299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0081 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0081  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  100 
 
 		 404 aa  813    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0373558  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3861  hypothetical protein  47.84 
 
 		 392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0902181  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0100  extracellular solute-binding protein family 1  38.19 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0096  extracellular solute-binding protein family 1  36.78 
 
 		 398 aa  248  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.265254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0106  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  36.87 
 
 		 397 aa  247  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0104  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  36.46 
 
 		 379 aa  229  5e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3851  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 		 353 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0852756  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3951  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0469175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6036  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.62779 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1160  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  33.16 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000302553  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0344  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0132  extracellular solute-binding protein  21.53 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.911312  normal  0.781797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1117  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 368 aa  72.8  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.661593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1927  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.96322  hitchhiker  0.000000194914 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2417  extracellular solute-binding protein family 1  27.95 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0894  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8146  spermidine/putrescine binding protein of ABC transporter  32.67 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00458388  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2346  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 		 382 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00216942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3532  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1583  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor (SPBP)  28.09 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0473653  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5341  ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein, putative  20.81 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.169562  hitchhiker  0.0000795436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5250  extracellular solute-binding protein  20.81 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5632  extracellular solute-binding protein  21.1 
 
 		 366 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0464998  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5390  extracellular solute-binding protein  21.33 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110702  normal  0.0735387 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0148  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.934394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1036  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  26.62 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000359474  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1330  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 		 349 aa  66.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4305  extracellular solute-binding protein  22.5 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.330747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03930  polyamine transport protein  23.3 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2898  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6345  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  22.01 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1048  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  27.14 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00610599  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1035  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  25.78 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000879227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0326  extracellular solute-binding protein family 1  22.87 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00599972  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1010  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.227353 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3308  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.033715 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0892  extracellular solute-binding protein family 1  19.73 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.388428  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3015  extracellular solute-binding protein  21.78 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.946307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2583  extracellular solute-binding protein family 1  22.28 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000231381  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2905  extracellular solute-binding protein  21.97 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2708  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15362  normal  0.342608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3622  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.360569 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3147  periplasmic polyamine-binding protein, putative  26.21 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.718398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7525  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  22.28 
 
 		 372 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.874813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2567  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 362 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2382  extracellular solute-binding protein  21.49 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.721841  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3043  extracellular solute-binding protein  21.97 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2996  extracellular solute-binding protein  21.49 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.625226  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1140  hypothetical protein  24.47 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4664  extracellular solute-binding protein family 1  21.78 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.969317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2105  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.681994 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2287  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  23.23 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3847  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1145  hypothetical protein  24.47 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1010  extracellular solute-binding protein  22.4 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0940  ABC putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein PotF  21.43 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147346  normal  0.325606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03855  periplasmic polyamine binding protein  22.63 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0392  polyamine transport protein  22.44 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0863  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28311  ABC(binding protein) family transporter: polyamine  24.6 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011934  hitchhiker  0.000840436 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2406  extracellular solute-binding protein family 1  22.56 
 
 		 342 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0281  putative polyamine-binding lipoprotein  23.05 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.565719  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7565  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  24.1 
 
 		 391 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132158  normal  0.536425 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2779  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  21.02 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0747  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.389252  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6181  extracellular solute-binding protein family 1  21.47 
 
 		 369 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4852  extracellular solute-binding protein  21.28 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0698456  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1551  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0283  extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3242  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1367  transcription factor jumonji, jmjC  23.67 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1264  transcription factor jumonji, JmjC  23.89 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2829  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0903  extracellular solute-binding protein  21.98 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551806  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4132  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0286  ABC transporter periplasmic binding protein  22.59 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2990  extracellular solute-binding protein  20.17 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5240  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2406  putrescine-binding periplasmic protein precursor  22.58 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.388567  hitchhiker  0.00509094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0346  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2128  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.205497  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0873  periplasmic polyamine-binding protein, putative  21.61 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2225  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 		 371 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003484  ABC transporter periplasmic spermidine putrescine-binding protein PotD  26.57 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000109214  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7683  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  23.86 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.370067 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1948  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  20.69 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1401  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  21.58 
 
 		 349 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1180  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  21.58 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1182  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  21.58 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4864  extracellular solute-binding protein  22.06 
 
 		 364 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1645  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  22.78 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0561958 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02286  hypothetical protein  27.33 
 
 		 343 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2135  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 368 aa  56.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1378  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  21.58 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178306 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1202  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  21.58 
 
 		 345 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0726  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  21.59 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1368  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  24.63 
 
 		 370 aa  55.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1300  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  21.58 
 
 		 345 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0124  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 364 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>