More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3887 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3887  transposase and inactivated derivatives-like  100 
 
 
159 aa  324  3e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2723  transposase  72.26 
 
 
278 aa  213  8e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1516  transposase  69.29 
 
 
155 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000901258  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3993  hypothetical protein  61.43 
 
 
202 aa  180  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3994  transposase and inactivated derivatives-like  58.57 
 
 
167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  53.91 
 
 
275 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  52.76 
 
 
278 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  52.76 
 
 
278 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  52.76 
 
 
278 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  52.76 
 
 
278 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  52.76 
 
 
278 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  52.76 
 
 
278 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  52.76 
 
 
278 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  52.76 
 
 
278 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  52.76 
 
 
278 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  52.76 
 
 
278 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  52.76 
 
 
278 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  52.76 
 
 
278 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  50.39 
 
 
270 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  50.39 
 
 
270 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0762  transposase IS4 family protein  50.39 
 
 
276 aa  136  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0641157  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  50.39 
 
 
268 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  50 
 
 
268 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4299  transposase  48.06 
 
 
197 aa  130  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0095  transposase, IS4 family protein  45.52 
 
 
293 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7602  transposase IS4 family protein  46.51 
 
 
270 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0954844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  45.74 
 
 
270 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  45.74 
 
 
270 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  45.74 
 
 
270 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  45.74 
 
 
270 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  45.74 
 
 
270 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  45.74 
 
 
270 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  45.74 
 
 
270 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  45.74 
 
 
270 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4119  transposase (IS12528)  45.06 
 
 
158 aa  123  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  46.88 
 
 
275 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  46.46 
 
 
274 aa  121  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6121  transposase IS4 family protein  44.53 
 
 
285 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0640  transposase IS4 family protein  44.53 
 
 
285 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2970  transposase IS4 family protein  44.53 
 
 
285 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0996557  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0928  transposase IS4 family protein  44.53 
 
 
285 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3566  transposase IS4 family protein  44.53 
 
 
285 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4866  transposase IS4 family protein  44.53 
 
 
285 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2551  transposase IS4 family protein  44.53 
 
 
285 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2689  transposase IS4 family protein  44.53 
 
 
285 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7344  transposase IS4 family protein  44.53 
 
 
285 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.298249  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8348  transposase IS4 family protein  44.53 
 
 
285 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2130  transposase IS4 family protein  44.53 
 
 
285 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2057  transposase IS4 family protein  44.53 
 
 
285 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3172  transposase IS4 family protein  44.53 
 
 
285 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274385  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8548  transposase IS4 family protein  44.53 
 
 
285 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.303923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6956  transposase IS4 family protein  44.53 
 
 
285 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8570  transposase IS4 family protein  44.53 
 
 
285 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7484  transposase IS4 family protein  44.53 
 
 
285 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0942  transposase IS4 family protein  44.53 
 
 
285 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  43.75 
 
 
276 aa  119  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0080  transposase  47.32 
 
 
127 aa  118  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0800  transposase  47.32 
 
 
127 aa  118  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1018  transposase  47.32 
 
 
127 aa  118  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1364  transposase  47.32 
 
 
127 aa  118  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906746  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2641  transposase  47.32 
 
 
127 aa  118  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3317  transposase  47.32 
 
 
127 aa  118  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000684443  normal  0.351726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3800  transposase  47.32 
 
 
127 aa  118  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176127  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7626  transposase IS4 family protein  44.53 
 
 
298 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3641  transposase  44.07 
 
 
127 aa  115  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.336877  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0073  transposase  44.44 
 
 
127 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1440  transposase  46.43 
 
 
129 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.624391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2487  transposase  46.43 
 
 
129 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5096  transposase  44.07 
 
 
127 aa  114  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3503  transposase  43.22 
 
 
127 aa  113  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5118  transposase  43.22 
 
 
127 aa  112  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000360467  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  44.19 
 
 
273 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  44.19 
 
 
273 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0169  transposase  45.37 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.103763  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4932  transposase  43.22 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.333963  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5164  transposase  43.59 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0453  transposase  42.37 
 
 
127 aa  111  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347908  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1824  transposase  43.22 
 
 
127 aa  111  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.312026  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4253  transposase  43.22 
 
 
127 aa  110  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2007  transposase  43.22 
 
 
127 aa  111  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4525  transposase  42.37 
 
 
127 aa  111  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0339658  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2176  transposase  43.22 
 
 
127 aa  110  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.61073  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3939  transposase  41.53 
 
 
127 aa  110  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1623  transposase  41.53 
 
 
127 aa  109  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180817  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3169  transposase  43.64 
 
 
127 aa  109  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2319  transposase  41.53 
 
 
127 aa  110  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74544  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2123  transposase  41.53 
 
 
127 aa  109  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00183636  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2752  transposase  41.88 
 
 
127 aa  109  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.283972  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3551  transposase  42.74 
 
 
127 aa  109  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.402831  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2849  transposase  41.53 
 
 
127 aa  108  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  48.03 
 
 
278 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4410  transposase  42.37 
 
 
127 aa  108  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4400  transposase  42.74 
 
 
127 aa  108  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0121256  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0725  transposase  42.37 
 
 
127 aa  108  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.569025  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  43.2 
 
 
308 aa  108  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2961  transposase IS4 family protein  44.54 
 
 
250 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3379  transposase IS4 family protein  41.41 
 
 
285 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3289  transposase  41.53 
 
 
127 aa  107  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2118  transposase  41.53 
 
 
127 aa  107  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00219544  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  50.48 
 
 
271 aa  107  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>