More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0083 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
314 aa  622  1e-177  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0954556  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.86 
 
 
306 aa  342  7e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0668504  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.8 
 
 
306 aa  310  2e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.995007  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2812  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  36.66 
 
 
328 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6347  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  36.66 
 
 
328 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.37 
 
 
301 aa  189  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.84 
 
 
293 aa  188  9e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 
328 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 
328 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 
328 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
293 aa  186  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.913053 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
305 aa  186  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181159  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 
331 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
323 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1016  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.11 
 
 
330 aa  186  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.725697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1133  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
301 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
309 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622  normal  0.150857 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4006  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  39.84 
 
 
282 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  hitchhiker  0.00000000961653 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1338  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  39.84 
 
 
282 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0632  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  38.14 
 
 
326 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0724  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  38.14 
 
 
326 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
331 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2018  putrescine ABC transport system, permease protein  38.14 
 
 
326 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2278  putrescine ABC transporter, permease protein  37.84 
 
 
309 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0728081  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
309 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.35956 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1952  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  41.45 
 
 
309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00258406  normal  0.610972 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130981  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1950  putrescine ABC transporter, permease protein  39.42 
 
 
326 aa  179  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.443162  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
301 aa  179  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
309 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0925484  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.45 
 
 
309 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197627  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
309 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.96 
 
 
328 aa  178  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
301 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0126623  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
301 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
301 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000446726  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
295 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
301 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.90235  normal  0.0128197 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
308 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.806732 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.41 
 
 
301 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511337  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7681  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  36.64 
 
 
297 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.962209  normal  0.12531 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5048  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  38.65 
 
 
308 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145296  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0938  ABC putrescine transporter, inner membrane subunit PotH  35.28 
 
 
324 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123183  normal  0.465808 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
308 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.508263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
308 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
324 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.93633  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0822  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.18 
 
 
307 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
301 aa  176  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0587247  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1200  spermidine/putrescine ABC transporter permease  39.04 
 
 
282 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.163674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1298  spermidine/putrescine ABC transporter permease  39.04 
 
 
282 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0057841  normal  0.437411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0768287  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1581  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  35.45 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2399  ABC putrescine transporter, inner membrane subunit  41.36 
 
 
297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 
301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
297 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
310 aa  172  6.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
296 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.248217 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1008  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.23 
 
 
281 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0871  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  40.91 
 
 
284 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
296 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0764825  normal  0.0907135 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1786  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  39.57 
 
 
309 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1647  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.25 
 
 
321 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.16764 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2308  putrescine transport system permease protein  39.57 
 
 
309 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
306 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.678954 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2177  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  39.57 
 
 
309 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.499843  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1056  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  39.57 
 
 
309 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.230048  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2121  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  39.57 
 
 
309 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0109  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  39.57 
 
 
309 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.691991  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1272  polyamine ABC transporter, permease protein  37.31 
 
 
301 aa  170  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5302  putrescine ABC transporter, permease protein  38.44 
 
 
317 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0916  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.56 
 
 
317 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1440  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  40.35 
 
 
282 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00199938  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0984  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.56 
 
 
317 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
305 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.167031  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
303 aa  170  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
299 aa  170  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360446  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0952  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.56 
 
 
317 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17630  polyamine transport protein PotB  39.93 
 
 
297 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1013  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.56 
 
 
317 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1032  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.56 
 
 
317 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2285  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.15 
 
 
319 aa  169  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3950  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
295 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.872266  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.16 
 
 
278 aa  170  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4673  putrescine ABC transporter, permease protein  35.84 
 
 
317 aa  169  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
306 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542321  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1399  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  40.35 
 
 
282 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
306 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
307 aa  169  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.631485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1180  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  40.35 
 
 
282 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00976508  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1533  polyamine transport protein PotB  39.35 
 
 
297 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.8542  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1370  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.11 
 
 
317 aa  168  9e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5238  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
306 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1178  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  40.35 
 
 
282 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.18 
 
 
322 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1376  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  40.35 
 
 
282 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078006 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2384  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  35.61 
 
 
319 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.99 
 
 
267 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
282 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.2 
 
 
305 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.055919  normal  0.0738554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>