49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4292 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007959  Nham_4292  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  702    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1847  hypothetical protein  65.36 
 
 
361 aa  434  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.283474 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0784  hypothetical protein  63.25 
 
 
368 aa  421  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7702  hypothetical protein  60.36 
 
 
347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119439 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2334  hypothetical protein  60.77 
 
 
359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.937968  normal  0.0991632 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5265  hypothetical protein  37.94 
 
 
348 aa  197  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00288645  unclonable  0.000020149 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1776  hypothetical protein  38.62 
 
 
326 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1420  Domain of unknown function DUF1814  35.67 
 
 
338 aa  184  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2490  hypothetical protein  34.66 
 
 
346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0394  hypothetical protein  34.51 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0434  hypothetical protein  34.64 
 
 
339 aa  172  9e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421274  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1625  hypothetical protein  34.66 
 
 
339 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3050  hypothetical protein  36.07 
 
 
345 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.818716 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4355  hypothetical protein  36.42 
 
 
341 aa  165  9e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678013  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0218  hypothetical protein  34.65 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0281  hypothetical protein  36.18 
 
 
328 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1821  hypothetical protein  32.42 
 
 
327 aa  154  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0754  hypothetical protein  31.21 
 
 
332 aa  145  1e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0890  hypothetical protein  32.25 
 
 
337 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000838663  hitchhiker  0.00000000010514 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf137  hypothetical protein  30 
 
 
346 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0341957  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1328  hypothetical protein  31.23 
 
 
348 aa  132  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261253  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1225  hypothetical protein  31.32 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3510  hypothetical protein  31.32 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0233034  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3046  hypothetical protein  31.23 
 
 
338 aa  122  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137225  normal  0.0781322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3057  protein of unknown function DUF1814  31.9 
 
 
338 aa  122  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0052  hypothetical protein  26.07 
 
 
355 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.962002  unclonable  0.0000116494 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3786  hypothetical protein  27.44 
 
 
335 aa  98.2  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1960  hypothetical protein  25.07 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.220534 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0294  hypothetical protein  29.36 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2171  hypothetical protein  27.39 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690317  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5493  hypothetical protein  26.45 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595144  normal  0.225489 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1569  hypothetical protein  29.05 
 
 
321 aa  59.7  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110325  normal  0.0638438 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2690  hypothetical protein  52.94 
 
 
187 aa  57  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_002950  PG0848  hypothetical protein  41.18 
 
 
332 aa  56.6  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264923 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2408  hypothetical protein  45.21 
 
 
308 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0200  hypothetical protein  25.69 
 
 
315 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06811  hypothetical protein  28.7 
 
 
313 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5328  hypothetical protein  54.17 
 
 
83 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4457  hypothetical protein  27.35 
 
 
313 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4161  hypothetical protein  25 
 
 
313 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.162977 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1969  hypothetical protein  58.33 
 
 
296 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0717  hypothetical protein  58.33 
 
 
299 aa  47.8  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0716673  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2452  hypothetical protein  26.83 
 
 
308 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.48779  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2544  hypothetical protein  25.98 
 
 
318 aa  46.2  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4391  hypothetical protein  37.88 
 
 
78 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4654  Domain of unknown function DUF1814  25.94 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.929553  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0213  hypothetical protein  37.5 
 
 
315 aa  44.3  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.703328  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  39.34 
 
 
399 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3417  hypothetical protein  26.25 
 
 
315 aa  42.7  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>