More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0271 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0271  pseudouridylate synthase TruB domain protein  100 
 
 		 314 aa  632  1e-180  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2256  pseudouridylate synthase TruB domain protein  75.16 
 
 		 304 aa  454  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1812  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  63.52 
 
 		 343 aa  373  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.572421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2322  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  61.61 
 
 		 295 aa  371  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.713223  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1733  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  62.34 
 
 		 299 aa  354  1e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.17014 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1702  putative rRNA pseudouridine synthase  42.07 
 
 		 321 aa  238  9e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.438885  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0028  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  41.42 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000488795  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1494  pseudouridylate synthase TruB domain protein  42.96 
 
 		 286 aa  235  6e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0082  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  41.75 
 
 		 338 aa  230  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0988  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  40.13 
 
 		 359 aa  226  4e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0461  putative rRNA pseudouridine synthase  39.03 
 
 		 338 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1720  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  37.86 
 
 		 333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0406  pseudouridylate synthase subunit TruB  39.94 
 
 		 332 aa  211  9e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0961  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  37.86 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0985  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  37.54 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0128242  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1222  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  38.38 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2750  pseudouridylate synthase TruB domain protein  42.55 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0155  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  36.07 
 
 		 335 aa  200  3e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0089  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  35.28 
 
 		 331 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0080  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  34.63 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0054  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  35.69 
 
 		 333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0072  hypothetical protein  39.78 
 
 		 282 aa  195  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00484212 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1128  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  33.98 
 
 		 328 aa  192  9e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000787218 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0538  pseudouridylate synthase  39.73 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0902248  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2268  pseudouridylate synthase  38.31 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.570966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20773  predicted protein  33.87 
 
 		 484 aa  173  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0513  pseudouridylate synthase  34.3 
 
 		 322 aa  169  8e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08851  Centromere/microtubule-binding protein CBF5 (Centromere-binding factor 5)(Small nucleolar RNP protein CBF5)(H/ACA snoRNP protein CBF5)(rRNA pseudouridine synthase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O43100]  34.07 
 
 		 481 aa  167  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.842396  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1369  pseudouridylate synthase TruB domain protein  37.24 
 
 		 251 aa  165  8e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.862548  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64832  nucleolar pseuduridine synthase and putative microtubule binding protein  33.12 
 
 		 475 aa  163  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02940  centromere/microtubule binding protein cbf5, putative  33.86 
 
 		 503 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701159  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0057  PUA domain-containing protein  38.57 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.510728 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30197  predicted protein  35.49 
 
 		 411 aa  142  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  29.47 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  31.65 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  29.72 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  28.57 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1862  tRNA pseudouridine synthase B  30.72 
 
 		 313 aa  102  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.552372  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  31.02 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1946  tRNA pseudouridine synthase B  30.96 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  31.05 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1694  tRNA pseudouridine synthase B  30.74 
 
 		 328 aa  99.8  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00112277  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  29.03 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  30.74 
 
 		 314 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  29.96 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  28.7 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0929  tRNA pseudouridine synthase B  29.62 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.590741  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  29.03 
 
 		 305 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  29.03 
 
 		 305 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0059  tRNA pseudouridine synthase B  32.37 
 
 		 366 aa  96.3  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  28.99 
 
 		 301 aa  95.9  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0491  tRNA pseudouridine synthase B  29.52 
 
 		 323 aa  96.3  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.444271 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  29.92 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1222  tRNA pseudouridine synthase B  33.33 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.732593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  32.75 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  25.33 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1091  tRNA pseudouridine synthase B  28.77 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0150332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1747  tRNA pseudouridine synthase B  28.88 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108245  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  30.47 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  30.82 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  28.32 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  24.46 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  30.2 
 
 		 309 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  28.67 
 
 		 306 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  31.1 
 
 		 310 aa  93.2  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1105  tRNA pseudouridine synthase B  31.94 
 
 		 313 aa  92.4  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0903  pseudouridylate synthase  31.19 
 
 		 299 aa  92.4  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  31.07 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  30.57 
 
 		 241 aa  92  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0695  tRNA pseudouridine synthase B  28.17 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.392139  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  27.9 
 
 		 293 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2203  tRNA pseudouridine synthase B  25.96 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.147231  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1311  tRNA pseudouridine synthase B  33.52 
 
 		 249 aa  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0354136  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0438  tRNA pseudouridine synthase B  30.22 
 
 		 366 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2118  tRNA pseudouridine synthase B  29.24 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206379  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0291  tRNA pseudouridine synthase B  29.89 
 
 		 363 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0204129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3725  tRNA pseudouridine synthase B  26.11 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0838427 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0033  tRNA pseudouridine synthase B  32.26 
 
 		 412 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0629  tRNA pseudouridine synthase B  25.45 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1005  tRNA pseudouridine synthase B  28.06 
 
 		 307 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  29.8 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2428  tRNA pseudouridine synthase B  33.03 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  31.11 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  30.37 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0229  tRNA pseudouridine synthase B  31.18 
 
 		 368 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00860319  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4065  tRNA pseudouridine synthase B  28.28 
 
 		 310 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0981  tRNA pseudouridine synthase B  27.31 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2009  tRNA pseudouridine synthase B  30.22 
 
 		 347 aa  89.7  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.845229  normal  0.607065 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  30.37 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  30.37 
 
 		 311 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  30.37 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  30.37 
 
 		 321 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  30.37 
 
 		 321 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1225  tRNA pseudouridine synthase B  28.42 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.886706  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  30.37 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  30.74 
 
 		 310 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  30.74 
 
 		 310 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1119  tRNA pseudouridine synthase B  33.49 
 
 		 318 aa  89  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.717594  normal  0.307912 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  28.47 
 
 		 313 aa  89  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0069  tRNA pseudouridine synthase B  27.04 
 
 		 302 aa  89  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00601892  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>