24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1230 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1230  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 330 aa  634    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3257  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.44 
 
 		 269 aa  248  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0859  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.89 
 
 		 234 aa  123  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3142  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 219 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0451  ArsR family regulatory protein  46.56 
 
 		 219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.617366  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0738  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.86 
 
 		 415 aa  112  9e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0826  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.71 
 
 		 224 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2118  hypothetical protein  42.14 
 
 		 283 aa  96.7  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4075  transcriptional regulator, ArsR family  35.77 
 
 		 151 aa  92  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0843494  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2204  regulatory protein ArsR  39.58 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1706  regulatory protein ArsR  38.05 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1012  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.27626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1266  regulatory protein, ArsR  36.09 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234884 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1512  regulatory protein, ArsR  34.23 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395049  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0040  putative transcriptional regulator  34.4 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1549  putative transcriptional regulator  29.52 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.493713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1381  hypothetical protein  37.65 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.192324 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0064  putative transcriptional regulator  29.37 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.348632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1148  ArsR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 503 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.591964  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0472  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 239 aa  53.1  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3312  ArsR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 110 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 121 aa  46.2  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_27988  vesicle coat complex AP-3  30.77 
 
 		 1323 aa  43.9  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  38.89 
 
 		 285 aa  43.9  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>