More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0107 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
390 aa  748    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  82.05 
 
 
390 aa  612  9.999999999999999e-175  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  69.49 
 
 
390 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  57.99 
 
 
391 aa  431  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0189  major facilitator superfamily MFS_1  55.9 
 
 
390 aa  402  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2022  major facilitator superfamily MFS_1  53.89 
 
 
414 aa  374  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  53.05 
 
 
394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  44.81 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 
434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0450  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 
412 aa  109  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.122733  normal  0.430828 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 
409 aa  107  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1616  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
407 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3717  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 
394 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  26.69 
 
 
410 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 
400 aa  90.1  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 
400 aa  89.7  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  28.85 
 
 
413 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3902  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.088151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  29.03 
 
 
419 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  25.34 
 
 
445 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  25.34 
 
 
445 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0319  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 
434 aa  82  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2430  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 
398 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5051  phosphoglycerate transporter  23.73 
 
 
444 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2345  major facilitator transporter  23.13 
 
 
446 aa  80.1  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.205861 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2103  major facilitator transporter  23.21 
 
 
449 aa  79.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.552492  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5303  major facilitator transporter  25.61 
 
 
436 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1001  MFS family transporter  29.03 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  25.18 
 
 
430 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3147  major facilitator transporter  25.81 
 
 
434 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  25.18 
 
 
430 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3790  phosphoglycerate transporter  23.84 
 
 
446 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  25.59 
 
 
448 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 
417 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  25 
 
 
440 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0993  2-ketogluconate/H(+) major facilitator transporter  26 
 
 
440 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051326  normal  0.375991 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5375  phosphoglycerate transporter family protein  23.84 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5109  phosphoglycerate transporter family protein  23.84 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5500  phosphoglycerate transporter family protein  23.84 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94723  MFS family transporter: glycerol-3-phosphate  25.31 
 
 
424 aa  74.7  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000449836 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5429  phosphoglycerate transporter family protein  23.84 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4940  glycerol-3-phosphate transporter  24.09 
 
 
444 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2540  phosphoglycerate transport: transporter  25.3 
 
 
463 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2759  phosphoglycerate transporter  25.3 
 
 
463 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2588  phosphoglycerate transport: transporter  25.3 
 
 
463 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32250  Major facilitator family transporter protein  22.16 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  24.13 
 
 
429 aa  73.2  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4955  glycerol-3-phosphate transporter  23.36 
 
 
444 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2629  phosphoglycerate transport: transporter  25.3 
 
 
463 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  25.46 
 
 
416 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69130  sn-glycerol-3-phosphate transporter  26.89 
 
 
448 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2653  phosphoglycerate transport: transporter  25.3 
 
 
463 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132768 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5349  phosphoglycerate transporter family protein  23.36 
 
 
444 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5727  major facilitator transporter  24.32 
 
 
434 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2622  major facilitator superfamily MFS_1  23.78 
 
 
421 aa  72.8  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  32.7 
 
 
456 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  26.16 
 
 
432 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5381  phosphoglycerate transporter family protein  23.6 
 
 
444 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  29.76 
 
 
431 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 
406 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5002  major facilitator transporter  25.26 
 
 
433 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  24.81 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5573  phosphoglycerate transporter family protein  23.36 
 
 
444 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  25.84 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0477  major facilitator transporter  22.9 
 
 
441 aa  70.1  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4280  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 
439 aa  70.1  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3143  major facilitator transporter  25.26 
 
 
433 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4133  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 
435 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4020  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 
435 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4496  major facilitator transporter  24.07 
 
 
434 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  26.62 
 
 
420 aa  69.7  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.263377 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2076  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 
378 aa  69.3  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284167  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5978  sn-glycerol-3-phosphate transporter  26.65 
 
 
448 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  24.78 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  25.89 
 
 
439 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  24.66 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  22.02 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  24.66 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 
429 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  25.67 
 
 
448 aa  67  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4252  regulatory protein UhpC  25 
 
 
439 aa  67  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  25.52 
 
 
425 aa  67  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3298  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.25 
 
 
457 aa  67  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 
432 aa  67.4  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  21.15 
 
 
418 aa  67  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1536  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.48 
 
 
408 aa  67  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.7 
 
 
465 aa  66.6  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  31.36 
 
 
455 aa  66.6  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  26.71 
 
 
440 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  26.9 
 
 
428 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0036  phosphoglycerate transporter  25 
 
 
439 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3880  regulatory protein UhpC  25 
 
 
439 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  31.36 
 
 
455 aa  66.2  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03493  hypothetical protein  25 
 
 
439 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>