More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2591 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  77.1 
 
 
481 aa  684    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  100 
 
 
525 aa  1030    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  52.83 
 
 
554 aa  499  1e-140  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  52.7 
 
 
538 aa  488  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  49.8 
 
 
485 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  41.42 
 
 
485 aa  360  3e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  41.94 
 
 
486 aa  335  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  37.63 
 
 
499 aa  325  2e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  39.84 
 
 
490 aa  319  1e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  37.15 
 
 
498 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  37.72 
 
 
518 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  40.42 
 
 
470 aa  300  4e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  35.15 
 
 
500 aa  289  8e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  36.48 
 
 
454 aa  280  5e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  35.97 
 
 
505 aa  276  5e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  33.73 
 
 
500 aa  259  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  33.64 
 
 
468 aa  254  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  33.2 
 
 
500 aa  245  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  31.17 
 
 
462 aa  243  5e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  28.17 
 
 
460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  28 
 
 
455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  30.63 
 
 
477 aa  196  6e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  29.37 
 
 
448 aa  194  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  25.27 
 
 
462 aa  189  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  29.13 
 
 
475 aa  187  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  29.48 
 
 
460 aa  186  8e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  28.26 
 
 
496 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  31.51 
 
 
445 aa  184  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  29.37 
 
 
467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  28.11 
 
 
451 aa  179  8e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  30.41 
 
 
464 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  27.92 
 
 
492 aa  170  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  28.17 
 
 
469 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  28.64 
 
 
469 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  29.63 
 
 
475 aa  166  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  27.49 
 
 
469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  27.49 
 
 
469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  27.49 
 
 
469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  26.6 
 
 
454 aa  166  1.0000000000000001e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.99 
 
 
461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  27.49 
 
 
469 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  28.17 
 
 
469 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  27.25 
 
 
469 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.46 
 
 
470 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  28.98 
 
 
461 aa  159  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  26.87 
 
 
469 aa  159  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  26.03 
 
 
453 aa  157  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  30.72 
 
 
466 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  27.73 
 
 
453 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  26.88 
 
 
462 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  28.15 
 
 
448 aa  155  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  29.13 
 
 
482 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  26.52 
 
 
456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  27.61 
 
 
469 aa  154  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  27.61 
 
 
469 aa  154  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  27.61 
 
 
453 aa  153  7e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  29.01 
 
 
458 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2343  MATE efflux family protein  32.32 
 
 
483 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.16 
 
 
458 aa  149  9e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  24.47 
 
 
453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  26.71 
 
 
475 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  29.44 
 
 
458 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  27.31 
 
 
438 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  27.98 
 
 
459 aa  146  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  26.49 
 
 
486 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  28.04 
 
 
464 aa  145  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  27.84 
 
 
463 aa  145  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  27.1 
 
 
463 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  28.13 
 
 
464 aa  144  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  25.99 
 
 
468 aa  145  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  27.02 
 
 
469 aa  143  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  26.77 
 
 
480 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  25.17 
 
 
475 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  26.39 
 
 
446 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  26.55 
 
 
454 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  27.42 
 
 
469 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  27.63 
 
 
453 aa  139  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  26.7 
 
 
469 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  24.4 
 
 
453 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  29.34 
 
 
503 aa  136  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  25.78 
 
 
460 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  28.73 
 
 
473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  28.48 
 
 
478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  26.38 
 
 
463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  25.32 
 
 
468 aa  133  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  26.92 
 
 
453 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  27.71 
 
 
454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  26.94 
 
 
521 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  27.31 
 
 
446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  28.35 
 
 
484 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  26.3 
 
 
451 aa  130  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  26.62 
 
 
443 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  28.15 
 
 
469 aa  130  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  28.19 
 
 
470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  29.05 
 
 
452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  29.62 
 
 
471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2100  MATE efflux family protein  31.32 
 
 
491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.114433 
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  30.7 
 
 
455 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  26.86 
 
 
494 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  27.73 
 
 
486 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>