More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4569 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4569  conjugal transfer protein TrbB  100 
 
 		 329 aa  660    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9269  conjugal transfer protein TrbB  78.33 
 
 		 323 aa  506  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8334  conjugal transfer protein TrbB  78.64 
 
 		 323 aa  502  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222514  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5376  conjugal transfer protein TrbB  75.38 
 
 		 325 aa  498  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.873553  normal  0.169831 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5482  conjugal transfer protein TrbB  66.03 
 
 		 321 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9661  conjugal transfer protein TrbB  71.05 
 
 		 320 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6502  conjugal transfer ATPase TrbB  49.02 
 
 		 320 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000848029  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6635  conjugal transfer ATPase TrbB  49.02 
 
 		 320 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000001277  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3691  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  50.97 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0047  conjugal transfer ATPase TrbB  49.67 
 
 		 366 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.435739  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2497  type II secretion system protein E  49.5 
 
 		 321 aa  286  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2027  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  52.81 
 
 		 333 aa  282  5.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  50 
 
 		 326 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1194  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  50.5 
 
 		 327 aa  280  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3541  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  50.5 
 
 		 327 aa  280  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0595  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  50.66 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0509  type II secretion system protein E  49.83 
 
 		 329 aa  280  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0244  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  48.38 
 
 		 322 aa  279  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1334  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  48.53 
 
 		 322 aa  279  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0908976 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4000  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  50.5 
 
 		 328 aa  279  5e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  50.51 
 
 		 325 aa  279  5e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1634  P-type conjugative transfer protein TrbB  48.53 
 
 		 322 aa  278  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0899884  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2265  conjugal transfer ATPase TrbB  48.37 
 
 		 320 aa  278  8e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000182151  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3212  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  50.66 
 
 		 332 aa  278  8e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0166332  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2324  type II secretion system protein E  50.33 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3086  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  51.19 
 
 		 343 aa  276  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5159  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  47.88 
 
 		 318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3004  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  48.68 
 
 		 342 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3851  type II secretion system protein E  50.33 
 
 		 327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296178  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5330  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  48.09 
 
 		 320 aa  272  5.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.548363 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3194  type II secretion system protein E  48.26 
 
 		 334 aa  272  6e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.653362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0808  type II secretion system protein E  50.52 
 
 		 326 aa  272  7e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3827  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  49.5 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  49.67 
 
 		 327 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3364  conjugal transfer protein trbB  49.84 
 
 		 326 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1013  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  50.34 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2878  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  49.01 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0715794 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4274  conjugal transfer ATPase TrbB  46.91 
 
 		 321 aa  268  8e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.39641e-17  normal  0.780952 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3541  type II secretion system protein E  48.84 
 
 		 322 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478777  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0749  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  47.6 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.641602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1500  conjugal transfer protein trbB  47.5 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0156  type II secretion system protein E  47.63 
 
 		 334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0318  type II secretion system protein E  49.67 
 
 		 327 aa  265  5.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0504933  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2268  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  48.75 
 
 		 325 aa  265  5.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4690  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  45.76 
 
 		 310 aa  265  7e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1484  type II secretion system protein E  50.33 
 
 		 332 aa  265  8e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.307277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7440  conjugal transfer protein trbB  48.66 
 
 		 305 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4195  type II secretion system protein E  49.19 
 
 		 343 aa  260  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2824  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  54.55 
 
 		 329 aa  259  4e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3901  type II secretion system protein E  48.51 
 
 		 322 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1622  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  43.03 
 
 		 346 aa  258  7e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2351  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  50.98 
 
 		 325 aa  258  7e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0966  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  47 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0161  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  49.36 
 
 		 323 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2485  type II secretion system protein E  48.34 
 
 		 327 aa  252  6e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2004  type II secretion system protein E  47.71 
 
 		 348 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2614  type II secretion system protein E  49.67 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  48.18 
 
 		 350 aa  246  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.469898  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0726  type II secretion system protein E  48.04 
 
 		 349 aa  245  9e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2645  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  46.86 
 
 		 345 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1282  type II secretion system protein E  46.86 
 
 		 356 aa  240  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2350  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  46.73 
 
 		 351 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.526616 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1341  type II secretion system protein E  47.19 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2584  conjugal transfer protein TrbB  47.19 
 
 		 355 aa  238  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1895  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  46.86 
 
 		 356 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1550  type II secretion system protein E  46.86 
 
 		 358 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00260971  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3506  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  46.53 
 
 		 344 aa  235  6e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  46.53 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3706  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  46.53 
 
 		 350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557258  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30940  putative conjugal transfer protein  46.53 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128533  unclonable  3.72388e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0438  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  46.53 
 
 		 353 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2911  type II secretion system protein E  46.2 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0688  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  47.1 
 
 		 309 aa  222  6e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  45.3 
 
 		 329 aa  212  5.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00147948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2346  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  46.07 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0892  type II secretion system protein E  38.44 
 
 		 319 aa  202  5e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1183  type II secretion system protein E  37.89 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5226  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 332 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.445343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  37.13 
 
 		 444 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  34.45 
 
 		 477 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  34.11 
 
 		 412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  35.05 
 
 		 487 aa  165  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  35.03 
 
 		 513 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  36.25 
 
 		 474 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  33.23 
 
 		 478 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  36 
 
 		 468 aa  162  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  35.07 
 
 		 442 aa  161  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  36.33 
 
 		 455 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  35.55 
 
 		 594 aa  159  9e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  36.17 
 
 		 458 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  34.1 
 
 		 404 aa  158  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2567  type II secretion system protein E  34.84 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  36.52 
 
 		 638 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  35.61 
 
 		 560 aa  155  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  35.25 
 
 		 608 aa  155  7e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  35.46 
 
 		 466 aa  155  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  34.95 
 
 		 464 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  37.33 
 
 		 474 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  34.18 
 
 		 472 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  35.11 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>