168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3732 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3732  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  100 
 
 
161 aa  329  8e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2686  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  86.34 
 
 
161 aa  283  5e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579754  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4747  Redoxin domain protein  85.09 
 
 
161 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4027  peroxiredoxin-like protein  83.23 
 
 
163 aa  278  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4075  peroxiredoxin-like protein  82.61 
 
 
161 aa  277  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.896251  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1343  peroxiredoxin-like protein  82.61 
 
 
161 aa  274  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255262  normal  0.595774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0951  putative peroxiredoxin  82.07 
 
 
145 aa  246  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.148763  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2596  redoxin domain-containing protein  57.76 
 
 
161 aa  192  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0683  redoxin domain-containing protein  57.14 
 
 
162 aa  191  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.804383  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6935  Redoxin domain protein  57.14 
 
 
160 aa  190  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0478  ahpC/TSA family protein  57.14 
 
 
161 aa  187  7e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1257  Redoxin domain protein  54.04 
 
 
161 aa  186  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0483  thiol peroxidase  56.52 
 
 
161 aa  186  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6266  redoxin domain-containing protein  55.9 
 
 
160 aa  185  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2623  Redoxin domain protein  55.06 
 
 
160 aa  184  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2595  redoxin domain-containing protein  55.06 
 
 
160 aa  183  9e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2818  Redoxin domain protein  55.06 
 
 
160 aa  183  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.219456 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0592  redoxin domain-containing protein  54.66 
 
 
161 aa  179  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3915  redoxin domain-containing protein  54.49 
 
 
159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.145792 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0751  redoxin  50.93 
 
 
161 aa  176  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2222  redoxin domain-containing protein  53.42 
 
 
160 aa  176  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.641019  decreased coverage  0.00328049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4490  redoxin domain-containing protein  54.04 
 
 
160 aa  174  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.93 
 
 
167 aa  169  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566279  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0530  redoxin domain-containing protein  52.8 
 
 
161 aa  168  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2670  redoxin domain-containing protein  50.93 
 
 
160 aa  167  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656448  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0661  Redoxin domain protein  51.55 
 
 
161 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.165122 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1067  peroxiredoxin  50.93 
 
 
161 aa  164  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0619  Redoxin domain protein  50.63 
 
 
161 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5126  Redoxin domain protein  45.96 
 
 
162 aa  156  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0113  redoxin  50.32 
 
 
160 aa  155  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2472  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  50 
 
 
161 aa  153  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.935379  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1905  redoxin domain-containing protein  47.17 
 
 
161 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441559  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1130  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.83 
 
 
158 aa  150  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0913955  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3947  redoxin domain-containing protein  44.1 
 
 
159 aa  148  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0401  redoxin domain-containing protein  49.11 
 
 
192 aa  147  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3007  redoxin domain-containing protein  45.68 
 
 
162 aa  147  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0266  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.88 
 
 
168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2973  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.77 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00621825  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4903  Redoxin domain protein  49.09 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0899  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.68 
 
 
162 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1274  redoxin domain-containing protein  48.48 
 
 
168 aa  145  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125392  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3433  AhpC/TSA-family protein  44.85 
 
 
169 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313282  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0356  redoxin  49.69 
 
 
159 aa  144  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0213  redoxin domain-containing protein  48.24 
 
 
168 aa  144  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0348  redoxin domain-containing protein  49.09 
 
 
168 aa  144  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.828163  decreased coverage  0.000328891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3989  redoxin domain-containing protein  46.15 
 
 
168 aa  144  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000343004 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2004  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.58 
 
 
159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187894  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2558  redoxin domain-containing protein  45.06 
 
 
162 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4452  glutaredoxin-like region  46.2 
 
 
243 aa  143  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0288  redoxin domain-containing protein  49.1 
 
 
185 aa  143  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000039073 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0966  putative antioxidant  45.91 
 
 
157 aa  143  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.272131  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3020  Redoxin domain protein  44.1 
 
 
160 aa  142  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563791 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0439  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.91 
 
 
162 aa  142  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3785  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.09 
 
 
183 aa  142  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.144432  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0147  redoxin domain-containing protein  48.75 
 
 
158 aa  142  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3464  Redoxin domain protein  44.58 
 
 
167 aa  142  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000691326 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2667  redoxin domain-containing protein  43.37 
 
 
169 aa  141  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000181352  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0492  type 2 peroxiredoxin AhpC/TSAfamily  44.58 
 
 
167 aa  140  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000163064  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  45.86 
 
 
247 aa  141  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0187  Redoxin domain protein  43.98 
 
 
166 aa  140  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000633793  normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3541  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.91 
 
 
157 aa  140  8e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4640  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.91 
 
 
158 aa  140  9e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0469  redoxin domain-containing protein  44.58 
 
 
168 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0173332  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0283  Redoxin domain protein  49.09 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00098707  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2830  redoxin domain-containing protein  44.58 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000266084  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0494  redoxin domain-containing protein  44.58 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570161  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  45.62 
 
 
242 aa  138  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3814  redoxin domain-containing protein  45.91 
 
 
157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.632392  normal  0.0206857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3905  redoxin domain-containing protein  45.91 
 
 
157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105906  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4020  redoxin domain-containing protein  45.91 
 
 
157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3651  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.98 
 
 
168 aa  137  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000135148  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0083  redoxin  43.98 
 
 
168 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000103454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0565  redoxin domain-containing protein  43.98 
 
 
168 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0157246  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0536  redoxin domain-containing protein  43.98 
 
 
168 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397441  normal  0.710427 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3538  AhpC/TSA family protein  43.37 
 
 
214 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0215  redoxin domain-containing protein  45.28 
 
 
157 aa  136  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  45.57 
 
 
249 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06423  peroxiredoxin  45.28 
 
 
157 aa  136  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1324  AhpC/TSA family protein  43.37 
 
 
190 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3519  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.37 
 
 
168 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3544  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.37 
 
 
168 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3239  AhpC/TSA family protein  43.37 
 
 
185 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2544  AhpC/TSA family protein  43.37 
 
 
214 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4981  glutaredoxin-like region  44.52 
 
 
251 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0465  AhpC/TSA family protein  43.37 
 
 
214 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490707  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000593  antioxidant putative  45.28 
 
 
157 aa  135  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000019477  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2838  type 2 peroxiredoxin protein  41.57 
 
 
166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.15733  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  43.67 
 
 
245 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00160  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  44.03 
 
 
157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1124  AhpC/TSA family protein  42.77 
 
 
185 aa  134  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4137  Redoxin domain protein  44.65 
 
 
157 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.797955  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4341  redoxin domain-containing protein  44.65 
 
 
157 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000616907  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4209  redoxin domain-containing protein  44.65 
 
 
157 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205646  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1224  glutaredoxin family protein  47.44 
 
 
248 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.59398  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2464  glutaredoxin family protein  47.44 
 
 
248 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.282108 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3472  glutaredoxin family protein  46.2 
 
 
243 aa  134  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.99974  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0173  redoxin domain-containing protein  42.17 
 
 
166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136902  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.96 
 
 
168 aa  134  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.92238  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3641  redoxin domain-containing protein  45.28 
 
 
178 aa  134  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.731441  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3849  redoxin domain-containing protein  45.28 
 
 
157 aa  133  8e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>