More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2461 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  100 
 
 		 843 aa  1716    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  67.95 
 
 		 863 aa  1180    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  68.6 
 
 		 844 aa  1166    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  46.69 
 
 		 743 aa  640    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  88.51 
 
 		 827 aa  1506    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  67.47 
 
 		 864 aa  1174    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  44.8 
 
 		 744 aa  617  1e-175  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  45.26 
 
 		 771 aa  610  1e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  45.1 
 
 		 931 aa  595  1e-168  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  44.89 
 
 		 931 aa  569  1e-161  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  45.31 
 
 		 938 aa  571  1e-161  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  44.01 
 
 		 942 aa  556  1e-157  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  44.19 
 
 		 702 aa  548  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  43.88 
 
 		 935 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  38.3 
 
 		 747 aa  524  1e-147  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  36.12 
 
 		 837 aa  517  1.0000000000000001e-145  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  37.23 
 
 		 849 aa  514  1e-144  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  35.37 
 
 		 837 aa  502  1e-140  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  36.19 
 
 		 834 aa  498  1e-139  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  31.7 
 
 		 855 aa  394  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  30.28 
 
 		 780 aa  362  2e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  30.61 
 
 		 814 aa  328  3e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  30.61 
 
 		 814 aa  327  6e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  30.22 
 
 		 812 aa  321  3.9999999999999996e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  29.18 
 
 		 817 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  29.31 
 
 		 853 aa  315  2.9999999999999996e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  33.81 
 
 		 604 aa  303  1e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  32.14 
 
 		 631 aa  281  3e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  32.17 
 
 		 604 aa  280  6e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  30.59 
 
 		 602 aa  277  6e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  32.37 
 
 		 596 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  29.87 
 
 		 610 aa  258  3e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  28.78 
 
 		 697 aa  245  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  28.78 
 
 		 691 aa  244  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  29.31 
 
 		 859 aa  241  2.9999999999999997e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  29.34 
 
 		 743 aa  238  2e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  29.59 
 
 		 836 aa  238  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  27.33 
 
 		 700 aa  238  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  28.69 
 
 		 868 aa  238  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  29.31 
 
 		 869 aa  237  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  29.31 
 
 		 869 aa  237  8e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  28.09 
 
 		 751 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  29.31 
 
 		 869 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  29.42 
 
 		 869 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  27.21 
 
 		 700 aa  235  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1971  DNA topoisomerase I  28.74 
 
 		 883 aa  233  8.000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.819086  normal  0.697086 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  28.63 
 
 		 693 aa  233  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  29.23 
 
 		 876 aa  233  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  29.36 
 
 		 694 aa  233  1e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  28.46 
 
 		 851 aa  232  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  28.46 
 
 		 851 aa  232  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  27.19 
 
 		 693 aa  232  2e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2015  DNA topoisomerase I  28.48 
 
 		 866 aa  231  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00844458  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  28.96 
 
 		 693 aa  232  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  28.44 
 
 		 780 aa  231  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  27.4 
 
 		 759 aa  231  6e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  28.84 
 
 		 747 aa  231  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  28.95 
 
 		 768 aa  230  9e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  27.89 
 
 		 689 aa  229  1e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  27.97 
 
 		 756 aa  230  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2316  DNA topoisomerase I  28.23 
 
 		 866 aa  229  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105291  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  27.28 
 
 		 759 aa  229  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  29.16 
 
 		 870 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  28.28 
 
 		 758 aa  228  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  25.92 
 
 		 710 aa  227  6e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  28.8 
 
 		 868 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  28.8 
 
 		 868 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  27.09 
 
 		 695 aa  226  1e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1197  DNA topoisomerase I  29.41 
 
 		 899 aa  226  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1924  DNA topoisomerase I  28.36 
 
 		 868 aa  226  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34564  DNA topoisomerase  27.21 
 
 		 616 aa  225  3e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2657  DNA topoisomerase I  28.63 
 
 		 865 aa  225  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000104499  unclonable  0.0000000870588 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  26.58 
 
 		 783 aa  225  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02352  DNA topoisomerase I  29.14 
 
 		 886 aa  224  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.346512  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  27.79 
 
 		 841 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0914  DNA topoisomerase I  27.31 
 
 		 868 aa  224  4.9999999999999996e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  26.65 
 
 		 691 aa  223  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  26.65 
 
 		 691 aa  223  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2705  DNA topoisomerase I  29.06 
 
 		 878 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  28.9 
 
 		 760 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  28.17 
 
 		 765 aa  222  3e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  29.82 
 
 		 868 aa  222  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  27.26 
 
 		 853 aa  221  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  27.02 
 
 		 689 aa  221  6e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1560  DNA topoisomerase I  29.99 
 
 		 877 aa  220  7e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2196  DNA topoisomerase I  27.91 
 
 		 865 aa  220  7e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.735168  unclonable  0.00000487546 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  26.04 
 
 		 793 aa  220  8.999999999999998e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  28.12 
 
 		 691 aa  220  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  27.72 
 
 		 700 aa  220  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3867  DNA topoisomerase I  27.77 
 
 		 720 aa  220  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.442129 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2356  DNA topoisomerase I  27.52 
 
 		 879 aa  219  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0613436  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2304  DNA topoisomerase I  27.46 
 
 		 871 aa  220  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.926517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1729  DNA topoisomerase I  28.92 
 
 		 894 aa  219  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0724746 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2375  DNA topoisomerase I  27.9 
 
 		 865 aa  219  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000189026  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01260  hypothetical protein  27.9 
 
 		 865 aa  219  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.742047  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1383  DNA topoisomerase I  27.9 
 
 		 865 aa  219  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2033  DNA topoisomerase I  27.49 
 
 		 871 aa  219  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003948  DNA topoisomerase I  29.35 
 
 		 876 aa  219  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0644345  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01574  DNA topoisomerase I  29.32 
 
 		 876 aa  219  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2354  DNA topoisomerase I  27.9 
 
 		 865 aa  219  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.01053  unclonable  0.0000000472675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>