More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0534 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0534  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  100 
 
 
565 aa  1142    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1973  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  81.32 
 
 
572 aa  909    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0092  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  59.82 
 
 
561 aa  672    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.554485  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1115  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  55.28 
 
 
566 aa  529  1e-149  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2455  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.67 
 
 
562 aa  260  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521664  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  31.03 
 
 
554 aa  259  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  32.16 
 
 
545 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2750  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.03 
 
 
562 aa  252  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2527  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.03 
 
 
562 aa  252  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1617  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.97 
 
 
562 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2501  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.41 
 
 
658 aa  243  9e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79319  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.38 
 
 
568 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.88 
 
 
540 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  29.83 
 
 
589 aa  211  3e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.92 
 
 
536 aa  207  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1761  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.15 
 
 
559 aa  202  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15439  hitchhiker  0.00802646 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0714  benzoylformate decarboxylase  30.97 
 
 
536 aa  196  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0944  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  30.71 
 
 
527 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6157  benzoylformate decarboxylase  28.65 
 
 
537 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830904  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1542  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  30.69 
 
 
542 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1679  benzoylformate decarboxylase  30.02 
 
 
518 aa  190  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1999  benzoylformate decarboxylase  29.57 
 
 
529 aa  190  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.24 
 
 
499 aa  188  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5914  benzoylformate decarboxylase  29.77 
 
 
535 aa  187  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  29.67 
 
 
535 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2583  benzoylformate decarboxylase  29.49 
 
 
535 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380504  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2502  benzoylformate decarboxylase  29.88 
 
 
535 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.745207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1545  benzoylformate decarboxylase  29.31 
 
 
548 aa  184  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.936505  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3699  benzoylformate decarboxylase  29.42 
 
 
540 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637419  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2631  benzoylformate decarboxylase  29.7 
 
 
535 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1799  benzoylformate decarboxylase  28.55 
 
 
542 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.09 
 
 
542 aa  181  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0705  benzoylformate decarboxylase  30.3 
 
 
539 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214381  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1088  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.03 
 
 
533 aa  180  4.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.703546  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  29.65 
 
 
529 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.78 
 
 
551 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3938  benzoylformate decarboxylase  28.78 
 
 
540 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23105  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  28.67 
 
 
529 aa  174  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5047  benzoylformate decarboxylase  30.77 
 
 
533 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133347  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0887  benzoylformate decarboxylase  30.49 
 
 
539 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6666  benzoylformate decarboxylase  27.45 
 
 
540 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1048  benzoylformate decarboxylase  30.49 
 
 
539 aa  171  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5624  benzoylformate decarboxylase  29.86 
 
 
549 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64770  benzoylformate decarboxylase  30.22 
 
 
528 aa  171  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.819611  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2776  benzoylformate decarboxylase  28.14 
 
 
535 aa  169  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0346  benzoylformate decarboxylase  30.31 
 
 
539 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0093  benzoylformate decarboxylase  30.31 
 
 
539 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0890  benzoylformate decarboxylase  30.31 
 
 
539 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0645  benzoylformate decarboxylase  30.31 
 
 
539 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0521172  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2480  benzoylformate decarboxylase  30.31 
 
 
539 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.20481  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  29.75 
 
 
528 aa  168  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  28.94 
 
 
578 aa  167  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1851  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.93 
 
 
566 aa  158  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.9 
 
 
554 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  30.31 
 
 
528 aa  156  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.87 
 
 
561 aa  154  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  29.9 
 
 
576 aa  151  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  25.65 
 
 
587 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.52 
 
 
563 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  25.26 
 
 
587 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.48 
 
 
565 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0609  acetolactate synthase, large subunit  26.42 
 
 
584 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0318526  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.27 
 
 
588 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0639  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.89 
 
 
593 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0915985  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.13 
 
 
564 aa  147  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.4 
 
 
552 aa  147  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  23.67 
 
 
599 aa  147  6e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1108  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.22 
 
 
489 aa  145  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0811747  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0137  benzoylformate decarboxylase  26.99 
 
 
525 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.1 
 
 
557 aa  145  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.94 
 
 
555 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  27.07 
 
 
567 aa  143  8e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  25.64 
 
 
566 aa  141  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.56 
 
 
596 aa  141  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.11 
 
 
569 aa  141  3e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.65 
 
 
554 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3009  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.53 
 
 
585 aa  140  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161058 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  25.39 
 
 
572 aa  139  8.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  24.78 
 
 
587 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2758  thiamine pyrophosphate protein central region  27.85 
 
 
540 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26 
 
 
562 aa  139  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  24.96 
 
 
555 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1488  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.68 
 
 
600 aa  139  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3236  acetolactate synthase III, large subunit, biosynthetic type  25.09 
 
 
575 aa  138  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00702842  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.51 
 
 
553 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26 
 
 
559 aa  137  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  23.69 
 
 
587 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.6 
 
 
584 aa  137  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.32 
 
 
575 aa  137  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0147  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  26.39 
 
 
558 aa  137  8e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.32 
 
 
575 aa  137  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.92 
 
 
558 aa  136  8e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.99 
 
 
582 aa  136  9e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0128  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.11 
 
 
584 aa  136  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.32 
 
 
593 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3455  glyoxylate carboligase  25.53 
 
 
577 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0174  acetolactate synthase, large subunit  24.82 
 
 
544 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.936487  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0125  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.81 
 
 
584 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0127  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.6 
 
 
584 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.53134  hitchhiker  0.000772873 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.37 
 
 
604 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>