More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2252 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 263 aa  528  1e-149  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4019  transcriptional regulator, IclR family  53.91 
 
 		 258 aa  290  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  43.9 
 
 		 255 aa  208  8e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  43.72 
 
 		 255 aa  208  9e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  42.91 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  42.91 
 
 		 262 aa  202  6e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  43.2 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4139  transcriptional regulator, IclR family  43.53 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  40.24 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  41.63 
 
 		 256 aa  191  7e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  37.96 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0499  transcriptional regulator, IclR family  44.78 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  39.43 
 
 		 255 aa  188  5.999999999999999e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3665  transcriptional regulator, IclR family  38.4 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  41.46 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  40.64 
 
 		 257 aa  182  7e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  41.22 
 
 		 254 aa  179  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  40.98 
 
 		 255 aa  174  9e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  36.18 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  37.85 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  41.06 
 
 		 257 aa  172  5.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4730  transcriptional regulator, IclR family  37.25 
 
 		 268 aa  171  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3666  transcriptional regulator, IclR family  36.19 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4879  transcriptional regulator, IclR family  35.74 
 
 		 277 aa  168  9e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3940  transcriptional regulator, IclR family  41.87 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2238  transcriptional regulator, IclR family  36 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.399676  normal  0.216558 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2906  transcriptional regulator, IclR family  37.75 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  37.3 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4647  transcriptional regulator, IclR family  36.33 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4056  transcriptional regulator, IclR family  36.25 
 
 		 281 aa  161  8.000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  36.59 
 
 		 257 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  37.17 
 
 		 272 aa  159  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4759  transcriptional regulator, IclR family  35.25 
 
 		 256 aa  156  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.635938  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1075  transcriptional regulator, IclR family  33.08 
 
 		 266 aa  155  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  36.93 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  31.3 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  34.43 
 
 		 250 aa  148  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  30.49 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4669  transcriptional regulator, IclR family  36.44 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0947  transcriptional regulator, IclR family  34.82 
 
 		 258 aa  142  8e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.264338 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 		 256 aa  141  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3844  transcriptional regulator, IclR family  30.4 
 
 		 270 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  33.86 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  32.4 
 
 		 251 aa  135  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0101  transcriptional regulator, TrmB  36.9 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2861  transcriptional regulator, IclR family  36.8 
 
 		 248 aa  125  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  34.27 
 
 		 280 aa  122  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  34.6 
 
 		 248 aa  122  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  32.79 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  36.95 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  29.63 
 
 		 295 aa  112  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  28.33 
 
 		 273 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  33.76 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  28.7 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  30.67 
 
 		 263 aa  109  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  31.08 
 
 		 263 aa  108  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 281 aa  108  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 263 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  29.32 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  30.92 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  35.5 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.22 
 
 		 257 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  28.19 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  30.45 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  30.45 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 259 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  30.18 
 
 		 263 aa  105  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  29.81 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.49 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  29.49 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  29.49 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  29.49 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  29.49 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  29.49 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  34.26 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  29.49 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  35.55 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  28.52 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  28.11 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  29.49 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  29.71 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  29.78 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  29.49 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  29.49 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  29.49 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  29.49 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  31.3 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>