More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0398 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0398  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
425 aa  818    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0034127  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  57.48 
 
 
393 aa  410  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  59.53 
 
 
345 aa  376  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  37.91 
 
 
339 aa  199  9e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  36.5 
 
 
346 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  31.73 
 
 
370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  35.78 
 
 
339 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  33.72 
 
 
365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  30.45 
 
 
384 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  31.93 
 
 
353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  31.29 
 
 
360 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  28.65 
 
 
387 aa  126  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  30.61 
 
 
358 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  27.22 
 
 
394 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  28.53 
 
 
365 aa  123  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  29.91 
 
 
352 aa  123  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  31.45 
 
 
351 aa  123  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  30.22 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  33.24 
 
 
371 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1111  protein of unknown function UPF0118  34.07 
 
 
381 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  30.94 
 
 
352 aa  122  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  30.22 
 
 
352 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  30.22 
 
 
352 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  30.22 
 
 
352 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  30.22 
 
 
352 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  30.22 
 
 
352 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  30.22 
 
 
352 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  32.83 
 
 
349 aa  120  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  29.53 
 
 
363 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  31.63 
 
 
398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  29.55 
 
 
356 aa  117  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  28.57 
 
 
356 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  31.63 
 
 
355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  28.71 
 
 
346 aa  116  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  31.63 
 
 
350 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  31.63 
 
 
353 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  31.33 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  29.66 
 
 
352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  28.79 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  28.09 
 
 
353 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  30.53 
 
 
352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  28.35 
 
 
360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  30.34 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  36.08 
 
 
353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  31.83 
 
 
353 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  29.91 
 
 
361 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  29.13 
 
 
354 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  28.21 
 
 
354 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  28.8 
 
 
354 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  30.51 
 
 
350 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  30.52 
 
 
354 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  27.42 
 
 
354 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  23.58 
 
 
393 aa  108  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  27.16 
 
 
352 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  29.55 
 
 
354 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  27.38 
 
 
352 aa  106  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  26.61 
 
 
355 aa  106  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  30.21 
 
 
362 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  25.08 
 
 
371 aa  99.4  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  30.67 
 
 
359 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  27.01 
 
 
373 aa  97.8  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  30.88 
 
 
350 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  30.77 
 
 
358 aa  97.1  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3181  hypothetical protein  31.68 
 
 
419 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423402  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  31.25 
 
 
415 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0792  protein of unknown function UPF0118  30.89 
 
 
344 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  26.54 
 
 
389 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  26.67 
 
 
363 aa  94.7  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  28.43 
 
 
369 aa  94.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  31.22 
 
 
359 aa  94.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  31.36 
 
 
348 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  28.44 
 
 
398 aa  93.2  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  28.99 
 
 
379 aa  93.2  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  25.65 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  23.56 
 
 
391 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  25.95 
 
 
355 aa  90.9  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  30.62 
 
 
397 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  31.86 
 
 
350 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0785  hypothetical protein  32.62 
 
 
363 aa  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0785663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  31.96 
 
 
354 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  24.43 
 
 
372 aa  89  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  27.93 
 
 
392 aa  88.6  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  24.43 
 
 
352 aa  88.2  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  31.66 
 
 
349 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  26.79 
 
 
423 aa  86.7  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  24.69 
 
 
345 aa  86.7  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  24.92 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  28.96 
 
 
346 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  30.2 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2764  hypothetical protein  24.93 
 
 
346 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327799  normal  0.0566584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2069  hypothetical protein  26.65 
 
 
391 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0264155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  29.03 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  29.38 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1711  hypothetical protein  25.71 
 
 
336 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  32.11 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  27.65 
 
 
367 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  25.16 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  27.06 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  22.87 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  31.73 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>