More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3783 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  100 
 
 		 946 aa  1939    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4048  histidine kinase  26.99 
 
 		 773 aa  197  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  26.38 
 
 		 738 aa  186  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3949  histidine kinase  25.92 
 
 		 679 aa  164  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4625  histidine kinase  25.53 
 
 		 756 aa  159  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2565  histidine kinase  25.4 
 
 		 796 aa  145  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1575  histidine kinase  25.17 
 
 		 684 aa  144  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000414678  decreased coverage  0.0000074807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0749  histidine kinase  24.11 
 
 		 722 aa  127  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0570  ATPase domain-containing protein  27.61 
 
 		 720 aa  125  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36080  ATP binding/ATPase (HATPase_c) domain-containing protein  25.13 
 
 		 723 aa  121  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785122  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  30.67 
 
 		 771 aa  121  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1181  histidine kinase  22.32 
 
 		 719 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.798724  normal  0.0930045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  27.37 
 
 		 774 aa  108  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  23.89 
 
 		 674 aa  107  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  0.00000000106284 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  26.9 
 
 		 774 aa  106  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5323  histidine kinase  25.06 
 
 		 783 aa  88.2  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.15205 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  28.81 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07091  histidine kinase  27.17 
 
 		 637 aa  79.7  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000651793  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 595 aa  75.1  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.67 
 
 		 598 aa  74.7  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0504  signal transduction protein, histidine kinase  36.96 
 
 		 997 aa  74.3  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.284164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  24.65 
 
 		 463 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.57 
 
 		 546 aa  72.4  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0429  ATP-binding region ATPase domain protein  25.97 
 
 		 568 aa  72.4  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.796172  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1179  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.9 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1706  histidine kinase  30.36 
 
 		 444 aa  70.5  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2683  ATP-binding region ATPase domain protein  31.68 
 
 		 746 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.301078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  25 
 
 		 463 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3050  histidine kinase  24.5 
 
 		 398 aa  70.1  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 590 aa  70.1  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1302  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.11 
 
 		 871 aa  69.7  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465043  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  29.27 
 
 		 586 aa  69.7  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 1002 aa  68.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  28.16 
 
 		 588 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27 
 
 		 1041 aa  68.6  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73134 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  24.66 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  24.66 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  24.66 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  34.96 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0969  histidine kinase  27.76 
 
 		 801 aa  67.8  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000115814  hitchhiker  0.0000040144 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.02 
 
 		 640 aa  67.8  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 590 aa  67.8  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0937  histidine kinase  32.77 
 
 		 471 aa  67.8  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001013  signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 		 624 aa  67.8  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 892 aa  67.4  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  25.35 
 
 		 450 aa  67.4  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  24.66 
 
 		 462 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0764  sensor protein KdpD  26.36 
 
 		 894 aa  67.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0214  histidine kinase  29.48 
 
 		 657 aa  67.4  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 1741 aa  67.4  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0909  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 661 aa  67.4  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.310959  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 379 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2568  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 661 aa  67.4  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.957334  normal  0.86605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0825  sensor protein KdpD  26.36 
 
 		 894 aa  67.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0325382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 		 496 aa  67.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.739503  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0811  sensor protein KdpD  26.36 
 
 		 894 aa  67.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00623216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2272  putative two-component sensor  35.94 
 
 		 433 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0751  sensor protein KdpD  26.36 
 
 		 894 aa  67.4  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1720  flagellar regulatory protein B  24.37 
 
 		 351 aa  67.8  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00341718  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1124  histidine kinase  27.55 
 
 		 483 aa  67.8  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.7316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 486 aa  67.8  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112539 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0721  sensor protein KdpD  26.23 
 
 		 894 aa  67.8  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.594911  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2921  sensor histidine kinase  23.81 
 
 		 475 aa  66.6  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3516  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.13 
 
 		 614 aa  66.6  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.166046 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1103  histidine kinase  28.21 
 
 		 360 aa  66.6  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 395 aa  66.6  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 359 aa  67  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0754  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.21 
 
 		 492 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.499334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  27.23 
 
 		 630 aa  67  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26810  putative two-component sensor  35.94 
 
 		 371 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0376  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 412 aa  67  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00652  fused sensory histidine kinase in two-component regulatory system with KdpE: signal sensing protein  26.03 
 
 		 895 aa  66.2  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02448  predicted sensory kinase in two-component system  23.81 
 
 		 475 aa  66.2  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2941  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 894 aa  66.2  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0244  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 661 aa  66.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0742  sensor protein KdpD  26.03 
 
 		 894 aa  66.2  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1121  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.81 
 
 		 475 aa  66.2  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2646  two-component sensor histidine kinase  30.97 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.682942 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1195  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.83 
 
 		 870 aa  66.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.98844  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0692  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 620 aa  66.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02412  hypothetical protein  23.81 
 
 		 475 aa  66.2  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0554  sensor protein KdpD  26.03 
 
 		 894 aa  66.2  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5222  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.97 
 
 		 601 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2709  sensor histidine kinase  23.81 
 
 		 475 aa  66.2  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0717  sensor protein KdpD  26.03 
 
 		 894 aa  66.2  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.649763  normal  0.772603 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00643  hypothetical protein  26.03 
 
 		 894 aa  66.2  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5356  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.940445 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2202  DNA mismatch repair ATPase-like protein  25.15 
 
 		 651 aa  66.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000849326  normal  0.525867 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2138  PAS sensor protein  26.56 
 
 		 516 aa  66.2  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0788  sensor protein KdpD  26.03 
 
 		 894 aa  66.2  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  24.32 
 
 		 463 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2841  sensor histidine kinase  23.81 
 
 		 460 aa  65.9  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1321  ATP-binding region, ATPase-like protein  23.48 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3790  sensor histidine kinase  23.53 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2440  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.467167  normal  0.627522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>