More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1877 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
367 aa  700    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.12 
 
 
340 aa  397  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.76 
 
 
335 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.69 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.91 
 
 
302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.3 
 
 
317 aa  207  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.37 
 
 
312 aa  202  9e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.2 
 
 
308 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.14 
 
 
315 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.74 
 
 
304 aa  192  9e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.31 
 
 
313 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.07 
 
 
306 aa  176  7e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.308341 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3137  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.26 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3540  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.91 
 
 
313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1533  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.72 
 
 
324 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  33.56 
 
 
297 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  30.21 
 
 
321 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  29.89 
 
 
304 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.82 
 
 
290 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  31.12 
 
 
317 aa  92  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  30.95 
 
 
343 aa  89.4  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.38 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  28.07 
 
 
303 aa  87  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  29.86 
 
 
299 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.61 
 
 
348 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  30.51 
 
 
321 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  30.82 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  30.34 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  28.38 
 
 
327 aa  84  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0771  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.39 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  29.08 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4261  hypothetical protein  31.25 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.87 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.67 
 
 
324 aa  82  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  29.12 
 
 
414 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  30 
 
 
293 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  32.34 
 
 
318 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  32.65 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.27 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  32.65 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  30 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  32.65 
 
 
294 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  32.65 
 
 
294 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  32.65 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  32.65 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  28.52 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  29.12 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.6 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.3 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  29.76 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  27.8 
 
 
324 aa  80.1  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1236  hypothetical protein  28.22 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000572189  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  29.12 
 
 
296 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  25.09 
 
 
312 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  30.94 
 
 
303 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  29.12 
 
 
296 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  29.15 
 
 
293 aa  79.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  29.12 
 
 
316 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  26.78 
 
 
306 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  29.12 
 
 
296 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  30.58 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  24.05 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.29 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5590  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.19 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0480903  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  32.41 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  29.12 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  29.12 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  26 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  27.42 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  31.56 
 
 
328 aa  77  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  25.33 
 
 
305 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  26.99 
 
 
290 aa  77  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2498  integral membrane protein  28.81 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  27.8 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  29.27 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  25.93 
 
 
305 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  24.48 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  28.17 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1245  putative permease  31.58 
 
 
310 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499311  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  25.93 
 
 
305 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  27.24 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.35 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  26.95 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  25.59 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  29.27 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  28.81 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3131  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.31 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  28.52 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  30.31 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  25.35 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  31.42 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  29.59 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  24.05 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  25.59 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  29.86 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  27.82 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  29.54 
 
 
335 aa  73.6  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.14 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>