More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4431 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 291 aa  595  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0875  protein tyrosine phosphatase  80 
 
 		 189 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0325  protein tyrosine phosphatase  79.17 
 
 		 175 aa  289  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0618  protein tyrosine phosphatase  77.98 
 
 		 175 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3124  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  76.02 
 
 		 180 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.641523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  47.26 
 
 		 298 aa  277  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3200  protein tyrosine phosphatase  74.7 
 
 		 182 aa  273  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4073  protein tyrosine phosphatase  73.21 
 
 		 175 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713797  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3419  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  71.26 
 
 		 175 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  72.67 
 
 		 179 aa  261  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  45.82 
 
 		 295 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  69.54 
 
 		 175 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  66.67 
 
 		 175 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  66.67 
 
 		 175 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  64.37 
 
 		 175 aa  249  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2415  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  66.08 
 
 		 176 aa  248  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.214614 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  45.52 
 
 		 287 aa  247  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5056  protein tyrosine phosphatase  63.1 
 
 		 175 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  61.68 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1641  protein tyrosine phosphatase  42.49 
 
 		 309 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  65.64 
 
 		 169 aa  238  5.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0216  protein tyrosine phosphatase  60.59 
 
 		 178 aa  235  6e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  44.6 
 
 		 270 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 270 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 276 aa  231  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  41.47 
 
 		 317 aa  228  9e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5707  protein tyrosine phosphatase  61.96 
 
 		 164 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2540  protein tyrosine phosphatase  61.49 
 
 		 179 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.232269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  57.41 
 
 		 165 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  60.74 
 
 		 164 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  61.96 
 
 		 164 aa  218  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  61.35 
 
 		 165 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  61.49 
 
 		 165 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1787  protein tyrosine phosphatase  61.08 
 
 		 179 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981569 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00628  arsenate reductase  59.51 
 
 		 176 aa  216  5e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.102158  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  58.9 
 
 		 164 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  60.76 
 
 		 162 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  60.12 
 
 		 164 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  60.12 
 
 		 164 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  59.26 
 
 		 165 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.14 
 
 		 175 aa  212  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99461  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5722  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  57.14 
 
 		 175 aa  212  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  58.64 
 
 		 165 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  59.63 
 
 		 171 aa  210  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  57.06 
 
 		 170 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  57.41 
 
 		 164 aa  209  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0207  protein tyrosine phosphatase  57.67 
 
 		 173 aa  209  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.538928 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 284 aa  205  6e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6165  protein tyrosine phosphatase  61.96 
 
 		 164 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.237527 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  54.22 
 
 		 173 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  54.94 
 
 		 165 aa  195  7e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  56.33 
 
 		 164 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  52.83 
 
 		 177 aa  186  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  53.99 
 
 		 166 aa  185  8e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  59.06 
 
 		 168 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.261916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4381  protein tyrosine phosphatase  51.19 
 
 		 171 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2966  protein tyrosine phosphatase  45.68 
 
 		 165 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  52.98 
 
 		 159 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2588  protein tyrosine phosphatase  50.92 
 
 		 167 aa  172  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.570758  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1344  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.32 
 
 		 165 aa  169  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1532  transcriptional regulator, ArsR family  36.12 
 
 		 306 aa  168  9e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  49.68 
 
 		 165 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3466  protein tyrosine phosphatase  47.31 
 
 		 168 aa  166  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1594  protein tyrosine phosphatase  51.27 
 
 		 167 aa  157  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0653  protein tyrosine phosphatase  53.33 
 
 		 168 aa  155  7e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.448039  normal  0.447799 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1980  protein tyrosine phosphatase  52.53 
 
 		 163 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221335  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4198  ArsR family transcriptional regulator  64.91 
 
 		 124 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2244  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 110 aa  149  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908668  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4667  protein tyrosine phosphatase  43.21 
 
 		 167 aa  148  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4774  protein tyrosine phosphatase  43.21 
 
 		 167 aa  148  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.98 
 
 		 167 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  43.98 
 
 		 167 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4074  transcriptional regulator, ArsR family  66.67 
 
 		 118 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570943  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2140  ArsR family transcriptional regulator  62.04 
 
 		 117 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5578  ArsR family transcriptional regulator  66.36 
 
 		 111 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151543 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2141  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.12 
 
 		 159 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0619  ArsR family transcriptional regulator  63.89 
 
 		 113 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  46.88 
 
 		 158 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0959  arsenate reductase  46.25 
 
 		 164 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5673  protein tyrosine phosphatase  46.25 
 
 		 164 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  46.25 
 
 		 158 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5346  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45 
 
 		 164 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.524005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3255  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.17 
 
 		 172 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1820  protein tyrosine phosphatase  44.38 
 
 		 164 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.102898 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6562  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 		 168 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3579  protein tyrosine phosphatase  44.38 
 
 		 164 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.747703 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6164  protein tyrosine phosphatase  45.62 
 
 		 164 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.398136 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5600  protein tyrosine phosphatase  46.88 
 
 		 164 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  57.89 
 
 		 114 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0558  arsenate reductase  45.96 
 
 		 164 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0569825  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0456  arsenate reductase  45.62 
 
 		 164 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0913  arsenate reductase  45.96 
 
 		 164 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.910789  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2037  arsenate reductase ArsC  45.62 
 
 		 164 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2337  protein tyrosine phosphatase  45.96 
 
 		 167 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.441606 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4965  protein tyrosine phosphatase  45.62 
 
 		 172 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219963  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6329  protein tyrosine phosphatase  46.88 
 
 		 164 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720558  normal  0.0816451 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1882  arsenate reductase  45.96 
 
 		 164 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3195  protein tyrosine phosphatase  45.62 
 
 		 172 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1942  arsenate reductase ArsC  45.62 
 
 		 164 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5765  protein tyrosine phosphatase  47.5 
 
 		 164 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>