More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3991 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  72.82 
 
 		 674 aa  932    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  73.27 
 
 		 666 aa  950    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  78.95 
 
 		 651 aa  1016    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  96.09 
 
 		 591 aa  1103    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  100 
 
 		 642 aa  1299    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  77.37 
 
 		 660 aa  986    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  38.43 
 
 		 588 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  36.66 
 
 		 578 aa  371  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  37.82 
 
 		 606 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  34.74 
 
 		 630 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  35.89 
 
 		 575 aa  364  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  35.71 
 
 		 579 aa  365  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  36.43 
 
 		 586 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  35.63 
 
 		 595 aa  357  3.9999999999999996e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  35.73 
 
 		 636 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  34.73 
 
 		 589 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  35.52 
 
 		 614 aa  351  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  35.52 
 
 		 614 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  33.93 
 
 		 583 aa  350  6e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  34.03 
 
 		 589 aa  349  8e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  34.75 
 
 		 589 aa  349  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  34.57 
 
 		 589 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  34.57 
 
 		 589 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  35.46 
 
 		 577 aa  346  8e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  37.03 
 
 		 596 aa  345  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  34.37 
 
 		 592 aa  345  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  34.4 
 
 		 589 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  34.4 
 
 		 589 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  38.07 
 
 		 596 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  34.77 
 
 		 614 aa  343  7e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  35.09 
 
 		 621 aa  342  9e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  34.22 
 
 		 610 aa  341  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  34.02 
 
 		 583 aa  340  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  35.02 
 
 		 613 aa  339  8e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  32.8 
 
 		 590 aa  339  9e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  36.19 
 
 		 614 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.85 
 
 		 588 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0863  ABC transporter domain protein  33.98 
 
 		 602 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.85 
 
 		 588 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  31.85 
 
 		 588 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  31.85 
 
 		 588 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  31.85 
 
 		 588 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  35.27 
 
 		 593 aa  337  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.85 
 
 		 588 aa  336  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.53 
 
 		 584 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  35.53 
 
 		 713 aa  334  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  32.17 
 
 		 588 aa  331  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  34.81 
 
 		 577 aa  329  9e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  35.54 
 
 		 708 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07140  ABC-type transport system permease and ATPase component  35.58 
 
 		 588 aa  328  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377405  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  33.57 
 
 		 587 aa  326  8.000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.57 
 
 		 587 aa  326  8.000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  35.93 
 
 		 588 aa  323  4e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  34.26 
 
 		 712 aa  323  7e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  34.81 
 
 		 572 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  33.46 
 
 		 704 aa  320  6e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  33.46 
 
 		 712 aa  318  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  33.15 
 
 		 563 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6480  putative ABC transporter-like protein  42.23 
 
 		 374 aa  317  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3300  ABC transporter component  32.67 
 
 		 629 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  35.06 
 
 		 701 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  33.27 
 
 		 704 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0407  ABC transporter domain protein  33.33 
 
 		 609 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  34.21 
 
 		 602 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  33.77 
 
 		 626 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  34.29 
 
 		 615 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  32.9 
 
 		 605 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  32.65 
 
 		 595 aa  300  5e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1444  putative transporter  31.74 
 
 		 621 aa  300  6e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1490  transporter, putative  31.74 
 
 		 621 aa  298  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00776533  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6112  ABC transporter  34.7 
 
 		 603 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  33.69 
 
 		 597 aa  295  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.18 
 
 		 598 aa  288  2e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0762  ABC transporter domain protein  30.56 
 
 		 557 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  30.05 
 
 		 599 aa  280  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1678  ABC transporter  31.01 
 
 		 623 aa  279  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  29.59 
 
 		 634 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  29.59 
 
 		 636 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  29.59 
 
 		 636 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3285  ABC transporter domain protein  30.58 
 
 		 553 aa  272  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  31.07 
 
 		 606 aa  272  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0999  ABC transporter domain protein  30.66 
 
 		 557 aa  272  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4135  ABC transporter domain protein  29.47 
 
 		 616 aa  271  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3628  ABC transporter-like  41.28 
 
 		 368 aa  270  8e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.519453 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3806  ABC transporter domain protein  29.55 
 
 		 621 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4936  ABC transporter  30.21 
 
 		 606 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00595955  normal  0.404726 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1935  SbmABacA family protein  39.83 
 
 		 370 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00585773  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3329  ABC transporter domain protein  31.42 
 
 		 560 aa  263  6.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46957  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0401  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.42 
 
 		 549 aa  258  4e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1839  ABC transporter-like  38.14 
 
 		 370 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1153  ABC transporter domain protein  32.32 
 
 		 600 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  28.16 
 
 		 635 aa  253  8.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4264  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  31.45 
 
 		 590 aa  252  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26783  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3164  ABC transporter  30.84 
 
 		 637 aa  252  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0211349  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00741  ABC transporter, ATP binding protein  28.85 
 
 		 660 aa  251  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0414  ATPase  30.62 
 
 		 668 aa  250  6e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5526  ABC transporter domain protein  31.77 
 
 		 587 aa  250  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2266  ATPase  31.18 
 
 		 658 aa  249  9e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0603  ABC transporter domain protein  31.42 
 
 		 596 aa  248  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0045  ABC transporter related  31.45 
 
 		 603 aa  248  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.315535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>