194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0096 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0096  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 398 aa  808    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.265254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0100  extracellular solute-binding protein family 1  72.61 
 
 		 403 aa  621  1e-177  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0106  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  72.11 
 
 		 397 aa  609  1e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0104  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  75.26 
 
 		 379 aa  606  9.999999999999999e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0081  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  36.41 
 
 		 404 aa  222  8e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0373558  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3861  hypothetical protein  33.75 
 
 		 392 aa  200  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0902181  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3851  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 		 353 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0852756  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3951  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 366 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0469175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1010  extracellular solute-binding protein family 1  28.67 
 
 		 419 aa  90.9  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.227353 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0281  putative polyamine-binding lipoprotein  28.35 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.565719  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1117  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.661593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3395  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1882  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  25.82 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0892  extracellular solute-binding protein family 1  22.74 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.388428  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6036  extracellular solute-binding protein family 1  22.26 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.62779 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2583  extracellular solute-binding protein family 1  21.56 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000231381  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1010  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1442  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  22.81 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1202  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  22.63 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1180  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  22.63 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1182  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  22.63 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1300  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  22.63 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1378  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  22.63 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178306 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1204  extracellular solute-binding protein  22.63 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2300  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1401  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  22.63 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1221  extracellular solute-binding protein family 1  22.35 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1340  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  22.84 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1551  extracellular solute-binding protein  21.22 
 
 		 363 aa  62  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1283  twin-arginine translocation pathway signal  21.53 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00667141  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2226  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  26.43 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1938  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor  26.43 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4004  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  22.56 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000629977 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0894  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0148  extracellular solute-binding protein family 1  22.27 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.934394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1330  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0132  extracellular solute-binding protein  22.29 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.911312  normal  0.781797 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1145  hypothetical protein  23.02 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1193  extracellular solute-binding protein  21.55 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00611018  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1513  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1140  hypothetical protein  22.64 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1064  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1048  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  26.39 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00610599  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3009  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.274617  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0946  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1061  extracellular solute-binding protein  21.26 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3744  twin-arginine translocation pathway signal  24.36 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1199  extracellular solute-binding protein  21.32 
 
 		 366 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000384833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1108  extracellular solute-binding protein  21.32 
 
 		 366 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000316767  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0857  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 355 aa  54.3  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3192  extracellular solute-binding protein family 1  21.32 
 
 		 366 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683038  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8146  spermidine/putrescine binding protein of ABC transporter  25.57 
 
 		 371 aa  53.9  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00458388  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5632  extracellular solute-binding protein  22.43 
 
 		 366 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0464998  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0747  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 354 aa  53.5  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.389252  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2187  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  21.2 
 
 		 316 aa  52.8  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 338 aa  52.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4255  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 344 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00000172827  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1160  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  23.11 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000302553  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1166  extracellular solute-binding protein  21.32 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000290123  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1094  extracellular solute-binding protein  21.07 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.799805  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5341  ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein, putative  21.43 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.169562  hitchhiker  0.0000795436 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3397  ABC opine/polyamine transporter, periplasmic binding protein  25.69 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4157  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194913  normal  0.672619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2918  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000482793  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3000  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00190221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3097  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1341  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0539  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 358 aa  52.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5250  extracellular solute-binding protein  21.43 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1583  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor (SPBP)  25.25 
 
 		 362 aa  51.2  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0473653  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03930  polyamine transport protein  25.47 
 
 		 365 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0124  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 		 364 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3622  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.360569 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6181  extracellular solute-binding protein family 1  19.03 
 
 		 369 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003484  ABC transporter periplasmic spermidine putrescine-binding protein PotD  25.29 
 
 		 343 aa  50.8  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000109214  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4943  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 340 aa  50.8  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2417  extracellular solute-binding protein family 1  22.77 
 
 		 386 aa  50.4  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1235  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  21.7 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0258695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2187  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 386 aa  50.4  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227535  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2382  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 371 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.721841  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2996  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 371 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.625226  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0783  ABC opine/polyamine transporter, periplasmic binding protein  23.95 
 
 		 323 aa  50.1  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5362  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 		 366 aa  50.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3042  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 347 aa  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0963971  normal  0.874753 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1270  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  25 
 
 		 367 aa  49.7  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1360  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  21.3 
 
 		 377 aa  49.7  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0349752 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3216  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 405 aa  49.7  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.018285  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2605  extracellular solute-binding protein  20.42 
 
 		 396 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3015  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 371 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.946307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5390  extracellular solute-binding protein  21.74 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110702  normal  0.0735387 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1264  transcription factor jumonji, JmjC  21.24 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0392  polyamine transport protein  25 
 
 		 365 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2566  twin-arginine translocation pathway signal  20.42 
 
 		 396 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2611  extracellular solute-binding protein  20.42 
 
 		 396 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.768707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3636  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 343 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93135  normal  0.343272 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0185  extracellular solute-binding protein family 1  21.55 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2905  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3043  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2702  extracellular solute-binding protein family 1  22.61 
 
 		 350 aa  48.9  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000144113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>