19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1933 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1933  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
514 aa  1053    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0004  DNA-directed DNA polymerase  80.3 
 
 
517 aa  868    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0817  DNA-directed DNA polymerase  69.35 
 
 
527 aa  764    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0685678  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1610  DNA polymerase II small subunit  67.23 
 
 
537 aa  700    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0003  DNA polymerase II small subunit  62.76 
 
 
588 aa  730    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.626198 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1005  DNA polymerase II small subunit  42 
 
 
674 aa  360  3e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2412  DNA polymerase II small subunit  39.11 
 
 
474 aa  350  3e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0409  DNA polymerase II small subunit  42 
 
 
467 aa  334  3e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.894742  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0045  DNA polymerase II small subunit  43.69 
 
 
467 aa  326  6e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1212  DNA polymerase II small subunit  41.22 
 
 
594 aa  324  3e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0035  DNA polymerase II small subunit  41.37 
 
 
465 aa  323  4e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0659  DNA polymerase II small subunit  34.9 
 
 
487 aa  317  3e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.629258  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1166  DNA polymerase II small subunit  40 
 
 
640 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1005  DNA polymerase II small subunit  42.13 
 
 
578 aa  311  2e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0941  DNA polymerase II small subunit  41.62 
 
 
584 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1676  DNA polymerase II small subunit  41.88 
 
 
583 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0004  DNA polymerase II small subunit  40.1 
 
 
471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0612  DNA-directed DNA polymerase  38.11 
 
 
466 aa  299  7e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0002  DNA polymerase II small subunit  34.62 
 
 
481 aa  250  6e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>