More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0066 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  100 
 
 
583 aa  1140  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  49.35 
 
 
606 aa  518  1e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  51.7 
 
 
538 aa  483  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  51 
 
 
545 aa  464  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  48.25 
 
 
534 aa  459  1e-128  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4336  choline/carnitine/betaine transporter  44.84 
 
 
529 aa  459  1e-128  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0835  choline/carnitine/betaine transporter  49.36 
 
 
574 aa  456  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475223  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2003  choline/carnitine/betaine transport family protein  47.9 
 
 
535 aa  455  1e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  48.8 
 
 
659 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2125  choline/carnitine/betaine transport  47.03 
 
 
549 aa  450  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  48.8 
 
 
659 aa  451  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0600  choline/carnitine/betaine transporter  48.66 
 
 
584 aa  449  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  8.57259e-11  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  48.39 
 
 
667 aa  447  1e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  44 
 
 
551 aa  447  1e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  44.19 
 
 
685 aa  435  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  46.34 
 
 
541 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02455  choline/carnitine/betaine transporter  43.56 
 
 
582 aa  432  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1003  choline/carnitine/betaine transporter  44.95 
 
 
553 aa  430  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  45.95 
 
 
682 aa  431  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0049  choline/carnitine/betaine transporter  47.06 
 
 
523 aa  432  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.335489  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2045  choline/carnitine/betaine transporter  44.92 
 
 
554 aa  428  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0189191  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003606  High-affinity choline uptake protein BetT  43.5 
 
 
553 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1362  choline/carnitine/betaine transport  46.04 
 
 
673 aa  422  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000623924  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0898  BCCT family transporter  46 
 
 
540 aa  425  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4552  choline/carnitine/betaine transporter  47.1 
 
 
555 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  46.88 
 
 
661 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  45.14 
 
 
682 aa  425  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0980  choline/carnitine/betaine transport  48.92 
 
 
548 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  45.27 
 
 
657 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3129  choline/carnitine/betaine transporter  48.51 
 
 
554 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.32452  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01883  choline/carnitine/betaine transporter  45.69 
 
 
529 aa  421  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2505  choline/carnitine/betaine transporter  43.86 
 
 
541 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  42.32 
 
 
637 aa  420  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  43.59 
 
 
573 aa  419  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2077  choline/carnitine/betaine transporter  45.35 
 
 
572 aa  417  1e-115  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.35562  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0433  transporter, BCCT family  43.14 
 
 
531 aa  414  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  46.18 
 
 
524 aa  413  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1874  BCCT transporter  40.33 
 
 
676 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838618  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3080  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  46.01 
 
 
551 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3360  choline/carnitine/betaine transporter  40.98 
 
 
676 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0225578  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  46.28 
 
 
661 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  44.55 
 
 
656 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4430  choline/carnitine/betaine transporter  45.21 
 
 
691 aa  415  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3038  choline/carnitine/betaine transporter  47.2 
 
 
554 aa  413  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0098  transporter, BCCT family  44.59 
 
 
526 aa  413  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  43.91 
 
 
530 aa  414  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0023  choline/carnitine/betaine transporter  45.9 
 
 
539 aa  415  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.16107 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3807  choline/carnitine/betaine transporter  46.01 
 
 
551 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00825508  normal  0.301611 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1505  choline/carnitine/betaine transporter  44.51 
 
 
668 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3164  choline/carnitine/betaine transporter  44.99 
 
 
660 aa  411  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1809  choline/carnitine/betaine transporter  45.13 
 
 
526 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  43.18 
 
 
542 aa  410  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  1.08541e-06 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  42.08 
 
 
526 aa  411  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2804  choline/carnitine/betaine transporter  42.86 
 
 
658 aa  406  1e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1576  choline/carnitine/betaine transporter  42.86 
 
 
658 aa  406  1e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1175  choline/carnitine/betaine transport  46.85 
 
 
658 aa  407  1e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0833615  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1077  choline/carnitine/betaine transport  42.47 
 
 
682 aa  407  1e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.892042  normal  0.109945 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  43.64 
 
 
503 aa  405  1e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  44.21 
 
 
550 aa  408  1e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0421  choline/carnitine/betaine transporter  47.69 
 
 
661 aa  409  1e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.45567  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1542  choline/carnitine/betaine transporter  42.86 
 
 
658 aa  406  1e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.869304  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  45.34 
 
 
508 aa  406  1e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4548  choline/carnitine/betaine transporter  48.22 
 
 
551 aa  406  1e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1441  choline/carnitine/betaine transporter  42.34 
 
 
658 aa  407  1e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  41.22 
 
 
676 aa  405  1e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3929  hypothetical protein  47.21 
 
 
551 aa  406  1e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.720842  normal  0.613133 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4210  choline/carnitine/betaine transport  40.81 
 
 
676 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157306  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4156  choline/carnitine/betaine transporter  40.81 
 
 
676 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87836  normal  0.0109397 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4045  choline/carnitine/betaine transporter  42.86 
 
 
673 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.57128 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  44.57 
 
 
505 aa  404  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1055  choline/carnitine/betaine transporter  49.41 
 
 
520 aa  402  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.144567  normal  0.0392371 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0237  choline/carnitine/betaine transporter  44.14 
 
 
550 aa  400  1e-110  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000527978  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2719  choline/carnitine/betaine transporter  42.46 
 
 
658 aa  400  1e-110  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0234  BCCT family transporter  41.26 
 
 
716 aa  399  1e-110  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1546  choline/carnitine/betaine transporter  42.67 
 
 
658 aa  401  1e-110  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1805  choline/carnitine/betaine transporter  44.6 
 
 
664 aa  399  1e-110  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.376035  hitchhiker  0.00814736 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06429  hypothetical protein  45.03 
 
 
535 aa  402  1e-110  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0969  choline/carnitine/betaine transporter  44.51 
 
 
525 aa  402  1e-110  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.375142  normal  0.0777887 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01511  putative high-affinity choline transport protein  44.2 
 
 
676 aa  402  1e-110  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0407  BCCT family transporter  41.26 
 
 
716 aa  399  1e-110  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  44.87 
 
 
567 aa  402  1e-110  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1337  choline/carnitine/betaine transport  43.79 
 
 
687 aa  400  1e-110  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  43.02 
 
 
580 aa  402  1e-110  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2552  choline/carnitine/betaine transporter  42.09 
 
 
658 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000125111  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  42.4 
 
 
523 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  44.42 
 
 
505 aa  398  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  44.42 
 
 
505 aa  398  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0240  choline/carnitine/betaine transporter  42.26 
 
 
662 aa  396  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167365  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04111  hypothetical protein  43.23 
 
 
667 aa  398  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  46.23 
 
 
497 aa  396  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  44.42 
 
 
505 aa  398  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003545  choline-glycine betaine transporter  43.34 
 
 
526 aa  398  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  44.42 
 
 
505 aa  398  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4850  BCCT family transporter  43.04 
 
 
667 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  44.42 
 
 
505 aa  398  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04148  secondary glycine betaine transporter BetU  43.23 
 
 
667 aa  398  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0764  transporter, BCCT family  43.23 
 
 
667 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.846408  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  44.21 
 
 
504 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.83656e-05 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  43.99 
 
 
505 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2323  glycine betaine transporter  45.57 
 
 
525 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100678  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>