33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3412 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0932  hypothetical protein  74.73 
 
 		 563 aa  800    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0523701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0768  hypothetical protein  63.84 
 
 		 563 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3412  hypothetical protein  100 
 
 		 566 aa  1139    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1361  hypothetical protein  61.23 
 
 		 568 aa  635    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515582  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0948  hypothetical protein  56.01 
 
 		 571 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4538  hypothetical protein  58.79 
 
 		 540 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0865  hypothetical protein  57.24 
 
 		 564 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1306  hypothetical protein  33.7 
 
 		 617 aa  276  9e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7239  hypothetical protein  38.8 
 
 		 528 aa  250  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6052  hypothetical protein  37.16 
 
 		 546 aa  243  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157473  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0074  hypothetical protein  34.84 
 
 		 592 aa  232  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4284  conserved hypothetical proteinn  34.7 
 
 		 597 aa  227  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3606  hypothetical protein  34.29 
 
 		 646 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3898  hypothetical protein  34.05 
 
 		 647 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6670  hypothetical protein  33.92 
 
 		 590 aa  219  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3589  hypothetical protein  32.62 
 
 		 552 aa  211  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0075093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1905  hypothetical protein  30.83 
 
 		 423 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4270  hypothetical protein  27.86 
 
 		 528 aa  151  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2738  hypothetical protein  30.02 
 
 		 515 aa  150  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.22803  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0072  hypothetical protein  28.21 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387574  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0067  hypothetical protein  28.21 
 
 		 502 aa  145  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3723  hypothetical protein  28.94 
 
 		 505 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1085  hypothetical protein  27.17 
 
 		 537 aa  114  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.016915  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2706  hypothetical protein  28.29 
 
 		 467 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4529  hypothetical protein  27.84 
 
 		 420 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3308  hypothetical protein  27.22 
 
 		 511 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1489  hypothetical protein  25.91 
 
 		 451 aa  98.2  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4817  hypothetical protein  25 
 
 		 424 aa  97.8  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3610  hypothetical protein  26.15 
 
 		 513 aa  97.1  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0252  hypothetical protein  27.71 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05206  hypothetical protein  23.17 
 
 		 408 aa  48.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0459  hypothetical protein  23.33 
 
 		 398 aa  47.8  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001325  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsB  22.56 
 
 		 401 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.138283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>