More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3638 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 821 aa  1680    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  37.9 
 
 		 777 aa  467  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  36.72 
 
 		 766 aa  416  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  36.28 
 
 		 753 aa  396  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  36.39 
 
 		 747 aa  388  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  36.21 
 
 		 759 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  35.8 
 
 		 759 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  34.7 
 
 		 773 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  34.82 
 
 		 747 aa  365  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  36.15 
 
 		 760 aa  366  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  34.6 
 
 		 780 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  34.83 
 
 		 768 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  33.74 
 
 		 751 aa  359  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  34.78 
 
 		 748 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  34.28 
 
 		 763 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  34.28 
 
 		 749 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  34.46 
 
 		 748 aa  356  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  34.48 
 
 		 733 aa  354  4e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  34.46 
 
 		 748 aa  354  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  34.46 
 
 		 748 aa  354  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  34.45 
 
 		 747 aa  351  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  34.45 
 
 		 747 aa  351  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  34.24 
 
 		 747 aa  350  5e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  34.1 
 
 		 747 aa  350  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  34.34 
 
 		 742 aa  350  8e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  34.34 
 
 		 742 aa  350  8e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  34.31 
 
 		 747 aa  349  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2044  TonB-dependent receptor  34.27 
 
 		 776 aa  349  1e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  33.79 
 
 		 753 aa  349  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  32.94 
 
 		 732 aa  345  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  33.74 
 
 		 772 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  33.47 
 
 		 731 aa  340  5e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 		 732 aa  340  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  33.64 
 
 		 734 aa  339  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  32.21 
 
 		 753 aa  338  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  35.21 
 
 		 733 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  33.07 
 
 		 745 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 732 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4025  TonB-dependent siderophore receptor  32.82 
 
 		 826 aa  335  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  33.6 
 
 		 733 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  34.17 
 
 		 765 aa  324  3e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  31.49 
 
 		 769 aa  323  8e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  32.27 
 
 		 740 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  34.46 
 
 		 733 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  34.59 
 
 		 733 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3914  TonB-dependent receptor, putative  32.25 
 
 		 730 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0992  TonB-dependent siderophore receptor  30.71 
 
 		 762 aa  311  2.9999999999999997e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221466  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  31.25 
 
 		 741 aa  310  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  32.34 
 
 		 743 aa  309  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  31.12 
 
 		 730 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  30.83 
 
 		 730 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  30.98 
 
 		 730 aa  306  7e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  31.71 
 
 		 731 aa  306  7e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  32.58 
 
 		 736 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  32.72 
 
 		 734 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  30.83 
 
 		 730 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  32.45 
 
 		 707 aa  304  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  31.4 
 
 		 731 aa  303  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 		 731 aa  301  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00772  predicted iron outer membrane transporter  31.92 
 
 		 760 aa  298  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00789  hypothetical protein  31.92 
 
 		 760 aa  298  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0829  catecholate siderophore receptor Fiu  31.92 
 
 		 760 aa  298  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3335  TonB-dependent receptor, plug  30.02 
 
 		 794 aa  298  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1948  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 815 aa  297  5e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0873  catecholate siderophore receptor Fiu  31.65 
 
 		 760 aa  296  9e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0954  catecholate siderophore receptor Fiu  31.65 
 
 		 760 aa  296  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.691601  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2837  TonB-dependent siderophore receptor  31.65 
 
 		 760 aa  296  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0860  catecholate siderophore receptor Fiu  31.65 
 
 		 760 aa  296  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2838  catecholate siderophore receptor Fiu  31.65 
 
 		 760 aa  296  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.167931 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1173  TonB-dependent siderophore receptor  31.17 
 
 		 741 aa  292  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  31.17 
 
 		 724 aa  291  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  30.62 
 
 		 727 aa  290  6e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  32.43 
 
 		 719 aa  283  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  32.59 
 
 		 694 aa  282  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  31.35 
 
 		 770 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  31.35 
 
 		 710 aa  281  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  31.93 
 
 		 792 aa  280  8e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  32.31 
 
 		 715 aa  280  9e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2088  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 793 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0823412 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 		 771 aa  280  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0044  TonB-dependent siderophore receptor  31.05 
 
 		 794 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3969  TonB-dependent siderophore receptor  29.79 
 
 		 793 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  30.94 
 
 		 710 aa  278  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0837  TonB-dependent siderophore receptor  31.21 
 
 		 759 aa  278  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213171  normal  0.109269 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1708  catecholate siderophore receptor Fiu  31.37 
 
 		 779 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1637  catecholate siderophore receptor Fiu  31.37 
 
 		 763 aa  276  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.824429  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1078  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 748 aa  274  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4373  TonB-dependent siderophore receptor  30.76 
 
 		 751 aa  271  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0576  catecholate siderophore receptor Fiu  32.92 
 
 		 754 aa  270  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000714833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1314  putative TonB-dependent receptor protein  29.16 
 
 		 843 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3540  putative outer membrane TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 805 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0614736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3225  TonB-dependent siderophore receptor  31.21 
 
 		 803 aa  263  8.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  29.27 
 
 		 755 aa  261  4e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0376  TonB-dependent siderophore receptor  30.96 
 
 		 769 aa  260  7e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1513  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 859 aa  260  9e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.691941  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0700  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 785 aa  253  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.241055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 		 724 aa  252  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  29.47 
 
 		 724 aa  252  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0802  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 764 aa  249  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  30.22 
 
 		 706 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>