247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1496 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 361 aa  731    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  85.79 
 
 		 362 aa  636    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  68.52 
 
 		 361 aa  495  1e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  69.17 
 
 		 369 aa  478  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  67.41 
 
 		 360 aa  462  1e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  31.04 
 
 		 399 aa  137  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  29.29 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  29.68 
 
 		 384 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  29.91 
 
 		 382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  31.97 
 
 		 385 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  30.73 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  32.1 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  29.64 
 
 		 416 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  29.66 
 
 		 386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  25.81 
 
 		 391 aa  106  5e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  29.67 
 
 		 408 aa  99.4  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  25.72 
 
 		 392 aa  94.7  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  26.09 
 
 		 392 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  25.77 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  27.93 
 
 		 386 aa  90.5  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  31.07 
 
 		 365 aa  90.1  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  26.53 
 
 		 395 aa  87.4  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 		 393 aa  86.7  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  24.6 
 
 		 390 aa  86.7  6e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  26.47 
 
 		 396 aa  86.3  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  27.35 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  24.18 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  24.92 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  29.93 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  24.43 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  30.36 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  29.11 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  23.67 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  28.33 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  30.12 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  28.65 
 
 		 407 aa  76.3  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  30.03 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  28.82 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  23.46 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  26.91 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  23.08 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  25.83 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  28 
 
 		 418 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  28.45 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  26.96 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  27.06 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  27.07 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  27.06 
 
 		 452 aa  69.7  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  27.51 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  25.8 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  26.32 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  27.09 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  27.95 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  24.92 
 
 		 380 aa  67  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  24.77 
 
 		 379 aa  67  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  26.55 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  23.96 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  27.19 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  26.62 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  26.95 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  26.53 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  26.32 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  26.85 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  21.7 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 410 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  30.86 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  25.81 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  25.51 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  24.6 
 
 		 552 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  31.21 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0732  hypothetical protein  25.48 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  28.85 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  26.35 
 
 		 373 aa  59.3  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  26.39 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2805  monooxygenase FAD-binding protein  32.8 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  24.23 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  27.35 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  24.06 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  24.43 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  28.36 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 458 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1405  monooxygenase FAD-binding  28.08 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.144812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  25.5 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2199  monooxygenase, FAD-binding  27.8 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  20.76 
 
 		 348 aa  57  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6230  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 499 aa  57  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994902  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  27.09 
 
 		 397 aa  57  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  26.35 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.62 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  26.57 
 
 		 443 aa  56.2  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  25.77 
 
 		 435 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  25.64 
 
 		 406 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  21.49 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>