188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0212 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0212  ribosomal protein L23  100 
 
 
84 aa  169  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2220  ribosomal protein L23  88.1 
 
 
84 aa  157  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2447  50S ribosomal protein L23P  69.05 
 
 
84 aa  126  9e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1830  50S ribosomal protein L23P  65.43 
 
 
85 aa  114  4e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.649517 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2294  50S ribosomal protein L23P  65.43 
 
 
87 aa  109  1e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0566  50S ribosomal protein L23P  48.75 
 
 
82 aa  82  2e-15  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0431079  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0444  50S ribosomal protein L23P  46.25 
 
 
82 aa  81.6  3e-15  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0443463  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1726  ribosomal protein L25/L23  44.44 
 
 
82 aa  77.4  6e-14  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0805  50S ribosomal protein L23P  44.44 
 
 
86 aa  76.3  1e-13  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.720418  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0003  50S ribosomal protein L23P  48.1 
 
 
82 aa  75.1  3e-13  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  3.37619e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0793  50S ribosomal protein L23P  44.44 
 
 
86 aa  73.2  1e-12  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.110307  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0031  50S ribosomal protein L23P  44.44 
 
 
86 aa  73.2  1e-12  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0534  50S ribosomal protein L23P  44.58 
 
 
83 aa  73.2  1e-12  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.646212  normal  0.481774 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1519  ribosomal protein L23  43.37 
 
 
87 aa  70.9  5e-12  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  2.62554e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0108  50S ribosomal protein L23P  45.57 
 
 
82 aa  70.9  5e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1125  50S ribosomal protein L23P  43.21 
 
 
86 aa  70.5  8e-12  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  45 
 
 
90 aa  69.7  1e-11  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0083  50S ribosomal protein L23P  40.51 
 
 
82 aa  69.7  1e-11  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.657611  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0859  50S ribosomal protein L23P  39.51 
 
 
86 aa  68.6  3e-11  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.455359  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2048  50S ribosomal protein L23P  41.98 
 
 
82 aa  66.2  1e-10  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.700766 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1585  50S ribosomal protein L23P  40.74 
 
 
81 aa  65.9  2e-10  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00350  ribosomal protein, putative  43.59 
 
 
154 aa  65.1  3e-10  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0815  50S ribosomal protein L23P  41.98 
 
 
81 aa  64.7  4e-10  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1798  50S ribosomal protein L23P  40.74 
 
 
81 aa  64.7  5e-10  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  normal  0.590833 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16602  Ribosomal protein L23a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  35.8 
 
 
121 aa  62.4  2e-09  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  46.99 
 
 
98 aa  60.1  1e-08  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0315  ribosomal protein L25/L23  38.37 
 
 
86 aa  58.9  2e-08  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.997937  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61259  predicted protein  41.77 
 
 
139 aa  58.2  3e-08  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  45.78 
 
 
98 aa  58.2  4e-08  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  45.78 
 
 
98 aa  58.2  4e-08  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2251  50S ribosomal protein L23P  33.75 
 
 
82 aa  57.8  6e-08  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  2.99035e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0093  50S ribosomal protein L23P  37.04 
 
 
81 aa  57  9e-08  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  2.49681e-09  unclonable  3.35999e-07 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  45.68 
 
 
98 aa  55.8  2e-07  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  43.37 
 
 
94 aa  54.7  4e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  43.37 
 
 
99 aa  55.1  4e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  40.96 
 
 
96 aa  54.3  6e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0807  50S ribosomal protein L25/L23  34.94 
 
 
88 aa  53.5  9e-07  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.563432 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1776  ribosomal protein L23  38.27 
 
 
81 aa  52.8  1e-06  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  51.67 
 
 
98 aa  52.8  2e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  38.64 
 
 
100 aa  52  3e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
98 aa  52  3e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  37.5 
 
 
97 aa  50.4  8e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  38.64 
 
 
100 aa  50.1  1e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  37.5 
 
 
103 aa  49.7  1e-05  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  37.5 
 
 
103 aa  49.7  1e-05  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  42.17 
 
 
94 aa  50.1  1e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  2.64859e-05 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  40.7 
 
 
110 aa  50.1  1e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  46.25 
 
 
98 aa  49.7  1e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  38.64 
 
 
100 aa  49.7  1e-05  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  36.47 
 
 
104 aa  49.3  2e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  37.5 
 
 
100 aa  49.3  2e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  41.77 
 
 
101 aa  49.3  2e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08856  60S ribosomal protein L23 (AFU_orthologue; AFUA_5G05630)  35.53 
 
 
153 aa  48.5  3e-05  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  36.14 
 
 
95 aa  48.1  4e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  41.77 
 
 
94 aa  48.1  4e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  38.82 
 
 
93 aa  48.1  4e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  40.23 
 
 
111 aa  47.8  5e-05  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1849  50S ribosomal protein L23  36.36 
 
 
103 aa  47.8  5e-05  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.310449  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2561  Ribosomal protein L25/L23  36.05 
 
 
104 aa  47.8  5e-05  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3665  ribosomal protein L25/L23  37.08 
 
 
99 aa  47.8  5e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.49169e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  46.3 
 
 
105 aa  47.8  6e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  9.21122e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  31.4 
 
 
100 aa  47.8  6e-05  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  39.76 
 
 
98 aa  47.4  6e-05  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  41.67 
 
 
96 aa  47.4  7e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  35.8 
 
 
100 aa  47  8e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  43.55 
 
 
97 aa  47  9e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  39.76 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  40.23 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  42.5 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  35.23 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0856  50S ribosomal protein L23  36.78 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483725  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2322  50S ribosomal protein L23  48.21 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  3.34931e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  35.23 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  42.37 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  36.9 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0871  50S ribosomal protein L23  40 
 
 
100 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  41.67 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  45 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  2.50147e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0578  Ribosomal protein L25/L23  42.31 
 
 
102 aa  45.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  39.29 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.28717e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  41.67 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  36.36 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  36.9 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  41.94 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.54231e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  39.68 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  39.68 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  41.67 
 
 
98 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  45.9 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  40.96 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  4.83803e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  38.27 
 
 
98 aa  45.1  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  37.65 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  36.59 
 
 
95 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1069  50S ribosomal protein L23  40.3 
 
 
94 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.47106e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  42.19 
 
 
94 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  1.34151e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 
100 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  2.48684e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 
100 aa  44.3  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.08369e-09  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  45 
 
 
98 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  38.24 
 
 
99 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4003  Ribosomal protein L25/L23  36.73 
 
 
109 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.68966 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>