More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0093 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
425 aa  875    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
397 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1567  GntR family transcriptional regulator  40.44 
 
 
397 aa  290  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1052  putative transcriptional regulator, GntR family  41.55 
 
 
398 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  36.59 
 
 
400 aa  282  1e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
383 aa  281  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  37.53 
 
 
463 aa  270  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
397 aa  270  4e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  37.3 
 
 
401 aa  268  1e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  38.68 
 
 
416 aa  268  1e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  37.57 
 
 
340 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  37.9 
 
 
409 aa  266  4e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  33.78 
 
 
397 aa  266  5e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  36.84 
 
 
399 aa  264  2e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  36.66 
 
 
399 aa  262  8.999999999999999e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2027  GntR family transcriptional regulator  37.53 
 
 
383 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  36.83 
 
 
436 aa  260  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  35.41 
 
 
433 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
401 aa  257  3e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  36.39 
 
 
386 aa  255  9e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  36.03 
 
 
395 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  38.77 
 
 
416 aa  253  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  36.8 
 
 
441 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  37.84 
 
 
393 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  36.83 
 
 
441 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  38.75 
 
 
437 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 
432 aa  251  2e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  36.68 
 
 
438 aa  249  6e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  35.45 
 
 
397 aa  249  7e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  36.31 
 
 
611 aa  249  9e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
437 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  36.24 
 
 
439 aa  248  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  37.57 
 
 
393 aa  247  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  37.03 
 
 
393 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  35.01 
 
 
397 aa  247  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
403 aa  247  3e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  34.96 
 
 
440 aa  247  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  35.42 
 
 
435 aa  246  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  37.03 
 
 
393 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  37.03 
 
 
393 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  36.6 
 
 
554 aa  246  8e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  37.03 
 
 
393 aa  245  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  35.66 
 
 
436 aa  245  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  35.85 
 
 
433 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  35.58 
 
 
416 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  37.03 
 
 
393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  37.03 
 
 
393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  37.03 
 
 
393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  33.07 
 
 
397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 
437 aa  243  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 
402 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
393 aa  242  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
398 aa  242  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  36.41 
 
 
440 aa  242  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  35.15 
 
 
446 aa  241  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
398 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  37.84 
 
 
393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  34.14 
 
 
438 aa  240  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  36.31 
 
 
446 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  37.84 
 
 
393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  37.84 
 
 
393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  37.84 
 
 
393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  37.84 
 
 
393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  37.84 
 
 
393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  32.9 
 
 
402 aa  240  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.49 
 
 
517 aa  239  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  36.22 
 
 
394 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  31.39 
 
 
394 aa  239  8e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  35.92 
 
 
498 aa  239  9e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  36.31 
 
 
396 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  36.31 
 
 
396 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  34.88 
 
 
400 aa  238  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  35.23 
 
 
398 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
414 aa  238  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  35.48 
 
 
430 aa  237  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
413 aa  236  5.0000000000000005e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 
398 aa  236  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
411 aa  236  8e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 
403 aa  235  9e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  34.96 
 
 
398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  31.56 
 
 
396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  34.37 
 
 
397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 
411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  31.83 
 
 
395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  33.16 
 
 
395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  31.81 
 
 
395 aa  233  5e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  34.05 
 
 
404 aa  233  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  37.67 
 
 
406 aa  233  6e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  32.45 
 
 
394 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 
395 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  31.99 
 
 
404 aa  232  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
395 aa  232  1e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  32.35 
 
 
400 aa  232  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  31.01 
 
 
405 aa  231  2e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  35.83 
 
 
414 aa  230  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  34.69 
 
 
406 aa  230  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0712  putative transcriptional regulator, GntR family  36.9 
 
 
375 aa  229  5e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0052998  normal  0.0161379 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
395 aa  229  7e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0064  aminotransferase, class I  34.84 
 
 
397 aa  229  8e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>