18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4555 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4555  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  277  4e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0630464  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4314  hypothetical protein  85.44 
 
 		 168 aa  176  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6455  putative transcriptional regulator  58.1 
 
 		 105 aa  121  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0674  hypothetical protein  50.47 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00479032  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4613  putative transcriptional regulator  57.43 
 
 		 105 aa  117  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105662  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4243  hypothetical protein  57.43 
 
 		 105 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.653157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4763  putative transcriptional regulator  57.43 
 
 		 106 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.888831 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2121  putative transcriptional regulator  53.47 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381813  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0611  hypothetical protein  47.66 
 
 		 107 aa  99.4  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2733  putative addiction module antidote protein  46 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1308  hypothetical protein  39.6 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1244  putative transcriptional regulator  47.73 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1837  hypothetical protein  43.01 
 
 		 112 aa  87.8  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.487902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3916  putative transcriptional regulator  43.14 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0085  putative transcriptional regulator  41 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0133229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2162  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4220  putative transcriptional regulator  31.68 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3350  putative transcriptional regulator  31.91 
 
 		 103 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000971437  normal  0.44522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>