  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1322  preprotein translocase subunit SecD  44.03 
 
 		 546 aa  414  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.776168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2689  preprotein translocase subunit SecD  45.01 
 
 		 510 aa  409  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1964  preprotein translocase subunit SecD  47.62 
 
 		 529 aa  409  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.94592  normal  0.207837 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3176  preprotein translocase subunit SecD  33.93 
 
 		 484 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1656  preprotein translocase subunit SecD  34.42 
 
 		 485 aa  199  9e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00710078  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1023  preprotein translocase subunit SecD  33.66 
 
 		 507 aa  195  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1797  preprotein translocase subunit SecD  31.49 
 
 		 486 aa  183  6e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0601908  normal  0.730674 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0851  preprotein translocase subunit SecD  35.41 
 
 		 566 aa  182  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1017  preprotein translocase subunit SecD  43.72 
 
 		 391 aa  160  8e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.562711  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0895  preprotein translocase subunit SecD  28.34 
 
 		 558 aa  157  4e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.433485  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0836  preprotein translocase subunit SecD  43.22 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0771  preprotein translocase subunit SecD  42.5 
 
 		 388 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0052  preprotein translocase subunit SecD  42.71 
 
 		 388 aa  154  5e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1147  preprotein translocase subunit SecD  31.7 
 
 		 388 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0280  preprotein translocase subunit SecD  31.16 
 
 		 497 aa  150  8e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1987  preprotein translocase subunit SecD  35.41 
 
 		 564 aa  120  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000381338  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  24.36 
 
 		 531 aa  75.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  25.72 
 
 		 533 aa  73.9  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  23.64 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  24.21 
 
 		 843 aa  72.8  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  24.94 
 
 		 472 aa  72.4  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  24.25 
 
 		 535 aa  72.4  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  24.54 
 
 		 533 aa  71.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  23.84 
 
 		 532 aa  70.9  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  24.54 
 
 		 510 aa  70.5  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  26.52 
 
 		 534 aa  70.5  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  25.13 
 
 		 534 aa  70.1  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  24.43 
 
 		 525 aa  70.1  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  25.25 
 
 		 534 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  25.52 
 
 		 533 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  24.41 
 
 		 533 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  22.65 
 
 		 535 aa  69.3  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  28.77 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  25.65 
 
 		 526 aa  68.6  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  24.19 
 
 		 531 aa  68.6  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1240  protein translocase subunit  29.09 
 
 		 622 aa  68.2  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00253338  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  22.77 
 
 		 503 aa  68.2  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  28.09 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1291  protein-export membrane protein SecD  23.06 
 
 		 622 aa  67.4  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.00000000000000635694  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  25.06 
 
 		 554 aa  67.4  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  27.93 
 
 		 530 aa  67.4  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2113  protein-export membrane protein SecD  25.96 
 
 		 584 aa  67  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110466  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  23.9 
 
 		 533 aa  67  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0067  protein-export membrane protein SecD  30.1 
 
 		 465 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  24.94 
 
 		 529 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  25.7 
 
 		 521 aa  65.5  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1340  protein-export membrane protein SecD  31.28 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5142  preprotein translocase subunit SecD  30.45 
 
 		 680 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75892  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  24.76 
 
 		 526 aa  64.7  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  24.88 
 
 		 534 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  33.52 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3051  protein-export membrane protein SecD  28.63 
 
 		 684 aa  64.7  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0672  preprotein translocase subunit SecD  23.24 
 
 		 586 aa  64.3  0.000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0067  protein-export membrane protein SecD  30.1 
 
 		 465 aa  64.3  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  24.87 
 
 		 521 aa  64.3  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1373  preprotein translocase subunit SecD  30.77 
 
 		 607 aa  63.9  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.04 
 
 		 856 aa  63.5  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1621  protein-export membrane protein SecD  24.13 
 
 		 522 aa  63.9  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  25.18 
 
 		 594 aa  63.2  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  27.64 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  26.34 
 
 		 532 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  24.19 
 
 		 474 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  25.32 
 
 		 495 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  23.32 
 
 		 533 aa  62.4  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1905  protein-export membrane protein SecD  32.02 
 
 		 477 aa  62.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  24.24 
 
 		 619 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  24.46 
 
 		 614 aa  61.6  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  28.12 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000019832  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  27.2 
 
 		 489 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  23.91 
 
 		 468 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  23.79 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  27.11 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  23.75 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15100  protein-export membrane protein SecD  29.91 
 
 		 603 aa  61.6  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  24.94 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  27.64 
 
 		 496 aa  61.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  26.72 
 
 		 493 aa  61.2  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  23.62 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  24.59 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  27.14 
 
 		 496 aa  61.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  28.51 
 
 		 613 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  23.74 
 
 		 554 aa  60.8  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2527  preprotein translocase subunit SecD  23.91 
 
 		 681 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  28.51 
 
 		 613 aa  60.5  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2549  preprotein translocase subunit SecD  23.65 
 
 		 629 aa  60.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370381  normal  0.188242 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  23.19 
 
 		 473 aa  60.5  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  28.51 
 
 		 613 aa  60.1  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  27.78 
 
 		 501 aa  60.1  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  24.12 
 
 		 532 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3174  protein-export membrane protein SecD  27.73 
 
 		 566 aa  60.1  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.761403  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  24.82 
 
 		 461 aa  59.7  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  24.12 
 
 		 532 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.69 
 
 		 848 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  22.69 
 
 		 532 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  23.83 
 
 		 607 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1670  protein-export membrane protein SecD  24.78 
 
 		 635 aa  59.3  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  22.08 
 
 		 530 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  24.4 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>