46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0530 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  100 
 
 
442 aa  881    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  22.32 
 
 
421 aa  97.1  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  24.2 
 
 
424 aa  87.4  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  24.47 
 
 
425 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  22.96 
 
 
421 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  24.22 
 
 
453 aa  77.8  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  22.8 
 
 
422 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  24.79 
 
 
433 aa  77.8  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  25.53 
 
 
418 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  23.48 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  25.23 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  20.87 
 
 
437 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  20.87 
 
 
437 aa  73.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  24.03 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  22.47 
 
 
421 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  22.41 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  23.59 
 
 
424 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1109  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  24.78 
 
 
428 aa  69.7  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  22.91 
 
 
421 aa  69.3  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1312  manganese transporter NRAMP  24.78 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000976334  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  23.59 
 
 
424 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  23.33 
 
 
424 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  23.59 
 
 
424 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  23.33 
 
 
424 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  24.86 
 
 
419 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  23.02 
 
 
427 aa  65.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  22.94 
 
 
428 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3183  putative manganese transporter  24.32 
 
 
382 aa  64.7  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  23.14 
 
 
436 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  23.19 
 
 
428 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  24.08 
 
 
420 aa  63.2  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  22.73 
 
 
468 aa  60.1  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2529  putative putative integral membrane protein  21.79 
 
 
431 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.656474  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  23.7 
 
 
415 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2179  putative putative integral membrane protein  23.01 
 
 
460 aa  55.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  22.66 
 
 
434 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  23.94 
 
 
423 aa  52.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  22.66 
 
 
434 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  20.38 
 
 
435 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1193  manganese transporter NRAMP  24.23 
 
 
421 aa  50.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1669  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 
659 aa  50.4  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3895  hitchhiker  0.0000000000177402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  23.32 
 
 
433 aa  47.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3404  hypothetical protein  22.52 
 
 
508 aa  47  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4143  Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family- like protein  24.07 
 
 
440 aa  46.6  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  25.75 
 
 
427 aa  45.8  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  21.5 
 
 
433 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>