45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3627 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3627  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  371  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2314  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2807  hypothetical protein  88.46 
 
 		 182 aa  315  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0402  hypothetical protein  69.31 
 
 		 191 aa  266  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0242  hypothetical protein  77.56 
 
 		 186 aa  266  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0036  hypothetical protein  75 
 
 		 209 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0094  hypothetical protein  64.58 
 
 		 199 aa  261  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156875  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0708  hypothetical protein  65.79 
 
 		 192 aa  257  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0405  hypothetical protein  47.37 
 
 		 178 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1227  hypothetical protein  45.89 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0152651 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3484  hypothetical protein  44.97 
 
 		 227 aa  137  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3345  hypothetical protein  41.38 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0080  hypothetical protein  36.47 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0077  hypothetical protein  35.84 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4170  hypothetical protein  34.73 
 
 		 169 aa  111  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107472  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3069  putative signal peptide protein  33.89 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0091  hypothetical protein  36.3 
 
 		 167 aa  107  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5420  putative signal peptide protein  36.02 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0854015 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5961  hypothetical protein  32.57 
 
 		 164 aa  104  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.796791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4489  hypothetical protein  29.83 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3373  hypothetical protein  32.95 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299059  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1381  hypothetical protein  31.9 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4557  hypothetical protein  29.28 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38864  decreased coverage  0.00129383 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1364  hypothetical protein  34.87 
 
 		 169 aa  97.1  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.743667  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2504  hypothetical protein  31.87 
 
 		 175 aa  94.7  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.941504  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4048  hypothetical protein  28.33 
 
 		 169 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0267  hypothetical protein  36.22 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3725  hypothetical protein  31.51 
 
 		 169 aa  91.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3314  hypothetical protein  32.18 
 
 		 177 aa  90.9  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0051  hypothetical protein  33.08 
 
 		 176 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1383  hypothetical protein  33.08 
 
 		 176 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4507  hypothetical protein  29.88 
 
 		 241 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0042  hypothetical protein  32.33 
 
 		 176 aa  87.8  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1101  hypothetical protein  31.46 
 
 		 167 aa  85.1  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3015  hypothetical protein  32.56 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1697  putative signal peptide protein  31.1 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3291  hypothetical protein  29.44 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3614  hypothetical protein  29.44 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3491  hypothetical protein  28.24 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0268  hypothetical protein  31.01 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0027  hypothetical protein  28.75 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2793  hypothetical protein  26.25 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.577158 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0707  hypothetical protein  26.39 
 
 		 166 aa  52.8  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_002978  WD1065  hypothetical protein  25.5 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0282386  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0638  hypothetical protein  22.09 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2699  hypothetical protein  25.83 
 
 		 312 aa  43.5  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>