More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0449 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0449  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
257 aa  523  1e-147  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.237578  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2534  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.02 
 
 
247 aa  358  6e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.5 
 
 
238 aa  202  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136725 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.81 
 
 
238 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0366896 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
249 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
249 aa  168  6e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000668025  hitchhiker  0.00000185563 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2872  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.72 
 
 
222 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0083444  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1674  short chain dehydrogenase family protein  35.04 
 
 
247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
260 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  hitchhiker  0.000000443735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000108179  normal  0.0377265 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
255 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00108636  hitchhiker  0.000219096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2774  short chain dehydrogenase family protein  34.19 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  hitchhiker  0.000224975 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
256 aa  132  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 
257 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0573631  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0183678  normal  0.814955 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0978937  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000349992  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0264369  hitchhiker  0.0000000000470617 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
255 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0196374  unclonable  0.0000000191957 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1372  short chain dehydrogenase family protein  32.77 
 
 
274 aa  122  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0570365 
 
 
-
 
NC_002950  PG1221  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.77 
 
 
241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.810471 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1335  short chain dehydrogenase family protein  30.77 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00551908  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2452  short chain dehydrogenase  35.18 
 
 
250 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4881  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 
249 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.968651 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0117  short chain dehydrogenase  30.71 
 
 
250 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0469  short chain dehydrogenase  30.4 
 
 
292 aa  106  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1853  short chain dehydrogenase  33.06 
 
 
249 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.787999  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 
245 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.15 
 
 
244 aa  101  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1188  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 
291 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0152839  normal  0.145128 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2785  short chain dehydrogenase  32.8 
 
 
254 aa  99.8  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 
246 aa  98.6  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0885  short chain dehydrogenase  30 
 
 
250 aa  97.1  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2218  short chain dehydrogenase  28.46 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
248 aa  95.9  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1201  short chain dehydrogenase  29.6 
 
 
289 aa  95.9  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0718298  normal  0.0224844 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
247 aa  95.5  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.05 
 
 
242 aa  95.1  9e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  29.6 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3863  short chain dehydrogenase  32.53 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331172  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10962  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 
253 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.247015 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4715  short chain dehydrogenase  31.89 
 
 
249 aa  92  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4335  short chain dehydrogenase  30.83 
 
 
249 aa  92  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0693718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4421  short chain dehydrogenase  30.83 
 
 
249 aa  92  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.77 
 
 
230 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13470  short chain dehydrogenase  28.74 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0085  gluconate 5-dehydrogenase  30.51 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  25.81 
 
 
243 aa  89.4  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  28.92 
 
 
243 aa  89.4  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
273 aa  89  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  28.29 
 
 
245 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.85 
 
 
248 aa  88.6  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 
251 aa  87.8  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0363598  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0632  short chain dehydrogenase  28.85 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 
271 aa  87  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3014  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  28.79 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.698047  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38500  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  30.74 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 
261 aa  87.8  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.15 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0959  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
262 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4248  short chain dehydrogenase  34.39 
 
 
259 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.15 
 
 
256 aa  86.3  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292404 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06330  oxidoreductase  30.57 
 
 
243 aa  86.3  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.646831  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1841  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.19 
 
 
250 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.51 
 
 
262 aa  85.5  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.85 
 
 
260 aa  85.5  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  31.15 
 
 
256 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
238 aa  85.5  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  35.9 
 
 
247 aa  85.5  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0470  short chain dehydrogenase  32.94 
 
 
259 aa  85.1  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  29.13 
 
 
246 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.1 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.980517  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5291  short chain dehydrogenase  33.06 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6265  short chain dehydrogenase  32 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.59 
 
 
272 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0427  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 
271 aa  84  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.35 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  25.2 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  28 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0087  short chain dehydrogenase  30.86 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0589  short chain dehydrogenase  30.86 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2288  short chain dehydrogenase  30.86 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2000  short chain dehydrogenase  30.86 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0407  short chain dehydrogenase  30.86 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317505  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3096  short chain dehydrogenase  30.86 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6048  short chain dehydrogenase  32.16 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.93 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0795693 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1086  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  30.89 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.144372  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  29.48 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0130  short chain dehydrogenase  31.98 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727225  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1976  3-hydroxy acid dehydrogenase  29.26 
 
 
249 aa  82  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>