More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0330 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  40.35 
 
 
873 aa  673    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  42.03 
 
 
871 aa  662    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  38.94 
 
 
867 aa  660    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
917 aa  1823    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  42.56 
 
 
932 aa  658    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  40.41 
 
 
896 aa  685    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  41.69 
 
 
872 aa  650    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  79.76 
 
 
893 aa  1380    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  61.59 
 
 
865 aa  1025    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  42.02 
 
 
868 aa  678    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  42.24 
 
 
872 aa  654    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  41.38 
 
 
869 aa  653    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  40.41 
 
 
869 aa  648    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  41 
 
 
870 aa  686    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  52.91 
 
 
956 aa  871    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  61.66 
 
 
918 aa  1053    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  40.95 
 
 
870 aa  633  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  44.3 
 
 
848 aa  629  1e-179  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  37.75 
 
 
863 aa  631  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  39.25 
 
 
887 aa  631  1e-179  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  41.04 
 
 
872 aa  630  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  39.52 
 
 
903 aa  627  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  42.97 
 
 
865 aa  628  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0434  DNA mismatch repair protein MutS  42.94 
 
 
853 aa  626  1e-178  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0558205  normal  0.0590484 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  43 
 
 
882 aa  626  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  40.2 
 
 
870 aa  628  1e-178  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  38.39 
 
 
853 aa  624  1e-177  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  39.15 
 
 
860 aa  620  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  40.64 
 
 
900 aa  617  1e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  38.81 
 
 
897 aa  617  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  38.22 
 
 
910 aa  617  1e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  39.85 
 
 
859 aa  617  1e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  39.83 
 
 
889 aa  617  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  38.03 
 
 
910 aa  615  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  37.57 
 
 
881 aa  611  1e-173  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  35.62 
 
 
872 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  35.62 
 
 
872 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  38.88 
 
 
857 aa  600  1e-170  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  42.45 
 
 
872 aa  597  1e-169  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  42.7 
 
 
898 aa  596  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  38.74 
 
 
891 aa  597  1e-169  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  39.12 
 
 
882 aa  595  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  39.17 
 
 
857 aa  592  1e-168  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  35.94 
 
 
873 aa  591  1e-167  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  38.47 
 
 
837 aa  591  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  38.65 
 
 
858 aa  588  1e-166  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  39.54 
 
 
854 aa  588  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  39.09 
 
 
828 aa  588  1e-166  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1537  DNA mismatch repair protein MutS  43.35 
 
 
880 aa  588  1e-166  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 
868 aa  588  1e-166  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  38 
 
 
856 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  39.85 
 
 
863 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  40.04 
 
 
850 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  39.59 
 
 
862 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  38.11 
 
 
856 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  37.76 
 
 
890 aa  581  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  37.68 
 
 
872 aa  579  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  38.37 
 
 
871 aa  581  1e-164  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  38.16 
 
 
874 aa  580  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  38.11 
 
 
856 aa  582  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  38.11 
 
 
856 aa  582  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  41.29 
 
 
878 aa  579  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  37.24 
 
 
890 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  37.34 
 
 
890 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  39.85 
 
 
880 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  39.19 
 
 
855 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  37.89 
 
 
856 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  37.54 
 
 
861 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  37.54 
 
 
861 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  37.16 
 
 
892 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  37.39 
 
 
894 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  37.26 
 
 
892 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  35.3 
 
 
868 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  37.47 
 
 
853 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  37.08 
 
 
892 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  37.32 
 
 
861 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  35.94 
 
 
869 aa  575  1.0000000000000001e-162  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  38.51 
 
 
858 aa  571  1e-161  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  37.26 
 
 
892 aa  571  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  36.83 
 
 
875 aa  572  1e-161  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1089  DNA mismatch repair protein MutS  40.09 
 
 
882 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  42.94 
 
 
862 aa  571  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  37.26 
 
 
892 aa  571  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  37.65 
 
 
862 aa  571  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  38.6 
 
 
892 aa  572  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  37.45 
 
 
887 aa  570  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  37.26 
 
 
892 aa  572  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  38.79 
 
 
871 aa  570  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  37.24 
 
 
861 aa  571  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  38.01 
 
 
873 aa  566  1e-160  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  35.57 
 
 
860 aa  566  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  38.27 
 
 
884 aa  566  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  38.27 
 
 
884 aa  566  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  38.16 
 
 
854 aa  567  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  37.57 
 
 
854 aa  567  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  35.64 
 
 
868 aa  568  1e-160  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  38.57 
 
 
858 aa  567  1e-160  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  36.67 
 
 
871 aa  566  1e-160  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  37.47 
 
 
858 aa  565  1.0000000000000001e-159  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  37.54 
 
 
853 aa  565  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>