11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0030 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0030  UspA domain protein  100 
 
 
144 aa  286  9e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1884  UspA domain protein  64.29 
 
 
143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0565  UspA domain protein  43.57 
 
 
144 aa  105  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5239  UspA domain protein  38.97 
 
 
146 aa  95.9  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0455889  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1183  UspA domain protein  39.55 
 
 
146 aa  94.4  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000413048 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1212  UspA domain protein  42.14 
 
 
147 aa  90.9  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1214  UspA domain protein  35.97 
 
 
140 aa  90.1  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0194  UspA domain protein  40.3 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  26.83 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2322  hypothetical protein  29.55 
 
 
148 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0181  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 
162 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.243572  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>