More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0931 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0931  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, C subunit  100 
 
 
478 aa  996    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2960  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, C subunit  83.95 
 
 
448 aa  808    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1125  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  65.7 
 
 
499 aa  630  1e-179  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2518  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  67.35 
 
 
461 aa  631  1e-179  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1469  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  61.12 
 
 
459 aa  578  1e-164  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.789463  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2842  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  34.57 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000733482  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4113  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  34.37 
 
 
416 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.774885  normal  0.0186832 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3301  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  34.31 
 
 
415 aa  266  5.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0202  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  34.24 
 
 
399 aa  266  8e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0158986 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0202  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  33.99 
 
 
400 aa  263  6.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0069  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  33.58 
 
 
409 aa  260  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3955  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  33.58 
 
 
403 aa  257  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4146  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  33.33 
 
 
403 aa  254  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4561  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  33.56 
 
 
453 aa  253  4.0000000000000004e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0688  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  32.51 
 
 
413 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0250  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  33 
 
 
400 aa  252  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149174  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0229  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  32.93 
 
 
415 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2384  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  33 
 
 
396 aa  250  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02169  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase (anaerobic), small subunit  33 
 
 
396 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2526  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  33.42 
 
 
396 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02128  hypothetical protein  33 
 
 
396 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2514  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  33.42 
 
 
396 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.444575  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2471  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  33.42 
 
 
396 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.496093  normal  0.69733 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2395  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  33 
 
 
396 aa  250  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2422  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  33.42 
 
 
396 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2625  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  33 
 
 
396 aa  250  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2541  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  33 
 
 
396 aa  251  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0567  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  32.93 
 
 
431 aa  250  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1416  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, C subunit  33 
 
 
396 aa  250  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403336  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1408  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  33 
 
 
396 aa  250  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3380  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  33 
 
 
396 aa  250  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3989  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  33.41 
 
 
415 aa  250  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.379671  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0395  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  31.85 
 
 
424 aa  249  6e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2630  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  33.42 
 
 
396 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.484622 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2807  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  32.26 
 
 
396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.632443 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0514  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  31.02 
 
 
423 aa  236  6e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1019  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  32.09 
 
 
400 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1519  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  32.53 
 
 
409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.717289  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  33.43 
 
 
1055 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  33.06 
 
 
1070 aa  184  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  31.55 
 
 
1024 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.01 
 
 
1015 aa  172  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  32.74 
 
 
996 aa  167  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.98 
 
 
976 aa  163  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0812  hypothetical protein  29.11 
 
 
454 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0290283 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  29.57 
 
 
1023 aa  162  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0866  FAD linked oxidase domain protein  26.86 
 
 
1020 aa  159  8e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  30.06 
 
 
1032 aa  157  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3297  iron-sulfur cluster-binding protein  28.17 
 
 
421 aa  156  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.25 
 
 
978 aa  156  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0766  hypothetical protein  28.88 
 
 
455 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.34 
 
 
991 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.09 
 
 
1035 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0362  protein of unknown function DUF162  26.2 
 
 
738 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0813  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.74 
 
 
455 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  32.29 
 
 
1024 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0817  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.65 
 
 
455 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0048  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase (anaerobic), K-small subunit  26.05 
 
 
468 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.923386  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  30.85 
 
 
1014 aa  152  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.15 
 
 
1009 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.99 
 
 
962 aa  151  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2667  protein of unknown function DUF162  27.25 
 
 
727 aa  150  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1606  putative Fe-S oxidoreductase  24.94 
 
 
470 aa  147  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.822852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0649  hypothetical protein  27.65 
 
 
421 aa  147  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  26.56 
 
 
975 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.72 
 
 
1034 aa  146  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.22 
 
 
976 aa  146  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.97 
 
 
983 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.27 
 
 
968 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.22 
 
 
977 aa  144  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1846  putative ferredoxin  27.45 
 
 
443 aa  144  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000698817  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0898  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.65 
 
 
429 aa  143  8e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0836  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.26 
 
 
447 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000205692  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0525  hypothetical protein  26.93 
 
 
428 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000837043  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29 
 
 
1023 aa  140  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3246  hypothetical protein  26.64 
 
 
421 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000932954 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1372  hypothetical protein  26.89 
 
 
423 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000298572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.19 
 
 
434 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4115  Fe-S oxidoreductase-like protein  27.21 
 
 
445 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4691  protein of unknown function DUF162  27.2 
 
 
741 aa  136  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154904  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0576  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.54 
 
 
426 aa  136  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000399762 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3879  protein of unknown function DUF162  24.89 
 
 
741 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0271364  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0563  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.95 
 
 
426 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0987  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.98 
 
 
411 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.965573  hitchhiker  0.00212312 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3264  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26 
 
 
428 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.726047  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.27 
 
 
971 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3715  putative ferredoxin  24.94 
 
 
449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0539693  normal  0.153427 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  27.12 
 
 
973 aa  131  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1107  putative ferredoxin  24.76 
 
 
442 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0158261  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2307  hypothetical protein  25 
 
 
423 aa  130  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0419  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.82 
 
 
450 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2766  Fe-S oxidoreductase  26.59 
 
 
423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000181716  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.43 
 
 
395 aa  128  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  28.01 
 
 
952 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.46 
 
 
722 aa  126  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0539  hypothetical protein  26.54 
 
 
445 aa  126  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.835661  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  25.07 
 
 
967 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0039  hypothetical protein  27.11 
 
 
431 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157521 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  28.13 
 
 
1015 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2374  putative ferredoxin  25.46 
 
 
466 aa  124  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.790506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>