73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4433 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4433  putative secreted protein  100 
 
 		 456 aa  919    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5580  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  69.8 
 
 		 454 aa  590  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.216169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0215  FAD dependent oxidoreductase  51.01 
 
 		 461 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31150  predicted flavoprotein involved in K+ transport  53.95 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3968  putative secreted protein  53.95 
 
 		 471 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2664  FAD dependent oxidoreductase  52.8 
 
 		 469 aa  418  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.312794 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20640  predicted flavoprotein involved in K+ transport  52.71 
 
 		 445 aa  416  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2824  putative secreted protein  52 
 
 		 434 aa  416  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000320081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4494  FAD dependent oxidoreductase  52.01 
 
 		 497 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5420  peptidase M28  52.71 
 
 		 759 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5388  hypothetical protein  52.39 
 
 		 497 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.836925 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0491  putative secreted protein  51.42 
 
 		 442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.557895  hitchhiker  0.0044003 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0225  FAD dependent oxidoreductase  52.56 
 
 		 453 aa  405  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0385  FAD dependent oxidoreductase  50.35 
 
 		 468 aa  403  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4717  FAD dependent oxidoreductase  51.74 
 
 		 476 aa  403  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3656  FAD dependent oxidoreductase  50.59 
 
 		 468 aa  402  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4964  hypothetical protein  50.71 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0874599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14630  predicted flavoprotein involved in K+ transport  50.24 
 
 		 461 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1915  putative secreted protein  49.25 
 
 		 451 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0518  putative secreted protein  51.69 
 
 		 445 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312569  hitchhiker  0.00121431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8611  peptidase M28  47.95 
 
 		 764 aa  388  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0628073  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2281  FAD dependent oxidoreductase  49.66 
 
 		 494 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.901195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0633  FAD dependent oxidoreductase  52.07 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3218  secreted protein  50.12 
 
 		 441 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0074  FAD dependent oxidoreductase  51.11 
 
 		 405 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.88 
 
 		 362 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  29.33 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.19 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.26 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0446  HI0933 family protein  23.22 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1550  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.77 
 
 		 326 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07290  predicted flavoprotein involved in K+ transport  27.78 
 
 		 447 aa  62  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3795  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.04 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000252573  hitchhiker  0.00000000266911 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1376  thioredoxin reductase  23.62 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0895595  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1656  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.2 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000378104  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1377  thioredoxin reductase  23.95 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1589  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  23.95 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75583e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1405  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  23.81 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0297448  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4167  flavin-containing monooxygenase  25.22 
 
 		 480 aa  59.7  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1515  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  23.81 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000898092  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1910  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.25 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000326035  hitchhiker  0.0000549651 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1621  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  22.67 
 
 		 326 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00734465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4968  putative flavoprotein  26.29 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2182  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.82 
 
 		 326 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.61 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.54 
 
 		 326 aa  56.6  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617769  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.83 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2147  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.67 
 
 		 331 aa  53.5  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00308891  normal  0.0129855 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1217  hypothetical protein  24.7 
 
 		 327 aa  53.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000500941  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3364  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.6 
 
 		 363 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0250  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 		 422 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4033  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.56 
 
 		 527 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909721  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  27.98 
 
 		 360 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1222  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.81 
 
 		 427 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214163 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5399  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.34 
 
 		 422 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1280  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.06 
 
 		 330 aa  47.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0063  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.56 
 
 		 422 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  23.44 
 
 		 361 aa  47  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1908  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.59 
 
 		 357 aa  47  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4106  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.77 
 
 		 536 aa  47  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15738  normal  0.0839405 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17607  predicted protein  28.78 
 
 		 431 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0505566  normal  0.490824 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.4 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2381  oxidoreductase  27.71 
 
 		 374 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222759  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2494  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.05 
 
 		 335 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2384  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25 
 
 		 378 aa  45.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0867216 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2127  monooxygenase FAD-binding protein  25.97 
 
 		 524 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00953551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.26 
 
 		 372 aa  44.3  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0541  hypothetical protein  23.64 
 
 		 558 aa  43.9  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.9586 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4019  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.57 
 
 		 413 aa  43.9  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 642 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 642 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3273  flavin-containing monooxygenase FMO  29.76 
 
 		 468 aa  43.5  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.304511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.48 
 
 		 348 aa  43.5  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>