157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4417 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4417  mercuric transport protein periplasmic protein  100 
 
 		 94 aa  192  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192588  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3158  heavy metal transport/detoxification protein  42.55 
 
 		 97 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299489  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  41.49 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0798  heavy metal transport/detoxification protein  42.55 
 
 		 98 aa  84.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.885696 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  47.87 
 
 		 91 aa  83.6  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  54.29 
 
 		 91 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  54.29 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  54.29 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  54.29 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  54.29 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  54.29 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  54.29 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  54.29 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  54.29 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4796  mercuric transport protein periplasmic protein  45.78 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3490  mercuric transport protein periplasmic component  45.88 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  53.62 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4012  mercuric transport protein periplasmic component  44.44 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  45.05 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0169  mercuric transport protein periplasmic component  50.67 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  51.43 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  50 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  52.86 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  51.43 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  43.68 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  50 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  53.62 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  52.86 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  45.95 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0484  mercuric transport protein periplasmic component  39.36 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  47.14 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  47.14 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  47.3 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  50 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0239  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  45.26 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  47.14 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  50.75 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02043  Mercury scavenger protein:Heavy-metal-associated domain  40.24 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525841  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2684  heavy metal transport/detoxification protein  41.56 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  37.14 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  36.11 
 
 		 1087 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02958  putative mercuric transport protein periplasmic binding protein  40.35 
 
 		 61 aa  50.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  32.81 
 
 		 818 aa  50.8  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  26.09 
 
 		 803 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  26.09 
 
 		 803 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  26.09 
 
 		 803 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  30.3 
 
 		 794 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  25.71 
 
 		 799 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  32.43 
 
 		 954 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 925 aa  48.9  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  29.03 
 
 		 758 aa  48.5  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  28.99 
 
 		 791 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  31.71 
 
 		 836 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2066  mercuric transport protein periplasmic component  32.1 
 
 		 85 aa  47.4  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.131974  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 801 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  26.87 
 
 		 799 aa  47  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4424  heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 		 71 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  28.79 
 
 		 795 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  39.34 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  26.87 
 
 		 799 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  26.87 
 
 		 799 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  25.37 
 
 		 799 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  26.87 
 
 		 799 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  26.87 
 
 		 799 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6742  Heavy metal transport/detoxification protein  32.76 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  32.35 
 
 		 753 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  30.16 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  35.48 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  35.94 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  31.25 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  32.81 
 
 		 805 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0959  heavy metal translocating P-type ATPase  34.92 
 
 		 761 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  23.61 
 
 		 828 aa  45.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0117  mercuric transport protein periplasmic component  30.67 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  32.31 
 
 		 699 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  31.82 
 
 		 837 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0267  copper-translocating P-type ATPase  22.54 
 
 		 797 aa  44.7  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.594062  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  23.88 
 
 		 813 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  22.73 
 
 		 806 aa  44.3  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  36.21 
 
 		 806 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  25.81 
 
 		 817 aa  43.9  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2185  heavy metal translocating P-type ATPase  28.38 
 
 		 754 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  30.56 
 
 		 825 aa  43.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  29.73 
 
 		 798 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1637  copper(heavy metal)-transporting P-type ATPase  31.82 
 
 		 786 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337983  hitchhiker  0.000242946 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  29.69 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  30 
 
 		 861 aa  42.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4541  heavy metal transport/detoxification protein  30.3 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  30.77 
 
 		 837 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  31.25 
 
 		 68 aa  42.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0485  heavy metal translocating P-type ATPase  30 
 
 		 724 aa  43.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.265664  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  29.73 
 
 		 798 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2679  heavy metal translocating P-type ATPase  30 
 
 		 857 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 867 aa  42.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  24.64 
 
 		 839 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  31.75 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  31.25 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1652  heavy metal translocating P-type ATPase  32.84 
 
 		 795 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0504761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  30.38 
 
 		 938 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  34.48 
 
 		 806 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>