More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0077 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  100 
 
 
275 aa  543  1e-154  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  74.17 
 
 
235 aa  386  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  57.58 
 
 
235 aa  295  7e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  58.17 
 
 
227 aa  294  1e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  58.27 
 
 
235 aa  268  5.9999999999999995e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  39.25 
 
 
243 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  37.02 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  38.01 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  36.5 
 
 
221 aa  162  6e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  37.69 
 
 
224 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  35.47 
 
 
227 aa  156  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  35.5 
 
 
226 aa  151  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  34.07 
 
 
224 aa  144  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  30.6 
 
 
234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  32.69 
 
 
216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  30.74 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  30 
 
 
215 aa  123  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  29.96 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  26.85 
 
 
213 aa  109  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  29.33 
 
 
324 aa  96.3  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  30.66 
 
 
350 aa  91.3  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  28.42 
 
 
324 aa  90.5  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  28.99 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  26.59 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  27.9 
 
 
349 aa  82.8  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  30.26 
 
 
330 aa  82.4  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  30.26 
 
 
333 aa  82.4  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  25.83 
 
 
407 aa  82  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  29.52 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  29.89 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  27.14 
 
 
358 aa  79.7  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  26.57 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  27.78 
 
 
348 aa  78.6  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  27.48 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  28.26 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  28.52 
 
 
358 aa  77  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  28.03 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  25.91 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  26.5 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  24.63 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  27.21 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  26.84 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  29.32 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  28.03 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  28.62 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  27.02 
 
 
358 aa  70.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  27.66 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  26.67 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  24.55 
 
 
658 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  27.3 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  27.3 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  27.3 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  23.74 
 
 
348 aa  65.5  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  29.95 
 
 
456 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  26.35 
 
 
363 aa  60.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17589  predicted protein  52.24 
 
 
288 aa  59.7  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0328752  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  25 
 
 
352 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2373  recombinase A  24.47 
 
 
351 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00420891  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  43.55 
 
 
362 aa  57  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26240  predicted protein  43.24 
 
 
369 aa  57.4  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00269696 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1816  recA protein  27.11 
 
 
375 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.54195  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3750  recA protein  26.71 
 
 
340 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.79987  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  27.06 
 
 
358 aa  56.2  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1671  recombinase A  44.26 
 
 
357 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  24.82 
 
 
349 aa  55.8  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0145  recombinase A  26.34 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  25.27 
 
 
379 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0584  recombinase A  43.86 
 
 
385 aa  55.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000230133  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1525  recA protein  24.83 
 
 
353 aa  55.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245316  unclonable  4.38442e-19 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0355  recA protein  27.76 
 
 
367 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03480  RecA  24.73 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  26.26 
 
 
356 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  25.44 
 
 
364 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1338  recombinase A  45.61 
 
 
364 aa  54.7  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000600753  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0876  recombinase A  24.38 
 
 
357 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395015 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  47.37 
 
 
346 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0872  recombinase A  24.18 
 
 
414 aa  53.9  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.396783  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54013  chloroplast-targeted nuclear-encoded recombinase  46.3 
 
 
431 aa  53.9  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481805  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1109  recombinase A  25.1 
 
 
357 aa  53.5  0.000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0131  recombinase A  25.09 
 
 
365 aa  53.5  0.000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07480  RecA protein  41.1 
 
 
352 aa  53.5  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0526583  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0033  RecA protein  28.33 
 
 
358 aa  53.1  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0887  recombinase A  25.1 
 
 
357 aa  53.1  0.000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22971  recombinase A  40.98 
 
 
379 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  40.74 
 
 
349 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  25.27 
 
 
358 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  37.65 
 
 
346 aa  53.1  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0198  recombinase A  26.45 
 
 
339 aa  52.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0327556 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  35.44 
 
 
357 aa  52.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4116  recombinase A  40.98 
 
 
356 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.979014 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1382  recombinase A  38.89 
 
 
376 aa  52.8  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.217546  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1372  recombinase A  45.61 
 
 
352 aa  52.4  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0663  recA protein  43.86 
 
 
346 aa  52.4  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  25.3 
 
 
344 aa  52.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2695  recombinase A  40.98 
 
 
360 aa  52.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.611822  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1255  hypothetical protein  41.94 
 
 
344 aa  52.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000979449  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10720  protein RecA  25.64 
 
 
361 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000907009  unclonable  0.00000000149755 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4925  recombinase A  40.98 
 
 
358 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705325  normal  0.253637 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  26.5 
 
 
312 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  24.91 
 
 
359 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>